GoGPT Best VPN GoSearch

Favicon OnWorks

TransDecoder.Predict - Online în cloud

Rulați TransDecoder.Predict în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks prin Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS

Aceasta este comanda TransDecoder.Predict care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS

PROGRAM:

NUME


Transdecoder - Transcriptome Protein Prediction

UTILIZARE


Necesar:

-t stenograme.fasta

Opțiuni comune:

--retain_long_orfs păstrează toate ORF-urile găsite care sunt egale sau mai lungi decât aceste multe nucleotide, chiar dacă nu există alte dovezi
îl marchează ca codare (implicit: 900 bp => 300aa)

--retain_pfam_hits /path/to/pfam_db.hmm pentru a căuta
folosind hmmscan (care ar trebui să fie accesibil prin setarea PATH)

--retain_blastp_hits

Opţiuni avansate

--tren Fișier FASTA cu ORF-uri pentru a antrena Markov Mod pentru identificarea proteinelor; in caz contrar
cele mai lungi ORF neredundante utilizate

-T Dacă nu --train, top cele mai lungi ORF pentru a antrena modelul Markov (statistici hexamer) (implicit: 500)

2015-12-28 TRANSDECODER.PREDICTOR(1)

Utilizați TransDecoder.Predict online folosind serviciile onworks.net


Servere și stații de lucru gratuite

Descărcați aplicații Windows și Linux

Comenzi Linux

Ad




×
publicitate
❤️Cumpără, rezervă sau cumpără aici — gratuit, contribuind la menținerea serviciilor gratuite.