EnglezăFrancezăSpaniolă

Ad


Favicon OnWorks

mipe2dbSTS - Online în cloud

Rulați mipe2dbSTS în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks prin Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS

Aceasta este comanda mipe2dbSTS care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS

PROGRAM:

NUME


mipe2dbSTS.pl - Generează fișierul de intrare pentru a fi trimis la dbSTS
incluse în ieșire: secțiunea STS a transmiterii dbSTS
bazat pe versiunea MIPE v1.1
argumente: * mipe_file
* fișier de configurare
* (opțional) listă de ID-uri PCR

Fișierul de configurare este format din linii care conțin o cheie și o valoare, separate printr-un semn egal ('=').
Cheia constă din numele minuscule al fișierului de trimitere NCBI (a se vedea site-ul web dbSTS), urmat de
o liniuță de subliniere și numele minuscule al câmpului din acel fișier.
Următoarele câmpuri ar trebui definite în fișierul de configurare:
pub_title=
pub_authors=
nume_sursă=
sursă_organism=
cont_name=
cont_fax=
cont_tel=
cont_email=
cont_lab=
cont_inst=
cont_addr=
protocol_name=
protocol_protocol=
buffer_name=
buffer_buffer=
sts_pcr_profile=
Pentru protocol_protocol, buffer_buffer și sts_pcr_profile, sunt necesare mai multe linii (vezi exemplul).

Un exemplu de fișier de configurare arată astfel:
pub_title=Cartarea genetică a SNP-urilor de pui
pub_authors=Aerts,JA; Veenendaal,T.; Crooijmans,RPMA; Groenen, MAM
source_name=ADN genomic de pui
source_organism=Gallus gallus
cont_name=Jan Aerts
cont_fax=+31 317 483929
cont_tel=+31 317 483397
cont_email=[e-mail protejat]
cont_lab=Grupul de creștere și genomică a animalelor
cont_inst=Universitatea din Wageningen
cont_addr=PO Box 338, 6700 AH Wageningen, Țările de Jos
protocol_name=Protocol_Aerts
protocol_protocol=Șablon: 30-60 ng
protocol_protocol=Primer: fiecare 4 uM
protocol_protocol=dNTPs: fiecare 200 uM
protocol_protocol=Taq: 0.3 unități
protocol_protocol=Volum: 12 ul
buffer_name=Buffer_Aerts
tampon_tampon = MgCI2: 1.5 mM
tampon_tampon=(NH4)2S4: 20 mM
tampon_tampon=Tris-HCI: 75 mM
buffer_buffer=Tween 20: 0.01% (g/v)
tampon_tampon=pH: 8.8

Utilizați mipe2dbSTS online folosind serviciile onworks.net


Servere și stații de lucru gratuite

Descărcați aplicații Windows și Linux

  • 1
    Phaser
    Phaser
    Phaser este o deschidere rapidă, gratuită și distractivă
    cadru de joc HTML5 sursă care oferă
    Redare WebGL și Canvas
    browsere web desktop și mobile. Jocuri
    poate fi co...
    Descărcați Phaser
  • 2
    Motor VASSAL
    Motor VASSAL
    VASSAL este un motor de joc pentru creare
    versiuni electronice ale plăcii tradiționale
    și jocuri de cărți. Oferă suport pentru
    redarea și interacțiunea pieselor de joc,
    și ...
    Descărcați VASSAL Engine
  • 3
    OpenPDF - Furk of iText
    OpenPDF - Furk of iText
    OpenPDF este o bibliotecă Java pentru creare
    și editarea fișierelor PDF cu un LGPL și
    Licență open source MPL. OpenPDF este
    Succesorul LGPL/MPL open source al iText,
    o ...
    Descărcați OpenPDF - Furk of iText
  • 4
    SAGA GIS
    SAGA GIS
    SAGA - Sistem pentru automatizare
    Analize Geoștiințifice - este un Geografic
    Sistemul informatic (GIS) software cu
    capacități imense pentru geodate
    procesare și ana...
    Descărcați SAGA GIS
  • 5
    Caseta de instrumente pentru Java/JTOpen
    Caseta de instrumente pentru Java/JTOpen
    IBM Toolbox for Java / JTOpen este un
    biblioteca de clase Java care acceptă
    programare client/server și internet
    modele către un sistem care rulează OS/400,
    i5/OS, o...
    Descărcați Toolbox pentru Java/JTOpen
  • 6
    D3.js
    D3.js
    D3.js (sau D3 pentru documente bazate pe date)
    este o bibliotecă JavaScript care vă permite
    pentru a produce date dinamice, interactive
    vizualizări în browsere web. Cu D3
    tu...
    Descărcați D3.js
  • Mai mult »

Comenzi Linux

Ad