wb_command - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

wb_command - program de linie de comandă pentru efectuarea unei varietăți de sarcini algoritmice folosind
date de volum, suprafață și ordonate de gri

REZUMAT

DESCRIERE

-add-to-spec-file ADĂUGAȚI UN FIȘIER LA UN FIȘIER DE SPECIFICAȚII

wb_command -add-to-spec-file

- fișierul de specificații la care se adaugă - structura
fișier de date - calea către fișier

Fișierul de specificații rezultat suprascrie fișierul de specificații existent.
Dacă spec

fișierul nu există, este creat cu metadate implicite.
Structura

argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-backend-average-dense-roi CONNECTOME DB BACKEND COMMAND PENTRU CIFTI ROI MEDIU DENSO

wb_command -backend-average-dense-roi

- listă separată prin virgulă de indici cifti la medie - dosar
pentru a scrie rândul mediu la

Probabil că această comandă nu este cea pe care o căutați, încercați
-cifti-medie-densa-roi. Este nevoie de lista de fișiere cifti de la care se face o medie
intrare standard și își scrie ieșirea ca little endian, întreg de 32 de biți cu dimensiunea rândului
urmat de rând ca floats pe 32 de biți.

-corelația-backend-media-roi COMANDA CONNECTOME DB BACKEND PENTRU ROI MEDIU CIFTI
CORELAȚIE

wb_command -corelația-backend-media-roi

- listă separată prin virgulă de indici cifti la medie și apoi

corela

- fișier în care să scrieți rândul mediu

Probabil că această comandă nu este cea pe care o căutați, încercați
-corelaţie-cifti-medie-roi. Este nevoie de lista de fișiere cifti de la care se face o medie
intrare standard și își scrie ieșirea ca little endian, întreg de 32 de biți cu dimensiunea rândului
urmat de rând ca floats pe 32 de biți.

-border-export-tabel-culori SCRIEȚI NUMELE ȘI CULORII BORGINEI CA TEXT

wb_command -border-export-tabel-culori

- fișierul chenar de intrare - output - fișierul text de ieșire

[-class-colors] - folosește culorile clasei în loc de culorile numelui

Preia numele și culorile fiecărui chenar și îl scrie în același format ca
-metric-label-import se asteapta. În mod implicit, chenarele sunt colorate după numele chenarului,
specifica -clasa-culori pentru a le colora în schimb după clasă. Valorile cheie încep de la 1
și urmați ordinea chenarelor din dosar.

-border-file-export-to-caret5 EXPORTĂ FIȘIER DE FRONTĂ ÎN FORMAT DE FIȘIER CARET5

wb_command -border-file-export-to-caret5

- dosar chenar banc de lucru - prefix pentru numele lui
ieșire caret5

fișiere border/borderproj/bordercolor

[-surface] - repetabil - specifică o suprafață de intrare

- un fișier de suprafață pentru deproiectarea chenarelor

Un fișier de chenar Workbench poate conține chenare pentru mai multe structuri și chenare
care sunt proiectate și neproiectate. Conține, de asemenea, un tabel de culori pentru
frontiere.

Caret5 are atât fișiere de frontieră (neproiectate) cât și fișiere de proiecție a frontierei (proiectate). În
În plus, fiecare chenar Caret5 sau fișier de proiecție a chenarului conține de obicei date pentru
o singură structură. Caret5 folosește, de asemenea, un fișier de culoare de chenar care asociază culori
cu numele graniţelor.

Această comandă va încerca să scoată atât fișierele de proiectare de margine Caret5, cât și de proiecție.
Fiecare chenar de ieșire/fișier de proiecție va conține date pentru o structură, deci
pot fi create multe fișiere. Numele structurii este inclus în numele lui
fiecare bordură sau fișier de proiecție a marginii care este creat.

Un fișier de culoare a marginii Caret5 va fi, de asemenea, produs de această comandă.

Furnizarea suprafețelor ca parametri de intrare este opțională, dar recomandată. Suprafeţe
poate fi necesar pentru a crea atât coordonatele proiectate, cât și/sau neproiectate ale granițelor.
Dacă există o eșec în producerea unei granițe de ieșire sau proiecție a graniței din cauza a
suprafață lipsă cu structura potrivită, va fi afișat un mesaj de eroare și
unele fișiere de ieșire nu vor fi create.

Când scrieți fișiere noi, această comandă va suprascrie un fișier cu același nume.

-border-merge FUNCȚI FIȘIERE DE FRONTIERĂ ÎNTR-UN FIȘIER NOU

wb_command -border-merge

- output - fișierul de margine de ieșire

[-border] - repetabil - specifică un fișier de chenar de intrare

- un fișier de borduri din care să folosiți chenarele

[-select] - repetabil - selectați un singur chenar de utilizat

- numărul de frontieră sau numele

[-up-to] - utilizați o gamă incluzivă de chenare

- numărul sau numele ultimei coloane de inclus

[-reverse] - utilizați intervalul în ordine inversă

Preia unul sau mai multe fișiere de chenar și creează un nou fișier de chenar din chenarele din
Le.

Exemplu: wb_command -border-merge în afara.graniţei -frontieră primul.granita -Selectați 1 -frontieră
a doua.granita

Acest exemplu ar lua primul chenar de la first.border, urmat de toate marginile
de la second.border și scrieți-le la out.border.

-border-resantionare RESAMPLONAȚI UN FIȘIER DE BORDERĂ LA O MARE DIFERITĂ

wb_command -border-resantionare

- fișierul de frontieră de reeșantionat - o suprafata sfera cu
plasa care este metrica

în prezent

- o suprafață sferă care este în registru cu

și are rețeaua de ieșire dorită

- output - fișierul de margine de ieșire

Reeșantionează un fișier chenar, având în vedere două suprafețe sferice care sunt în registru. Numai
vor fi reeșantionate granițele care au aceeași structură ca sfera curentă.

-border-to-rois FACEȚI ROIS METRIC DIN BORNIERE

wb_command -border-to-rois

- suprafata pe care sunt desenate chenarele - dosarul de frontieră
- ieșire - fișierul metric de ieșire

[-border] - creează rentabilitatea investiției pentru un singur chenar

- numele frontierei

[-inverse] - utilizați selecția inversă (în afara graniței)

În mod implicit, atrage rentabilitatea investiției în interiorul tuturor chenarelor din fișierul de chenar, ca măsurătoare separată
coloane.

-granita-la-vertice DESENAȚI BORNICHI CA VERTICURI ÎNTR-UN FIȘIER METRIC

wb_command -granita-la-vertice

- suprafata pe care sunt desenate chenarele - dosarul de frontieră
- ieșire - fișierul metric de ieșire

[-border] - creează rentabilitatea investiției pentru un singur chenar

- numele frontierei

Afișează o metrică cu 1 pe vârfuri care urmează o margine și 0 în altă parte. De
implicit, este creată o coloană de metrică separată pentru fiecare chenar.

-cifti-all-labels-to-rois FACEȚI ROIS DIN TOATE Etichetele într-o hartă cu etichete CIFTI

wb_command -cifti-all-labels-to-rois

- fișierul de etichetă cifti de intrare - numărul sau numele hărții etichetei
a folosi - output - fișierul cifti de ieșire

Fișierul cifti de ieșire are o coloană pentru fiecare etichetă din harta de intrare specificată, altele
decât ??? etichetă, fiecare dintre ele conține un ROI al tuturor coordonatelor creierului care sunt
setată la eticheta corespunzătoare.

-cifti-medie DOSARE MEDIE CIFTI

wb_command -cifti-medie

- ieșire - fișier cifti de ieșire

[-exclude-outliers] - exclude outliers prin abaterea standard a fiecăruia

element peste fișiere - numărul de abateri standard sub medie
la

include

- numărul de abateri standard peste medie până la

include

[-cifti] - repetabil - specifică un fișier de intrare

- fișierul cifti de intrare

[-weight] - dați o pondere pentru acest fișier

- greutatea de utilizat

Medii cifti fișiere împreună.
Fișiere fără -greutate sunt specificate

o greutate de 1.
If -excluderea-outliers este specificat, la fiecare element, cel

datele din toate fișierele sunt luate ca un set, media neponderată și standardul eșantionului
sunt găsite abateri și valori în afara numărului specificat de abateri standard
sunt excluse din media (potențial ponderată) la acel element.

-cifti-medie-densa-roi RANDURI CIFTI MEDIE PE SUBIECTE PE ROI

wb_command -cifti-medie-densa-roi

- ieșire - ieșire fișier cifti dscalar

[-cifti-roi] - fișier cifti care conține greutăți combinate

- dosarul roi cifti

[-in-memory] - memorează roi-ul în cache, astfel încât să nu fie recitit pentru

fiecare intrare cifti

[-left-roi] - greutăți de folosit pentru canepa stângă

- roiul din stânga ca fișier metric

[-right-roi] - greutăți de utilizat pentru canepa dreaptă

- roiul corect ca fișier metric

[-cerebellum-roi] - greutăți de utilizat pentru suprafața cerebelului

- cerebelul roi ca fișier metric

[-vol-roi] - greutăți voxel de utilizat

- fișierul de volum roi

[-left-area-surf] - specificați suprafața din stânga pentru corecția zonei vârfurilor

- pila de suprafata stanga

[-right-area-surf] - specificați suprafața potrivită pentru corecția zonei vârfurilor

- pila de suprafață potrivită

[-cerebellum-area-surf] - specificați suprafața cerebelului pentru zona vertexului

corecţie - pila de suprafata cerebelului

[-cifti] - repetabil - specifică un fișier cifti de intrare

- un fișier cifti pentru a media peste

Mediază rândurile pentru fiecare hartă a rentabilității investiției (ROI), în toate fișierele.
Hărțile ROI sunt

tratate ca funcții de ponderare, inclusiv valori negative.
Pentru

eficiență, asigurați-vă că tot ceea ce nu este destinat a fi utilizat este zero în
Harta ROI. Dacă -cifti-roi este specificat, -left-roi, -dreapta-roi, -cerebelul-roi și
-vol-roi nu trebuie specificate. Dacă sunt specificate mai multe fișiere ROI non-cifti,
trebuie să aibă același număr de coloane.

-corelaţie-cifti-medie-roi CORELAȚI MEDIA ROI CU TOATE RANDURI, APOI MEDIA PE CARE
SUBIECTE

wb_command -corelaţie-cifti-medie-roi

- ieșire - fișier cifti de ieșire

[-cifti-roi] - fișier cifti care conține greutăți combinate

- dosarul roi cifti

[-in-memory] - memorează roi-ul în cache, astfel încât să nu fie recitit pentru

fiecare intrare cifti

[-left-roi] - greutăți de folosit pentru canepa stângă

- roiul din stânga ca fișier metric

[-right-roi] - greutăți de utilizat pentru canepa dreaptă

- roiul corect ca fișier metric

[-cerebellum-roi] - greutăți de utilizat pentru suprafața cerebelului

- cerebelul roi ca fișier metric

[-vol-roi] - greutăți voxel de utilizat

- fișierul de volum roi

[-left-area-surf] - specificați suprafața din stânga pentru corecția zonei vârfurilor

- pila de suprafata stanga

[-right-area-surf] - specificați suprafața potrivită pentru corecția zonei vârfurilor

- pila de suprafață potrivită

[-cerebellum-area-surf] - specificați suprafața cerebelului pentru zona vertexului

corecţie - pila de suprafata cerebelului

[-cifti] - repetabil - specifică un fișier cifti de intrare

- un fișier cifti pentru a media peste

Rândurile medii pentru fiecare hartă a rentabilității investiției (ROI) iau corelația dintre fiecare medie a rentabilității investiției
la restul rândurilor din același fișier, apoi face media rezultatelor pentru toate
fișiere. ROI-urile sunt întotdeauna tratate ca funcții de ponderare, inclusiv valori negative.
Pentru eficiență, asigurați-vă că tot ceea ce nu este destinat a fi utilizat este zero in
harta ROI. Dacă -cifti-roi este specificat, -left-roi, -dreapta-roi, -cerebelul-roi,
și -vol-roi nu trebuie specificate. Dacă sunt specificate mai multe fișiere ROI non-cifti,
trebuie să aibă același număr de coloane.

-cifti-change-timestep SCHIMBAȚI TIMESTEP UNUI DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-change-timestep

- fișierul cifti de modificat

[-row-timestep] - setați intervalul de timp de-a lungul rândurilor

- secunde pe pas de timp

[-column-timestep] - setați intervalul de timp de-a lungul coloanelor

- secunde pe pas de timp

Avertizează dacă o dimensiune specificată nu este puncte de timp, în caz contrar modifică intervalul de timp,
și în cele din urmă scrie rezultatul în același nume de fișier dacă au fost modificate dimensiuni.
NOTĂ: probabil că vrei -rând-pas de timp, deoarece se potrivește cu .dtseries.nii
specificație. Cealaltă opțiune este disponibilă doar pentru a fi completă.

-cifti-convertit DUMP CIFTI MATRIX ÎN ALTE FORMATATE

wb_command -cifti-convertit

[-to-gifti-ext] - convertiți în binar extern GIFTI

- fișierul cifti de intrare - output - fișierul gifti de ieșire

[-from-gifti-ext] - convertiți un GIFTI realizat cu această comandă înapoi în a

CIFTI - fisierul de intrare gifti - output - output cifti
fişier

[-reset-timepoints] - resetați maparea de-a lungul rândurilor la puncte de timp,

luând lungime din dosarul gifti - timpul dorit între cadre
- decalajul temporal dorit al cadrului inițial

[-unitate] - folosește o altă unitate decât timpul

- identificatorul unității (implicit SECOND)

[-reset-scalars] - resetează maparea de-a lungul rândurilor la scalari, luând lungimea

din dosarul gifti

[-replace-binary] - înlocuiți datele cu un fișier binar

- fișierul binar care conține date de înlocuire

[-flip-endian] - schimbă de octeți fișierul binar

[-transpose] - transpune fișierul binar

[-to-nifti] - convertiți în NIFTI1

- fișierul cifti de intrare - output - fișierul nifti de ieșire

[-from-nifti] - convertiți înapoi un fișier NIFTI (1 sau 2) realizat cu această comandă

în CIFTI - fișierul nifti de intrare - un dosar cifti cu
dimensiunea(ele) și maparea(ele)

care ar trebui folosit

- output - fișierul cifti de ieșire

[-reset-timepoints] - resetați maparea de-a lungul rândurilor la puncte de timp,

luând lungime din dosarul nifti - timpul dorit între cadre
- decalajul temporal dorit al cadrului inițial

[-unitate] - folosește o altă unitate decât timpul

- identificatorul unității (implicit SECOND)

[-reset-scalars] - resetează maparea de-a lungul rândurilor la scalari, luând lungimea

din dosarul nifti

[-to-text] - convertiți într-un fișier text simplu

- fișierul cifti de intrare - output - fișierul text de ieșire

[-col-delim] - alegeți șirul pentru a pune între elemente într-un rând

- șirul de utilizat (implicit este un caracter tabulator)

[-from-text] - convertiți din text simplu în cifti

- fișierul text de intrare - un dosar cifti cu
dimensiune(e) și mapare(e)

care ar trebui folosit

- output - fișierul cifti de ieșire

[-col-delim] - specificați șirul care se află între elementele dintr-un rând

- șirul de utilizat (implicit este orice spațiu alb)

[-reset-timepoints] - resetați maparea de-a lungul rândurilor la puncte de timp,

luând lungime din fișierul text - timpul dorit între cadre
- decalajul temporal dorit al cadrului inițial

[-unitate] - folosește o altă unitate decât timpul

- identificatorul unității (implicit SECOND)

[-reset-scalars] - resetează maparea de-a lungul rândurilor la scalari, luând lungimea

din fișierul text

Această comandă este utilizată pentru a converti o matrice CIFTI completă în/din formate care pot fi
folosit de programe care nu înțeleg CIFTI. Dacă vrei să scrii un existent
Fișierul CIFTI cu o altă versiune CIFTI, vezi -fișier-conversie, si este
-cifti-versiune-conversie opțiune. Dacă doriți o parte a fișierului CIFTI ca măsurătoare,
etichetă sau fișier de volum, vezi -cifti-separate. Dacă doriți să creați un fișier CIFTI
din fișierele de metrice și/sau de volum, consultați -cifti-create-* comenzi. Trebuie
specifica exact unul dintre -la-cadou-ext, -din-gifti-ext, -to-nifti, -din-nifti,
-la text, -din-text. -transpune opțiunea pentru -din-gifti-ext este necesar dacă
fișierul binar de înlocuire este în ordinea majoră a coloanelor. The -unitate opțiunile acceptă acestea
valori:

AL DOILEA HERTZ METRUL RADIAN

-cifti-convertit-la-scalar SCHIMBAȚI O DIMENSIUNE CIFTI ÎN HĂRȚI SCALARE DENUMITE

wb_command -cifti-convertit-la-scalar

- fișier de intrare cifti - ce mapare să se schimbe în hărți scalare,
RÂND sau COLANĂ - ieșire - fișier cifti de ieșire

[-name-file] - specificați numele pentru hărți

- fișier text care conține numele hărților, câte unul pe linie

Creează un nou fișier cifti cu aceleași date ca și intrarea, dar cu unul dintre
dimensiunile setate să conțină șiruri de caractere care identifică fiecare hartă. Specificarea ROW va
convertiți un fișier dtseries într-un fișier dscalar.

-cifti-copy-mapping ÎNLOCUIȚI HARTĂ PE UN FIȘIER CIFTI

wb_command -cifti-copy-mapping

- fișierul cifti din care se utilizează datele - care direcție
pe pentru a înlocui maparea - un fișier cifti care conține
maparea dorită - în ce direcție a folosi
cartografiere

de la

- output - fișierul cifti de ieșire

trebuie să aibă aceeași lungime de-a lungul direcției de înlocuire ca
are de-a lungul direcției șablonului. Fiecare argument de direcție trebuie să fie
fie RÂND, fie COLONĂ.

-cifti-corelare GENERAȚI CORELAREA RANDURILOR ÎNTR-UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-corelare

- fișier de intrare cifti - ieșire - fișier cifti de ieșire

[-roi-override] - realizează corelarea dintr-un subset de rânduri la toate rândurile

[-left-roi] - folosește un roi pentru canepa stângă

- roiul din stânga ca fișier metric

[-right-roi] - folosește un roi pentru canepa dreaptă

- roiul corect ca fișier metric

[-cerebellum-roi] - folosește un roi pentru cerebel

- cerebelul roi ca fișier metric

[-vol-roi] - folosește un roi pentru volum

- fișierul volum roi

[-cifti-roi] - utilizați un fișier cifti pentru rois combinat

- dosarul cifti roi

[-ponderi] - specificați ponderile coloanei

- fișier text care conține o greutate pe coloană

[-fisher-z] - aplică transformarea Fisher Small z (adică, artanh) la corelație

[-no-demean] - în loc de corelare, atunci faceți produsul punctual al rândurilor

normalizați prin diagonală

[-covariance] - calculează covarianța în loc de corelație

[-mem-limit] - restricționează utilizarea memoriei

- limita de memorie în gigabytes

Pentru fiecare rând (sau fiecare rând din interiorul unui roi dacă -roi-override este specificat), se corelează
la toate celelalte rânduri. The -cifti-roi subopțiune la -roi-override poate să nu fie specificat
cu orice altă subopțiune -*-roi, dar puteți specifica celelalte subopțiuni -*-roi
împreună.

Când utilizați -fisher-z opțiunea, rezultatul NU este un scor Z, este artanh(r), to
faceți mai multe calcule pe această ieșire, luați în considerare utilizarea -cifti-matematică.

Restricționarea utilizării memoriei va face ca rezultatul să fie calculat în bucăți și dacă
dimensiunea fișierului de intrare este mai mare de 70% din limita de memorie, de asemenea, va citi
fișierul de intrare ca rânduri este necesar, rezultând mai multe treceri prin intrare
fișier (o dată pe bucată). Limita de memorie nu trebuie să fie un număr întreg, de asemenea, puteți
specificați 0 pentru a calcula un singur rând de ieșire la un moment dat (acest lucru poate fi foarte lent).

-cifti-corelație-gradient CORELATI RANDURI CIFTI SI LUATI GRADIENT

wb_command -cifti-corelație-gradient

- intrarea cifti - output - output cifti

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-left-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața stângă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-right-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața dreaptă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-cerebellum-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de

calculându-le de la suprafața cerebelului - vârful corectat
zone, ca metrică

[-surface-presmooth] - neteziți pe suprafață înainte de a calcula

gradient - sigma pentru netezirea suprafeţei gaussiene

miez, în mm

[-volume-presmooth] - netezește volumul înainte de a calcula gradientul

- sigma pentru nucleul gaussian de netezire a volumului,

în mm

[-undo-fisher-z] - se aplică transformarea inversă Fisher Small z la

intrare

[-fisher-z] - se aplică transformarea Fisher Small z la corelații

înainte de a lua panta

[-surface-exclude] - exclude vârfurile din apropierea fiecărui vârf de semințe din

calcul - distanța geodezică de la vârful semințelor pentru excludere

zona, în mm

[-volume-exclude] - exclude voxelii din apropierea fiecărui voxel de bază de la calcul

- distanța față de voxelul semințelor pentru zona de excludere, în mm

[-covariance] - calculează covarianța în loc de corelație

[-mem-limit] - restricționează utilizarea memoriei

- limita de memorie în gigabytes

Pentru fiecare structură, calculați corelația rândurilor din structură și luați
gradienții rândurilor rezultate, apoi media lor. Limita de memorie nu are nevoie
pentru a fi un număr întreg, puteți specifica, de asemenea, 0 pentru a utiliza cât mai puțină memorie posibil (acest
poate fi foarte lent).

-cifti-create-dens-din-şablon CREAȚI CIFTI CU HARTĂ DENSA CU POATE

wb_command -cifti-create-dens-din-şablon

- fișier pentru a se potrivi cu coordonatele creierului - ieșire - the
fișier cifti de ieșire

[-series] - faceți un fișier dtseries în loc de un dscalar

- increment între punctele seriei - valoarea de început a seriei

[-unitate] - selectați unitatea pentru serie (secunda implicită)

- identificatorul unității

[-volume-all] - specificați un fișier de volum de intrare pentru toate datele voxel

- fișierul volumului de intrare

[-from-cropped] - intrarea este decupată la dimensiunea datelor voxel

în fișierul șablon

[-cifti] - repetabil - folosește datele de intrare dintr-un fișier cifti

- fișier cifti care conține date de intrare

[-metric] - repetabil - folosește datele de intrare dintr-un fișier de metrică

- în ce structură să puneți fișierul metric - intrare
fișier metric

[-label] - repetabil - folosește datele de intrare din fișierele de etichete de suprafață

- în ce structură să puneți fișierul etichetă - etichetă de intrare
fişier

[-volum] - repetabil - utilizați un fișier de volum pentru un singur volum

datele structurii - în ce structură să puneți fișierul de volum
- fișierul volumului de intrare

[-from-cropped] - intrarea este decupată la dimensiunea volumului

structura

Această comandă vă ajută să creați un nou fișier dscalar, dtseries sau dlabel cifti care
se potrivește cu spațiul de coordonare a creierului utilizat într-un alt fișier cifti. Fișierul șablon trebuie
au spațiul dorit de coordonare a creierului în mapare de-a lungul direcției coloanei (pentru
dtseries, dscalar, dlabel și simetric dconn acesta este întotdeauna cazul). Toate intrările
Fișierele cifti trebuie să aibă un model de creier care se mapează de-a lungul coloanei și să utilizeze același volum
spațiul și/sau vârful suprafeței contează ca șablon pentru structurile pe care le conțin.
Dacă orice fișier de intrare conține date de etichetă, atunci fișierele de intrare cu date fără etichetă nu sunt
permis, iar -serie opțiunea nu poate fi utilizată.

Orice structură care nu este acoperită de o intrare este umplută cu zerouri sau fără etichetă
cheie.

The argument de -metric, -eticheta or -volum trebuie să fie unul dintre
Următor:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Argumentul pentru -unitate trebuie să fie unul dintre următoarele:

AL DOILEA HERTZ METRUL RADIAN

-cifti-crea-dens-scalar CREAȚI UN FIȘIER SCALAR CIFTI DENSE

wb_command -cifti-crea-dens-scalar

- output - fișierul cifti de ieșire

[-volum] - componenta de volum

- fișier de volum care conține toate datele voxel pentru tot volumul

structurile

- fișier de volum de etichete care conține etichete pentru cifti

structurile

[-left-metric] - metric pentru suprafața stângă

- fișierul metric

[-roi-left] - roiul vârfurilor de utilizat de la suprafața stângă

- ROI ca fișier metric

[-right-metric] - metrica pentru suprafața stângă

- fișierul metric

[-roi-right] - roiul vârfurilor de utilizat de la suprafața dreaptă

- ROI ca fișier metric

[-cerebellum-metric] - metrica pentru cerebel

- fișierul metric

[-roi-cerebellum] - roi de vârfuri de utilizat de la suprafața dreaptă

- ROI ca fișier metric

Toate fișierele de intrare trebuie să aibă același număr de coloane/subvolume.
Numai

componentele specificate vor fi în cifti de ieșire.
Numele hărților vor fi

preluat dintr-unul dintre fișierele de intrare.
Cel puțin o componentă trebuie să fie

specificat.
Volumul etichetei ar trebui să aibă unele dintre numele de etichetă de la

această listă, toate celelalte nume de etichetă vor fi ignorate:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-creează-serii-temporale dense CREAȚI O SERIE CIFTI DENSA

wb_command -cifti-creează-serii-temporale dense

- output - fișierul cifti de ieșire

[-volum] - componenta de volum

- fișier de volum care conține toate datele voxel pentru tot volumul

structurile

- fișier de volum de etichete care conține etichete pentru cifti

structurile

[-left-metric] - metric pentru suprafața stângă

- fișierul metric

[-roi-left] - roiul vârfurilor de utilizat de la suprafața stângă

- ROI ca fișier metric

[-right-metric] - metrica pentru suprafața stângă

- fișierul metric

[-roi-right] - roiul vârfurilor de utilizat de la suprafața dreaptă

- ROI ca fișier metric

[-cerebellum-metric] - metrica pentru cerebel

- fișierul metric

[-roi-cerebellum] - roi de vârfuri de utilizat de la suprafața dreaptă

- ROI ca fișier metric

[-timestep] - setați intervalul de timp

- intervalul de timp, în secunde (implicit 1.0)

[-timestart] - setați ora de începere

- timpul de la primul cadru, în secunde (implicit 0.0)

[-unitate] - folosește o altă unitate decât timpul

- identificatorul unității (implicit SECOND)

Toate fișierele de intrare trebuie să aibă același număr de coloane/subvolume.
Numai

componentele specificate vor fi în cifti de ieșire.
Cel puțin unul

trebuie specificată componenta.
Volumul etichetei ar trebui să aibă o parte din

nume de etichetă din această listă, toate celelalte nume de etichetă vor fi ignorate:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-unitate opțiunea acceptă aceste valori:

AL DOILEA HERTZ METRUL RADIAN

-cifti-create-label CREAȚI UN FIȘIER DE ETICĂ CIFTI

wb_command -cifti-create-label

- output - fișierul cifti de ieșire

[-volum] - componenta de volum

- fișier de volum care conține datele etichetei - eticheta
fișier de volum cu nume de structură cifti la

definiți parcelele de volum

[-left-label] - fișier de etichetă pentru suprafața stângă

- fisierul de etichete

[-roi-left] - roiul vârfurilor de utilizat de la suprafața stângă

- ROI ca fișier metric

[-right-label] - etichetă pentru suprafața stângă

- fisierul de etichete

[-roi-right] - roiul vârfurilor de utilizat de la suprafața dreaptă

- ROI ca fișier metric

[-cerebellum-label] - etichetă pentru cerebel

- fisierul de etichete

[-roi-cerebellum] - roi de vârfuri de utilizat de la suprafața dreaptă

- ROI ca fișier metric

Toate fișierele de intrare trebuie să aibă același număr de coloane/subvolume.
Numai

componentele specificate vor fi în cifti de ieșire.
Cel puțin unul

trebuie specificată componenta.

-volum opțiunea de a -cifti-create-label necesită două argumente de volum, the
Argumentul label-volume conține toate etichetele pe care doriți să le afișați (de exemplu, nucleele
talamus), în timp ce argumentul parcelă-volum include toate structurile CIFTI pe tine
doriți să includeți date în (de ex. THALAMUS_LEFT, THALAMUS_RIGHT). Dacă vrei doar
etichetele din voxeli să fie numele structurii, puteți folosi același fișier pentru ambele
argumente. Volumul coletului trebuie să folosească unele dintre numele etichetelor din această listă, toate
alte nume de etichetă din volumul parcelei vor fi ignorate:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-crea-se-scalară IMPORTAȚI DATE DE SERIE ÎN CIFTI

wb_command -cifti-crea-se-scalară

- fișier de intrare - ieșire - fișier cifti de ieșire

[-transpose] - se folosește dacă rândurile fișierului text sunt de-a lungul scalarului

dimensiune

[-name-file] - utilizați un fișier text pentru a seta nume pe dimensiunea scalară

- fișier text care conține nume, câte unul pe linie

[-serie] - setează unitățile și valorile seriei

- unitatea de utilizat - valoarea la primul punct de serie - cel
intervalul dintre punctele seriei

Convertiți un fișier text care conține serii de lungime egală într-un fișier cifti. Textul
fișierul ar trebui să aibă linii formate din numere separate prin spații albe, fără suplimentar
linii noi între rânduri.

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

AL DOILEA HERTZ METRUL RADIAN

-cifti-corelație încrucișată CORELAȚI UN DOSAR CIFTI CU ALTUL DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-corelație încrucișată

- primul fișier cifti de intrare - al doilea fișier cifti de intrare
- ieșire - fișier cifti de ieșire

[-ponderi] - specificați ponderile coloanei

- fișier text care conține o greutate pe coloană

[-fisher-z] - aplică transformarea Fisher Small z (adică, artanh) la corelație

[-mem-limit] - restricționează utilizarea memoriei

- limita de memorie în gigabytes

Corelează fiecare rând în cu fiecare rând în .


cartografiere de-a lungul coloanelor în devine maparea de-a lungul rândurilor din ieșire.

Când utilizați -fisher-z opțiunea, rezultatul NU este un scor Z, este artanh(r), to
faceți mai multe calcule pe această ieșire, luați în considerare utilizarea -cifti-matematică.

Restricționarea utilizării memoriei va face ca rezultatul să fie calculat în bucăți, prin
citind de mai multe ori.

-cifti-dilata DILATĂ UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-dilata

- fișierul cifti de intrare - ce dimensiune să se dilate,
RÂND sau COLANĂ - distanta de dilatare pe suprafete, in mm
- distanta de dilatare in volum, in mm -
output - fișierul cifti de ieșire

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-left-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața stângă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-right-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața dreaptă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-cerebellum-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de

calculându-le de la suprafața cerebelului - vârful corectat
zone, ca metrică

[-bad-brainordinate-roi] - specificați un roi de brainordinates de suprascris,

mai degrabă decât zerouri - fisier cifti dscalar sau dtseries, valori pozitive
denota

coordonatele creierului să li se înlocuiască valorile

[-nearest] - utilizați cea mai apropiată valoare atunci când dilați datele care nu sunt etichetate

[-merged-volume] - tratează componentele de volum ca și cum ar fi un singur

component

Pentru toate valorile de date desemnate ca rele, dacă se învecinează cu o valoare bună sau sunt în interior
distanța specificată a unei valori bune în același tip de model, înlocuiți valoarea
cu o medie ponderată la distanță a valorilor bune din apropiere, altfel setați valoarea la
zero. Dacă - cel mai apropiat este specificat, va folosi valoarea de la cea mai apropiată valoare a bunului
în interval în loc de o medie ponderată.

.Opțiunile -*-zone-corectate sunt destinate dilatarii în medie a grupului
suprafețe, dar este doar o corecție aproximativă pentru reducerea structurii
într-o suprafață medie de grup.

If -bad-brainordinate-roi este specificat, toate valorile, inclusiv cele cu valoare
zero, sunt bune, cu excepția locațiilor cu o valoare pozitivă în ROI. Dacă este
nu sunt specificate, numai valorile egale cu zero sunt proaste.

-cifti-estimare-fwhm ESTIMARE FWHM NETEZEA UNUI DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-estimare-fwhm

- fișierul cifti de intrare

[-merged-volume] - tratează componentele de volum ca și cum ar fi un singur

component

[-coloană] - numai estimări de ieșire pentru o coloană

- numărul coloanei

[-surface] - repetabil - specifică o suprafață de intrare

- pentru ce structura sa folosesti aceasta suprafata - pila de suprafata

Estimați netezimea componentelor fișierului cifti, imprimând estimările
la ieșirea standard. Dacă -volum-imbinat este folosit, toți voxelii sunt folosiți ca un singur
componentă, mai degrabă decât separate prin structură.

trebuie să fie unul dintre următoarele:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-export-dens-mapping SCRIEȚI INDEX LA CARTAREA ELEMENTULUI CA TEXT

wb_command -cifti-export-dens-mapping

- dosarul cifti - din ce direcție să exportați maparea,
RÂND sau COLANĂ

[-volume-all] - exportă maparea tuturor voxelilor

- output - fișierul text de ieșire

[-no-cifti-index] - nu scrieți indexul cifti în fișierul de ieșire

[-structure] - scrieți structura căreia îi aparține fiecare voxel în ieșire

fişier

[-surface] - repetabil - exportă maparea unei structuri de suprafață

- structura de ieșire - output - fișierul text de ieșire

[-no-cifti-index] - nu scrieți indexul cifti în fișierul de ieșire

[-volum] - repetabil - exportă maparea unei structuri de volum

- structura de ieșire - output - fișierul text de ieșire

[-no-cifti-index] - nu scrieți indexul cifti în fișierul de ieșire

Această comandă produce fișiere text care descriu maparea de la indicii cifti la
vârfuri de suprafață sau voxeli. Toți indicii sunt bazați pe zero. Formatul implicit pentru
-suprafaţă este linii de forma:



Formatul implicit pentru -volum și -volum-toate este linii de forma:



-cifti-extrema GĂSIȚI EXTREMA ÎNTR-UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-extrema

- intrarea cifti - distanta minima dintre extreme
de acelasi

tip, pentru componente de suprafață

- distanta minima dintre extremele acestuia

tip, pentru componente de volum

- ce dimensiune să găsească extrema de-a lungul, RÂND sau COLANĂ -
output - output cifti

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-surface-presmooth] - netezește la suprafață înainte de a găsi extreme

- sigma pentru netezirea suprafeţei gaussiene

miez, în mm

[-volume-presmooth] - netezi componentele de volum înainte de a găsi extreme

- sigma pentru nucleul gaussian de netezire a volumului,

în mm

[-threshold] - ignora extremele mici

- cea mai mare valoare de luat în considerare pentru a fi minimă - cel mai mic
valoare de luat în considerare pentru a fi un maxim

[-merged-volume] - tratează componentele de volum ca și cum ar fi un singur

component

[-sum-maps] - scoateți suma hărților extreme în locul fiecărei hărți

separat

[-consolidate-mode] - utilizați consolidarea minimelor locale în loc de a

cartier mare

[-only-maxima] - găsiți doar maximele

[-only-minima] - găsiți doar minimele

Găsește locații spațiale într-un fișier cifti care au valori mai extreme decât toate
locații apropiate din aceeași componentă (structură de suprafață sau de volum). Intrarea
fișierul cifti trebuie să aibă un model de creier care se cartografiază de-a lungul direcției specificate. COLOANĂ
este direcția care funcționează pe dtseries și dscalar. Pentru dconn, dacă este simetric
utilizați COLUMN, în caz contrar utilizați ROW.

-cifti-fals-corelare COMPARAȚI CORELAȚIA LOCAL ȘI ÎN/PRIN SULCI/GYRI

wb_command -cifti-fals-corelare

- fisierul cifti de utilizat pentru corelare <3D-dist> - distanta maxima 3D
pentru a verifica în jurul fiecărui vârf - distanta geodezica maxima de utilizat pentru
vecin

corelație

- distanta geodezica minima de utilizat pentru vecini

corelație

- output - fișierul cifti dscalar de ieșire

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-dump-text] - descărcați măsurile brute utilizate într-un fișier text

- fișierul text de ieșire

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-dump-text] - descărcați măsurile brute utilizate într-un fișier text

- fișierul text de ieșire

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-dump-text] - descărcați măsurile brute utilizate într-un fișier text

- fișierul text de ieșire

Pentru fiecare vârf, calculați corelația medie într-un interval de geodezică
distante care nu traverseaza un sulcus/girus, si corelarea cu cel mai apropiat
vârf care traversează un sulcus/gyrus. Se consideră că un vârf traversează un sulcus/girus dacă
distanța 3D este mai mică de o treime din distanța geodezică. Fișierul de ieșire
conține raportul dintre aceste corelații și câteva hărți suplimentare de ajutor
explica raportul.

-cifti-găsește-clustere FILTRAȚI CLUSTELE DUPĂ ZONA/VOLUM

wb_command -cifti-găsește-clustere

- intrarea cifti - prag pentru datele de suprafață
valorile - pragul pentru suprafața clusterului, în mm^2
- prag pentru valorile datelor de volum -
pragul pentru dimensiunea grupului de volum, în mm^3 - pentru ce dimensiune să folosiți
informații spațiale, ROW sau

COLOANA

- output - output cifti

[-mai puțin decât] - găsiți valori mai mici decât , Decat

mai mare

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

de la suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

de la suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

de la suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-cifti-roi] - căutați numai în regiunile de interes

- regiunile în care se caută, ca fișier cifti

[-merged-volume] - tratează componentele de volum ca și cum ar fi un singur

component

[-size-ratio] - ignoră grupurile mai mici decât o anumită fracțiune a

cel mai mare cluster din structură - fracțiunea structurii
cea mai mare zonă de cluster - fracțiunea celui mai mare cluster al structurii
volum

[-distanță] - ignoră grupurile aflate la o distanță dată de

cel mai mare cluster din structură - cât de departe de cel mai mare
cluster un cluster poate

fi, muchie la muchie, în mm

- cât de departe de cel mai mare cluster poate fi un cluster,

margine la margine, în mm

[-start] - începe etichetarea clusterelor de la o altă valoare decât 1

- valoarea de dat primul cluster găsit

Produce un fișier cifti cu numere întregi diferite de zero pentru toate coordonatele creierului dintr-o dimensiune mare
suficient cluster și zerouri în altă parte. Numerele întregi denotă apartenența la cluster (de la
implicit, primul cluster găsit va folosi valoarea 1, al doilea cluster 2 etc). Intrarea
fisierul cifti trebuie sa aiba un model de creier mapare pe dimensiunea aleasa, coloane pt
.dtseries și fie pentru .dconn. Rentabilitatea investiției ar trebui să aibă un model de creier care se cartografiază
coloane, potrivindu-se exact cu maparea direcției alese din fișierul de intrare.
Datele din afara ROI sunt ignorate.

-cifti-gradient LUATĂ GRADIENTUL UNUI DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-gradient

- intrarea cifti - ce dimensiune să ia de-a lungul gradientului,
RÂND sau COLANĂ - output - output cifti

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-left-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața stângă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-right-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața dreaptă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-cerebellum-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de

calculându-le de la suprafața cerebelului - vârful corectat
zone, ca metrică

[-surface-presmooth] - neteziți pe suprafață înainte de a calcula

gradient - sigma pentru netezirea suprafeţei gaussiene

miez, în mm

[-volume-presmooth] - netezește pe suprafață înainte de a calcula gradientul

- sigma pentru nucleul gaussian de netezire a volumului,

în mm

[-average-output] - scoate media hărților de magnitudine a gradientului

în loc de fiecare hartă cu gradient separat

[-vectors] - vectori gradient de ieșire

- ieșire - vectorii, ca fișier dscalar

Efectuează calculul gradientului pentru fiecare componentă a fișierului cifti și, opțional
face media gradientelor rezultate. The -vectori și -ieșire-medie opțiunile s-ar putea să nu
fi utilizate împreună. Trebuie să specificați o suprafață pentru fiecare structură de suprafață din
dosar cifti. Direcția COLUMN ar trebui să fie mai rapidă și este direcția care funcționează
pe dtseries. Pentru dconn, probabil că doriți ROW, cu excepția cazului în care îl utilizați
-ieșire-medie.

-cifti-eticheta-adiacenta FACEȚI MATRIZA DE ADJACENTĂ A UNUI FIȘIER DE ETICĂ CIFTI

wb_command -cifti-eticheta-adiacenta

- fișierul de etichetă cifti de intrare - output - output cifti
matricea de adiacență pconn

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

Găsiți voxeli adiacente față și vârfuri conectate care au valori de etichetă diferite,
și numărați-le pentru fiecare pereche. Puneți numărul rezultat într-o parcelă
fișier de conectivitate, diagonala fiind zero. Aceasta oferă o estimare aproximativă a
cât de lungă sau de extinsă este granița dintre două etichete.

-cifti-label-export-table EXPORT LABEL TABEL DIN CIFTI CA TEXT

wb_command -cifti-label-export-table

- fișierul de etichetă cifti de intrare - numărul sau numele hărții etichetei
a folosi - output - fișierul text de ieșire

Preia tabelul de etichete din harta de etichete cifti și îl scrie într-un format text
potrivindu-se cu ceea ce se asteapta de -cifti-label-import.

-cifti-label-import FACEȚI UN FIȘIER CIFTI LABEL DIN UN FIȘIER CIFTI

wb_command -cifti-label-import

- fișierul cifti de intrare - fișier text care conține valorile
și nume pentru etichete - output - fișierul de etichetă cifti de ieșire

[-discard-others] - setați orice valori care nu sunt menționate în lista de etichete la

??? eticheta

[-unlabeled-value] - setați valoarea care va fi interpretată ca neetichetată

- valoarea numerică pentru neetichetat (implicit 0)

[-drop-unused-labels] - eliminați orice valoare de etichetă neutilizată din etichetă

tabel

Creează un fișier de etichetă cifti dintr-un fișier cifti cu valori asemănătoare etichetei.
Tu

poate specifica șirul gol ('' va funcționa pe linux/mac) pentru ,
care va fi tratat ca și cum ar fi un fișier gol. Fișierul cu lista de etichete trebuie să aibă
linii cu următorul format:



Nu specificați cheia „fără etichetă” în fișier, se presupune că 0 înseamnă că nu
etichetat dacă nu -valoare-neetichetată este specificat. Numele etichetelor trebuie să fie separat
linie, dar poate conține spații sau alte caractere neobișnuite (dar nu linie nouă).
Spațiile albe sunt tăiate de la ambele capete ale numelui etichetei, dar sunt păstrate dacă se află în
mijlocul unei etichete. Valorile roșu, verde, albastru și alfa trebuie să fie numere întregi din
de la 0 la 255 și va specifica culoarea în care este desenată eticheta (alfa de 255 înseamnă
opac, care este probabil ceea ce doriți). În mod implicit, va seta noi nume de etichetă
cu nume de LABEL_# pentru orice valori întâlnite care nu sunt menționate în listă
fisier, precizati -arunca-altii pentru a le seta în schimb la cheia „fără etichetă”.

-cifti-label-to-roi FĂ O ETICĂ CIFTI ÎNTR-UN ROI

wb_command -cifti-label-to-roi

- fișierul de etichetă cifti de intrare - output - output cifti
fișier scalar

[-name] - selectați eticheta după nume

- numele etichetei pentru care doriți să obțineți un roi

[-key] - selectați etichetă după tastă

- cheia de etichetă pentru care doriți un roi

[-map] - selectați o singură hartă de etichetă de utilizat

- numărul sau numele hărții

Pentru fiecare hartă în , este creată o hartă în unde toate locațiile
etichetat cu sau cu o cheie de li se acordă valoarea 1 și
toate celelalte locații sunt date 0. Exact una dintre -Yam și -cheie trebuie specificat.
Specifica -Hartă pentru a folosi o singură hartă din .

-cifti-matematică EVALUAȚI EXPRESIA PE DOSARE CIFTI

wb_command -cifti-matematică

- expresia a evalua, între ghilimele - ieșire - the
fișier cifti de ieșire

[-fixnan] - înlocuiți rezultatele NaN cu o valoare

- valoarea cu care se înlocuiește NaN

[-override-mapping-check] - nu verificați compatibilitatea mapărilor,

verifica doar lungimea

[-var] - repetabil - un fișier cifti de utilizat ca variabilă

- numele variabilei, așa cum este utilizat în expresie - cifti
fișier de utilizat ca această variabilă

[-select] - repetabil - selectează un singur index dintr-o dimensiune

- dimensiunea din care să selectați (pe baza 1) - indexul de utilizat (pe baza 1)

[-repeat] - repeta valorile selectate pentru fiecare index de iesire in

această dimensiune

Această comandă evaluează la fiecare element de matrice în mod independent. Acolo
trebuie să fie cel puțin unul -var opțiunea (de la care să obțineți aspectul de ieșire), chiar dacă
specificat în acesta nu este folosit în .

Pentru a selecta o singură coloană dintr-un fișier 2D (majoritatea fișierelor cifti sunt 2D), utilizați -Selectați 1
, Unde este bazat pe 1. Pentru a selecta un singur rând dintr-un fișier 2D, utilizați
-Selectați 2 . Unde -Selectați nu este utilizat, fișierele cifti trebuie să aibă compatibile
mapările (de exemplu, modelele creierului și mapările parcelelor trebuie să se potrivească exact, cu excepția
denumirile coletelor). Utilizare -override-mapping-check pentru a sări peste această verificare.

Numele de fișiere nu sunt valide în , utilizați un nume de variabilă și a -var opțiunea cu
potrivire pentru a specifica un fișier de intrare. Formatul de este ca
urmează:

Expresiile constau din constante, variabile, operatori, paranteze și funcții,
în notație infixă, cum ar fi „exp(-x + 3) * scară'. Variabilele sunt șiruri de orice
lungime, folosind caracterele az, AZ, 0-9 și _, dar nu poate lua numele unui
numită constantă. În prezent, există o singură constantă numită PI. Operatorii
sunt +, -, *, /, ^, >, <, >=, <=, ==, !=, !, &&, ||. Acestea se comportă ca în C, cu excepția
că ^ este exponențiație, adică pow(x, y), și are o prioritate mai mare decât altele
operatori binari (de asemenea, '-3^-4^-5' înseamnă '-(3^(-(4^-5)))'). <=, >=, == și !=
operatorilor li se oferă o cantitate mică de spațiu de mișcare, egală cu o milioneme din
mai mică dintre valorile absolute ale valorilor comparate.

Operatorii de comparație și logici returnează 0 sau 1, puteți face mascarea cu expresii
precum „x * (mască > 0)”. Pentru toți operatorii logici, o intrare este considerată adevărată dacă
este mai mare decât 0. Expresia „0 < x < 5” nu este greșită din punct de vedere sintactic, dar
NU va face ceea ce se dorește, deoarece este evaluat de la stânga la dreapta, adică „((0
x) < 5)', care va returna întotdeauna 1, așa cum sunt ambele rezultate posibile ale unei comparații
mai mic de 5. Se generează un avertisment dacă este detectată o expresie de acest tip.
Utilizați ceva de genul „x > 0 && x < 5” pentru a obține comportamentul dorit.

Spațiul alb dintre elemente este ignorat, „ sin ( 2 * x ) ” este echivalent cu
„sin(2*x)”, dar „s in(2*x)” este o eroare. Înmulțirea implicită nu este permisă,
expresia „2x” va fi analizată ca variabilă. Parantezele sunt (), nu se folosesc
[] sau {}. Funcțiile necesită paranteze, expresia „sin x” este o eroare.

Sunt acceptate următoarele funcții:

sin: 1 argument, sinusul argumentului (unitățile sunt radiani) cos: 1 argument, the
cosinus al argumentului (unitățile sunt radiani) tan: 1 argument, tangenta lui
argument (unitățile sunt radiani) asin: 1 argument, inversul sinusului argumentului,
în radiani acos: 1 argument, inversul cosinusului argumentului, în radiani
atan: 1 argument, inversul tangentei argumentului, în radiani atan2: 2
argumente, atan2(y, x) returnează inversul tangentei lui

(y/x), în radiani, determinând cadranul după semnul ambelor argumente

sinh: 1 argument, sinusul hiperbolic al argumentului cosh: 1 argument, the
cosinus hiperbolic al argumentului tanh: 1 argument, tangenta hiperbolocă a lui
argument asinh: 1 argument, sinusul hiperbolic invers al argumentului acosh: 1
argument, cosinusul hiperbolic invers al argumentului atanh: 1 argument, the
tangenta hiperboloc inversă a argumentului ln: 1 argument, logaritmul natural al
argumentul exp: 1 argument, constanta e ridicată la puterea argumentului
log: 1 argument, logaritmul de bază 10 al argumentului sqrt: 1 argument, pătratul
rădăcina argumentului abs: 1 argument, valoarea absolută a argumentului etaj: 1
argument, cel mai mare întreg nu mai mare decât runda argumentului: 1 argument, the
cel mai apropiat număr întreg, cu legăturile rotunjite la o distanță de

zero

ceil: 1 argument, cel mai mic număr întreg nu mai mic decât argumentul min: 2 argumente,
min(x, y) returnează y dacă (x > y), x altfel max: 2 argumente, max(x, y) returnează y
dacă (x < y), x altfel mod: 2 argumente, mod(x, y) = x - y * floor(x / y), sau 0 dacă
y == 0 clamp: 3 argumente, clamp(x, low, high) = min(max(x, low), high)

-cifti-merge FUNCȚI FIȘIERE CIFTI TIMESERIES, SCALARE SAU LABEL

wb_command -cifti-merge

- ieșire - fișier cifti de ieșire

[-cifti] - repetabil - specifică un fișier cifti de intrare

- un fișier cifti din care să folosești coloanele

[-coloană] - repetabil - selectați o singură coloană de utilizat

- indexul coloanei (începând de la 1)

[-up-to] - utilizați o gamă inclusivă de coloane

- indexul ultimei coloane de inclus

[-reverse] - utilizați intervalul în ordine inversă

Fișierele CIFTI de intrare care au mapări potrivite de-a lungul coloanelor și pentru care
mapările de-a lungul rândurilor sunt de același tip, toate fie în serie, fie scalare, fie etichete, aceasta
comanda concatenează coloanele specificate pe orizontală (rândurile devin mai lungi).

Exemplu: wb_command -cifti-merge out.dtseries.nii -cifti primul.dtseries.nii -coloană
1 -cifti a doua.dtseries.nii

Acest exemplu ar lua prima coloană de la first.dtseries.nii, urmată de all
coloane din second.dtseries.nii și scrieți aceste coloane în out.dtseries.nii.

-cifti-merge-dens FUNCȚI FIȘIERE CIFTI DE-A lungul dimensiunii dense

wb_command -cifti-merge-dens

- ce dimensiune se îmbină, RÂND sau COLANĂ - iesire -
fișierul cifti de ieșire

[-cifti] - repetabil - specifică un fișier cifti de intrare

- un fișier cifti de îmbinat

Fișierele cifti de intrare trebuie să aibă mapări care se potrivesc de-a lungul direcției, nu
specificate, iar maparea de-a lungul direcției specificate trebuie să fie modele ale creierului.

-corelarea-cifti-perechi CORELAȚI RANDURI PERECHE ÎNTRE DOUĂ FIȘIERE CIFTI

wb_command -corelarea-cifti-perechi

- primul fișier cifti de intrare - al doilea fișier cifti de intrare
- ieșire - fișier cifti de ieșire

[-fisher-z] - aplică transformarea Fisher Small z (adică, artanh) la corelație

Pentru fiecare rând în , corelați-l cu același rând în , și pune
rezultă în același rând de , care are o singură coloană.

-paletă-cifti SETĂ PALETA PE UN FIȘIER CIFTI

wb_command -paletă-cifti

- intrarea cifti - modul de cartografiere - ieșire - the
fișier cifti de ieșire

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru hărțile scalare

- numărul coloanei sau numele

[-pos-percent] - procentaj min/max pentru colorarea datelor pozitive

- percentila pentru cele mai puțin pozitive date - cel
percentila pentru datele cele mai pozitive

[-neg-percent] - procentaj min/max pentru colorarea datelor negative

- percentila pentru datele cele mai puțin negative - cel
percentila pentru datele cele mai negative

[-pos-user] - valori min/max ale utilizatorului pentru colorarea datelor pozitive

- valoarea pentru cele mai puțin pozitive date - valoarea
pentru cele mai pozitive date

[-neg-user] - valorile min/max ale utilizatorului pentru colorarea datelor negative

- valoarea pentru cele mai puțin negative date - valoarea
pentru cele mai negative date

[-interpolate] - interpolează culorile

- boolean, dacă se interpolează

[-disp-pos] - afișează date pozitive

- boolean, dacă să fie afișat

[-disp-neg] - afișați date pozitive

- boolean, dacă să fie afișat

[-disp-zero] - afișați datele mai aproape de zero decât limita minimă

- boolean, dacă să fie afișat

[-palette-name] - setează paleta utilizată

- numele paletei

[-thresholding] - setează pragul

- setarea pragului - afișează valori în interiorul sau în afara pragurilor
- pragul inferior - pragul superior

NOTĂ: Fișierul de ieșire trebuie să fie un fișier diferit de fișierul de intrare.

Pentru hărțile scalare, în mod implicit, paleta este schimbată pentru fiecare hartă, specificați -coloană
pentru a schimba o singură hartă. Setările paletei nespecificate vor fi preluate din
prima coloană pentru hărți scalare și din paleta de fișiere existentă pentru alte mapări
tipuri. The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

The argument la -nume-paleta trebuie să fie unul dintre următoarele:

PSYCH PSYCH-NU-NIMIC ROY-BIG ROY-BIG-BL Portocaliu-Galben Gri_Interp_Pozitiv
Gray_Interp clear_brain videen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG roșu-galben albastru-albastru deschis FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256

The argument la -pragării trebuie să fie unul dintre următoarele:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

The argument la -pragării trebuie să fie unul dintre următoarele:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-mapping-parcel-cifti-la-etichetă CREAȚI DLABEL DIN FIȘIERUL PARcelaT

wb_command -mapping-parcel-cifti-la-etichetă

- fișierul parcelat de intrare - ce dimensiune să ia
hartă a parcelelor de la, RÂND sau COLANĂ - un dosar cifti cu cel dorit
cartografiere densă de-a lungul

coloană

- output - fișierul de etichetă dens de ieșire

Această comandă va scoate un fișier dlabel, util pentru a face aceeași parcelare
un alt dosar dens.

Pentru ptseries, pscalar, plabel, pconn și pdconn, folosind ROW pentru voi
muncă.

-cifti-parcelat PARCELAȚI UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-parcelat

- dosarul cifti de parcelat - un fișier de etichetă cifti de utilizat
pentru parcelare - care mapare să parceleze, RÂND sau COLANĂ
- ieșire - fișier cifti de ieșire

Fiecare etichetă din fișierul de etichete cifti va fi tratată ca o parcelă, iar toate rândurile sau
coloanele din parcelă sunt mediate împreună pentru a forma rândul sau coloana de ieșire.
Dacă este specificat ROW, atunci maparea de intrare de-a lungul rândurilor trebuie să fie coordonate ale creierului și
maparea de ieșire de-a lungul rândurilor va fi parcele, ceea ce înseamnă că coloanele vor fi mediate
împreună. Pentru dtseries sau dscalar, utilizați COLUMN.

-cifti-reduce Efectuați OPERAȚIUNE DE REDUCERE DE-A lungul RINDURILOR CIFTI

wb_command -cifti-reduce

- dosarul cifti pentru a reduce - operatorul de reducere de utilizat
- output - fișierul cifti de ieșire

[-exclude-outliers] - exclude valorile aberante din fiecare rând în funcție de standard

deviere - numărul de abateri standard sub media până la

include

- numărul de abateri standard peste medie până la

include

Pentru fiecare rând cifti, ia datele de-a lungul unui rând ca vector și efectuează
reducerea specificată pe aceasta, punând rezultatul în coloana de ieșire unică în aceea
rând. Operatorii de reducere sunt următorii:

MAX: valoarea maximă MIN: valoarea minimă INDEXMAX: indicele bazat pe 1 al
valoarea maximă INDEXMIN: indicele bazat pe 1 al valorii minime SUM: adăugați toate valorile
PRODUS: înmulțiți toate valorile MEDIA: media datelor STDEV: standardul
abatere (numitorul N) SAMPSTDEV: abaterea standard a eșantionului (N-1
numitor) VARIANCE: varianţa datelor MEDIANA: mediana datelor
MODE: modul datelor COUNT_NONZERO: numărul de elemente nenule din
de date

-cifti-reordonare REORDONAȚI COLELELE SAU HĂRȚILE SCALARE/ETICHETE ÎNTR-UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-reordonare

- introduceți fișierul cifti parcelat - ce dimensiune să reordoneze
de-a lungul, RÂND sau COLANĂ - un fișier text care conține ordinea dorită
transformare - ieșire - fișierul cifti reordonat

Maparea de-a lungul direcției specificate trebuie să fie parcele, scalari sau etichete. Pentru
pscalar sau ptseries, utilizați COLUMN pentru a reordona parcelele. Pentru dlabel, utilizați ROW. The
fișierul trebuie să conțină indici bazați pe 1 separați prin spații albe (spații,
linii noi, tab-uri etc), cu atâția indici ca are de-a lungul specificate
dimensiune. Acești indici specifică ce indice curent ar trebui să ajungă în acel indice
poziție, de exemplu, dacă comanda curentă este „ABC D”, iar ordinea dorită este
„DAB C”, fișierul text ar trebui să conțină „4 1 2 3”.

-cifti-inlocuieste-structura ÎNLOCUIȚI DATELE ÎNTR-O STRUCTURĂ ÎN FIȘIER CIFTI

wb_command -cifti-inlocuieste-structura

- cifti de modificat - ce dimensiune să interpretăm ca a
o singură hartă, RÂND sau COLANĂ

[-volume-all] - înlocuiți datele din toate componentele de volum

- volumul de intrare

[-from-cropped] - intrarea este decupată la dimensiunea datelor

[-discard-unused-labels] - atunci când operați pe un fișier dlabel, aruncați orice

chei de etichetă neutilizate din tabelul de etichete

[-label] - repetabil - înlocuiți datele într-o componentă de etichetă de suprafață

- structura de înlocuire a datelor - fișierului etichetă de intrare

[-metric] - repetabil - înlocuiește datele într-o componentă de suprafață

- structura de înlocuire a datelor - metrica de intrare

[-volum] - repetabil - înlocuiește datele într-o componentă de volum

- structura de înlocuire a datelor - volumul de intrare

[-from-cropped] - intrarea este decupată la dimensiunea componentei

Trebuie să specificați cel puțin unul dintre -metric, -eticheta, -volum, -volum-toate pentru asta
comandă să faci orice. Volumele de intrare trebuie să se alinieze cu ieșirea lui
-cifti-separate. Pentru dtseries/dscalar, utilizați COLUMN și dacă matricea dvs. va fi
complet simetric, COLUMN este mai eficient. Argumentul structurii trebuie să fie unul dintre
următoarele:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-resantionare RESAMPLONAȚI UN FIȘIER CIFTI LA UN NOU SPAȚIU CIFTI

wb_command -cifti-resantionare

- fișierul cifti de reeșantionat - direcția de intrare
care ar trebui reeșantionat - un fișier cifti care conține spațiul cifti
a reeșantiona la - direcția șablonului de utilizat ca

spațiu de reeșantionare

- specificați o metodă de reeșantionare a suprafeței - specificați a
metoda de interpolare a volumului - output - fișierul cifti de ieșire

[-surface-largest] - utilizați cea mai mare greutate în loc de media ponderată când

efectuând reeșantionarea suprafeței

[-volume-predilate] - dilată componentele de volum înainte de reeșantionare

- distanta, in mm, de dilatare

[-surface-postdilate] - dilată componentele de suprafață după reeșantionare

- distanta, in mm, de dilatare

[-afină] - folosește o transformare afină asupra componentelor de volum

- fișierul afin de utilizat

[-flirt] - TREBUIE folosit dacă afine este un afin de flirt

- volumul sursă utilizat la generarea afinei
- volumul țintă utilizat la generarea afinei

[-warpfield] - utilizați un warpfield pe componentele de volum

- câmpul warp de folosit

[-fnirt] - TREBUIE folosit dacă se folosește un fnirt warpfield

- volumul sursă utilizat la generarea

warpfield

[-left-spheres] - specificați sferele pentru reeșantionarea suprafeței stângi

- o sferă cu aceeași plasă ca și curentul rămas

suprafaţă

- o sferă cu noua plasă stângă care este în registru

cu sfera curentă

[-left-area-surfs] - specificați suprafețele din stânga pentru a face zona de vârf

corectare bazată pe - o suprafata anatomica stanga relevanta cu
curent

ochiurilor de plasă

- o suprafață anatomică stângă relevantă cu plasă nouă

[-left-area-metrics] - specificați valorile zonei de vârf din stânga de făcut

corectare bazată pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru
curent

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru noua plasă

[-right-spheres] - specificați sferele pentru reeșantionarea suprafeței drepte

- o sferă cu aceeași plasă ca și dreapta curentă

suprafaţă

- o sferă cu noua plasă dreaptă care este în registru

cu sfera curentă

[-right-area-surfs] - specificați suprafețele corecte pentru a face zona de vârf

corectare bazată pe - o suprafata anatomica dreapta relevanta cu
curent

ochiurilor de plasă

- o suprafata anatomica dreapta relevanta cu plasa noua

[-right-area-metrics] - specificați metrica zonei vârfului din dreapta pentru a face zona

corectare bazată pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru
curent

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru noua plasă

[-cerebellum-spheres] - specificați sferele pentru reeșantionarea suprafeței cerebelului

- o sferă cu aceeași plasă ca și curentul

suprafata cerebelului

- o sferă cu noua plasă cerebelului care se află în

se înregistrează cu sfera curentă

[-cerebellum-area-surfs] - specifică suprafețele cerebelului pentru a face vârf

corectarea zonei pe baza - o suprafață anatomică relevantă a cerebelului
implementate cu

plasă curentă

- o suprafață anatomică relevantă a cerebelului cu plasă nouă

[-cerebellum-area-metrics] - specificați metrica ariei vertexului cerebelului

face corectarea zonei pe baza - un fișier metric cu zone de vârf pentru
curentă

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru noua plasă

Reeșantionați datele cifti într-un spațiu diferit al creierului.
Folosiți COLUMN pentru

direcția de reeșantionare dscalar, dlabel sau dtseries.
Reeșantionarea ambelor

dimensiunile unui dconn necesită rularea acestei comenzi de două ori, o dată cu COLUMN și
o dată cu RÂND. Dacă reeșantionați un dconn și mașina dvs. are o cantitate mare
de memorie, ați putea lua în considerare utilizarea -cifti-resample-dconn-memory pentru a evita scrisul
și recitirea unui fișier intermediar. Dacă nu sunt specificate sfere pentru o suprafață
structura care există în fișierele cifti, datele acesteia sunt copiate fără reeșantionare sau
dilatare. Dilatarea se face cu metoda „cea mai apropiată” și se face pe
pentru datele de suprafață. Componentele de volum sunt căptușite înainte de dilatare, astfel încât dilatarea
nu intră în marginea casetei de delimitare a componentei.

Metodele de reeșantionare recomandate sunt ADAP_BARY_AREA și CUBIC (spline cubic),
cu excepția datelor de etichetă care ar trebui să utilizeze ADAP_BARY_AREA și ENCLOSING_VOXEL.

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

-cifti-resample-dconn-memory UTILIZAȚI MULTE MEMORIE PENTRU RESAMPIONAREA DCONN

wb_command -cifti-resample-dconn-memory

- fișierul cifti de reeșantionat - un fișier cifti care conține
spațiul cifti pentru a reeșantiona - direcția șablonului
pentru a folosi ca

spațiu de reeșantionare

- specificați o metodă de reeșantionare a suprafeței - specificați a
metoda de interpolare a volumului - output - fișierul cifti de ieșire

[-surface-largest] - utilizați cea mai mare greutate în loc de media ponderată când

efectuând reeșantionarea suprafeței

[-volume-predilate] - dilată componentele de volum înainte de reeșantionare

- distanta, in mm, de dilatare

[-surface-postdilate] - dilată componentele de suprafață după reeșantionare

- distanta, in mm, de dilatare

[-afină] - folosește o transformare afină asupra componentelor de volum

- fișierul afin de utilizat

[-flirt] - TREBUIE folosit dacă afine este un afin de flirt

- volumul sursă utilizat la generarea afinei
- volumul țintă utilizat la generarea afinei

[-warpfield] - utilizați un warpfield pe componentele de volum

- câmpul warp de folosit

[-fnirt] - TREBUIE folosit dacă se folosește un fnirt warpfield

- volumul sursă utilizat la generarea

warpfield

[-left-spheres] - specificați sferele pentru reeșantionarea suprafeței stângi

- o sferă cu aceeași plasă ca și curentul rămas

suprafaţă

- o sferă cu noua plasă stângă care este în registru

cu sfera curentă

[-left-area-surfs] - specificați suprafețele din stânga pentru a face zona de vârf

corectare bazată pe - o suprafata anatomica stanga relevanta cu
curent

ochiurilor de plasă

- o suprafață anatomică stângă relevantă cu plasă nouă

[-left-area-metrics] - specificați valorile zonei de vârf din stânga de făcut

corectare bazată pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru
curent

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru noua plasă

[-right-spheres] - specificați sferele pentru reeșantionarea suprafeței drepte

- o sferă cu aceeași plasă ca și dreapta curentă

suprafaţă

- o sferă cu noua plasă dreaptă care este în registru

cu sfera curentă

[-right-area-surfs] - specificați suprafețele corecte pentru a face zona de vârf

corectare bazată pe - o suprafata anatomica dreapta relevanta cu
curent

ochiurilor de plasă

- o suprafata anatomica dreapta relevanta cu plasa noua

[-right-area-metrics] - specificați metrica zonei vârfului din dreapta pentru a face zona

corectare bazată pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru
curent

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru noua plasă

[-cerebellum-spheres] - specificați sferele pentru reeșantionarea suprafeței cerebelului

- o sferă cu aceeași plasă ca și curentul

suprafata cerebelului

- o sferă cu noua plasă cerebelului care se află în

se înregistrează cu sfera curentă

[-cerebellum-area-surfs] - specifică suprafețele cerebelului pentru a face vârf

corectarea zonei pe baza - o suprafață anatomică relevantă a cerebelului
implementate cu

plasă curentă

- o suprafață anatomică relevantă a cerebelului cu plasă nouă

[-cerebellum-area-metrics] - specificați metrica ariei vertexului cerebelului

face corectarea zonei pe baza - un fișier metric cu zone de vârf pentru
curentă

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru noua plasă

Această comandă face același lucru ca rularea -cifti-resantionare de două ori, dar folosește memoria
până la aproximativ de două ori dimensiunea fișierului intermediar. Aceasta este
deoarece dconnul intermediar este păstrat în memorie, mai degrabă decât scris pe disc și
componentele înainte și după reeșantionare/dilatare trebuie să fie în memorie la
în același timp în timpul calculului relevant. Dacă nu sunt specificate sfere pentru a
structura de suprafață care există în fișierele cifti, datele acesteia sunt copiate fără
reeșantionarea sau dilatarea. Dilatarea se face cu metoda „cea mai apropiată” și se face pe
pentru datele de suprafață. Componentele de volum sunt căptușite înainte de dilatare deci
acea dilatare nu ajunge la marginea casetei de delimitare a componentei.

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

-cifti-restrict-densa-harta EXCLUDEȚI ORDONAREA CREIERULUI DIN UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-restrict-densa-harta

- intrarea cifti - ce dimensiune să modifice maparea
on, ROW sau COLUMN - output - output cifti

[-cifti-roi] - fișier cifti care conține rois combinate

- roisul ca dosar cifti

[-left-roi] - vârfuri de utilizat din emisfera stângă

- roiul din stânga ca fișier metric

[-right-roi] - vârfuri de utilizat din emisfera dreaptă

- roiul corect ca fișier metric

[-cerebellum-roi] - vârfuri de folosit din cerebel

- cerebelul roi ca fișier metric

[-vol-roi] - voxeli de utilizat

- fișierul de volum roi

Scrie o versiune modificată a , unde toate coordonatele creierului din afara
roi(urile) specificate sunt eliminate din fișier. Dacă -cifti-roi este specificat, nu altul
Opțiunea -*-roi poate fi specificată. Dacă nu se utilizează -cifti-roi, orice opțiuni -*-roi nu
prezent va elimina structura relevantă, dacă este prezentă în fișierul de intrare.

-cifti-roi-average RANDURI MEDIE ÎNTR-UN SINGUR DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-roi-average

- fișierul cifti la rândurile medii de la - fișier text de ieșire al
valorile medii

[-cifti-roi] - fișier cifti care conține rois combinate

- roisul ca dosar cifti

[-left-roi] - vârfuri de utilizat din emisfera stângă

- roiul din stânga ca fișier metric

[-right-roi] - vârfuri de utilizat din emisfera dreaptă

- roiul corect ca fișier metric

[-cerebellum-roi] - vârfuri de folosit din cerebel

- cerebelul roi ca fișier metric

[-vol-roi] - voxeli de utilizat

- fișierul de volum roi

Faceți o medie a rândurilor care se află în limitele ROI-urilor specificate și scrieți rezultatul
rând mediu într-un fișier text, separat prin linii noi. Dacă -cifti-roi este specificat,
-left-roi, -dreapta-roi, -cerebelul-roi și -vol-roi nu trebuie specificate.

-cifti-rois-din-extrema CREAȚI HĂRȚI CIFTI ROI DIN HĂRȚI EXTREMA

wb_command -cifti-rois-din-extrema

- intrarea cifti - limita distanței geodezice de la vârf, în mm
- limita distanta euclidiana fata de centrul voxelului, in mm - care
dimensiunea unei hărți extreme este de-a lungul, RÂND sau COLANĂ - ieșire - ieșire
Cuplul

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-gaussian] - generează nuclee gaussiene în loc de ROI-uri plate

- sigma pentru miezul gaussian de suprafață, în mm - cel
sigma pentru volumul nucleului gaussian, în mm

[-overlap-logic] - cum să gestionați suprapunerea ROI-urilor, implicit ALLOW

- metoda de rezolvare a suprapunerilor

[-merged-volume] - tratează componentele de volum ca și cum ar fi un singur

component

Pentru fiecare valoare diferită de zero din fiecare hartă, creați o hartă cu un ROI în jurul locației respective.
În cazul în care -gaussian este specificată opțiunea, apoi sunt ieșite nucleele gaussiene normalizate
în loc de rentabilitatea investiției. The argument la -logica-suprapunere trebuie să fie unul dintre PERMISI,
CEL MAI APROPIAT sau EXCLUDE. ALLOW este valoarea implicită și înseamnă că ROI-urile sunt tratate
independent și se pot suprapune. CLOEST înseamnă că rentabilitatea investiției nu se poate suprapune și asta
niciun ROI nu conține vârfuri care sunt mai aproape de un alt vârf de semințe. EXCLUDE înseamnă
că ROI-urile nu se pot suprapune și că orice vârf în intervalul mai mult de o ROI
nu aparține niciunui ROI.

-cifti-separate SCRIEȚI O STRUCTURĂ CIFTI CA METRIC, ETICĂ SAU VOLUM

wb_command -cifti-separate

- cifti pentru a separa o componentă din - în ce direcție
separate în componente, RÂND sau COLANĂ

[-volume-all] - separă toate structurile de volum într-un fișier de volum

- ieșire - volumul de ieșire

[-roi] - scoate, de asemenea, roi-ul căruia voxelii au date

- output - volumul de ieșire roi

[-label] - scoate un fișier de etichetă de volum care indică locația

structurilor - output - volumul de ieșire al etichetei

[-crop] - decupați volumul la dimensiunea datelor, mai degrabă decât folosind

dimensiunea volumului original

[-label] - repetabil - separă un model de suprafață într-o etichetă de suprafață

fişier - structura de ieșire - ieșire - eticheta de ieșire
fişier

[-roi] - scoate, de asemenea, roiul a cărui vârfuri au date

- output - metrica de ieșire roi

[-metric] - repetabil - separă un model de suprafață într-un fișier metric

- structura de ieșire - output - metrica de ieșire

[-roi] - scoate, de asemenea, roiul a cărui vârfuri au date

- output - metrica de ieșire roi

[-volum] - repetabil - separă o structură de volum într-un fișier de volum

- structura de ieșire - ieșire - volumul de ieșire

[-roi] - scoate, de asemenea, roi-ul căruia voxelii au date

- output - volumul de ieșire roi

[-crop] - decupează volumul la dimensiunea componentei, mai degrabă decât folosind

dimensiunea originală a volumului

Pentru dtseries, dscalar și dlabel, utilizați COLUMN pentru , iar dacă aveți un
dconn simetric, COLUMN este mai eficient.

Trebuie să specificați cel puțin unul dintre -metric, -volum-toate, -volum, -eticheta pentru asta
comandă să faci orice. Volumele de ieșire se vor alinia spațial cu originalul
poziții, indiferent dacă sunt sau nu decupate.

Pentru fiecare argument, utilizați unul dintre următoarele șiruri de caractere:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-netezire NETEZIȚI UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-netezire

- intrarea cifti - sigma pentru suprafața gaussiană
netezirea miezului,

în mm

- sigma pentru nucleul gaussian de netezire a volumului, in

mm

- ce dimensiune să netezi de-a lungul, RÂND sau COLANĂ - iesire -
iesirea cifti

[-left-surface] - specificați suprafața din stânga de utilizat

- pila de suprafata stanga

[-left-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața stângă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-right-surface] - specificați suprafața potrivită de utilizat

- pila de suprafață potrivită

[-right-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de calcul

ele de la suprafața dreaptă - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-cerebellum-surface] - specificați suprafața cerebelului de utilizat

- pila de suprafata cerebelului

[-cerebellum-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de

calculându-le de la suprafața cerebelului - vârful corectat
zone, ca metrică

[-cifti-roi] - netedă numai în regiunile de interes

- regiunile să se netezească în interior, ca fișier cifti

[-fix-zeros-volume] - tratează valorile zero din volum ca date lipsă

[-fix-zeros-surface] - tratează valorile zero de pe suprafață ca lipsă

de date

[-merd-volume] - netedă peste granițele structurii subcorticale

Fișierul cifti de intrare trebuie să aibă o mapare a modelelor cerebrale pe dimensiunea aleasă,
coloane pentru .dtseries și fie pentru .dconn. În mod implicit, datele sunt diferite
structurile este netezită independent (adică netezirea „parcelă constrânsă”), deci
structurile de volum care se ating nu netezesc peste această limită. Specifica
-volum-imbinat a ignora aceste limite. Netezirea suprafeței folosește
Metoda de netezire GEO_GAUSS_AREA.

Opțiunile -*-zone-corectate sunt destinate atunci când este inevitabil să netezi
suprafețe medii de grup, este doar o corecție aproximativă pentru reducerea
structura într-o suprafață medie de grup. Este mai bine să netezi datele
indivizi înainte de medie, atunci când este fezabil.

-fix-zerouri-* Opțiunile vor trata valorile zero ca lipsă de date și nu vor folosi
acea valoare la generarea valorilor netezite, dar va umple zerouri cu
valori extrapolate. Rentabilitatea investiției ar trebui să aibă un model de creier care se cartografiază de-a lungul coloanelor,
potrivirea exactă a maparii direcției alese din fișierul de intrare. Date
în afara ROI este ignorată.

-cifti-stats STATISTICA DE-A lungul coloanelor CIFTI

wb_command -cifti-stats

- intrarea cifti

[-reduce] - folosește o operație de reducere

- operatia de reducere

[-percentila] - dați valoarea la o percentilă

- percentila de găsit

[-coloană] - afișează numai rezultatul pentru o coloană

- indexul coloanei (începând de la 1)

[-roi] - luați în considerare numai datele din interiorul unui roi

- roiul, ca dosar cifti

[-match-maps] - fiecare coloană de intrare folosește coloana corespunzătoare

din dosarul roi

[-show-map-name] - imprimă indexul coloanei și numele înainte de fiecare ieșire

Pentru fiecare coloană a intrării este tipărit un singur număr, rezultat din
operație de reducere sau percentilă specificată. Utilizare -coloană pentru a da numai ieșire pentru a
o singură coloană. Utilizare -Rege să ia în considerare numai datele dintr-o regiune. Exact unul dintre
-reduce or -percentila trebuie specificat.

Argumentul către -reduce opțiunea trebuie să fie una dintre următoarele:

MAX: valoarea maximă MIN: valoarea minimă INDEXMAX: indicele bazat pe 1 al
valoarea maximă INDEXMIN: indicele bazat pe 1 al valorii minime SUM: adăugați toate valorile
PRODUS: înmulțiți toate valorile MEDIA: media datelor STDEV: standardul
abatere (numitorul N) SAMPSTDEV: abaterea standard a eșantionului (N-1
numitor) VARIANCE: varianţa datelor MEDIANA: mediana datelor
MODE: modul datelor COUNT_NONZERO: numărul de elemente nenule din
de date

-cifti-transpune TRANSPONA UN DOSAR CIFTI

wb_command -cifti-transpune

- fișierul cifti de intrare - output - fișierul cifti de ieșire

[-mem-limit] - restricționează utilizarea memoriei

- limita de memorie în gigabytes

Intrarea trebuie să fie un fișier cifti bidimensional.
Ieșirea este un fișier cifti

unde fiecare rând din intrare este o coloană în ieșire.

-operare-cifti-vector FACEȚI O OPERAȚIE VECTOR PE FIȘIERE CIFTI

wb_command -operare-cifti-vector

- primul fișier de intrare vectorial - al doilea fișier de intrare vectorial
- ce operație vectorială să faci - output - fișierul de ieșire

[-normalize-a] - normalizează vectorii primei intrări

[-normalize-b] - normalizează vectorii a doua intrare

[-normalize-output] - normalizează vectorii de ieșire (nu este valabil pentru dot

produs)

[-magnitude] - afișează mărimea rezultatului (nu este valabil pentru dot

produs)

Efectuează o operație vectorială pe două fișiere cifti (care trebuie să aibă un multiplu de 3
coloane). Oricare dintre intrări poate avea mai mulți vectori (mai mult de 3 coloane),
dar nu ambele (cel puțin una trebuie să aibă exact 3 coloane). The -magnitudinea și
-normalizare-ieșire opțiunile pot să nu fie specificate împreună sau cu o operațiune care
returnează un scalar (produs punctual). The parametrul trebuie să fie unul dintre
Următor:

CU CRUCE ADAUGĂ SCADĂ

-statistici-ponderate-cifti STATISTICI PONDERATE DE-A lungul coloanelor CIFTI

wb_command -statistici-ponderate-cifti

- intrarea cifti

[-spatial-weights] - utilizați suprafața vârfurilor și volumul voxelului ca ponderi

[-left-area-surf] - folosește o suprafață pentru zonele de vârf din stânga

- suprafata stanga de utilizat

[-right-area-surf] - utilizați o suprafață pentru zonele de vârf din dreapta

- suprafata potrivita de utilizat

[-cerebellum-area-surf] - folosește o suprafață pentru zonele vertexului cerebelului

- suprafața cerebelului de utilizat

[-left-area-metric] - utilizați un fișier metric pentru zonele de vârf din stânga

- fișier metric care conține zonele de vârf din stânga

[-right-area-metric] - utilizați un fișier metric pentru zonele de vârf din dreapta

- fișier metric care conține zone de vârf din dreapta

[-cerebellum-area-metric] - utilizați un fișier metric pentru vârful cerebelului

zone - fișier metric care conține vârful cerebelului

domenii

[-cifti-weights] - utilizați un fișier cifti care conține ponderi

- greutățile de utilizat, ca fișier cifti

[-coloană] - afișează numai rezultatul pentru o coloană

- coloana de utilizat (pe baza 1)

[-roi] - luați în considerare numai datele din interiorul unui roi

- roiul, ca dosar cifti

[-match-maps] - fiecare coloană de intrare folosește coloana corespunzătoare

din dosarul roi

[-mean] - calculează media ponderată

[-stdev] - calculează abaterea standard ponderată

[-eșantion] - estimați stdev populației din eșantion

[-percentila] - calculează percentila ponderată

- percentila de găsit

[-sum] - calculează suma ponderată

[-show-map-name] - imprimați indexul hărții și numele înainte de fiecare ieșire

Dacă maparea de-a lungul coloanei este modele cerebrale, pentru fiecare coloană a intrării,
operația specificată se face pe fiecare suprafață și pe toți voxelii și rezultatele
sunt tipărite separat. Pentru alte tipuri de cartografiere, operația se face pe fiecare
coloană și este imprimat un număr pe hartă. Exact unul dintre -greutăți-spațiale or
-cifti-greutăți trebuie specificat. Utilizare -coloană pentru a da ieșire doar pentru un singur
coloană. Utilizare -Rege să ia în considerare numai datele dintr-o regiune. Exact unul dintre -Rău,
-stdev, -percentila or -sumă trebuie specificat.

Utilizarea -sumă implementate cu -greutăți-spațiale (sau cu -cifti-greutăți și un cifti care conține
ponderi de înțeles similar) echivalează cu integrarea în raport cu suprafața și
volum.

-clasa-adăugați-membru

Adăugați membri la antetul clasei (.h) și fișierele de implementare (.cxx).

[-adăugare la fișiere] [-m ]...

În cazul în care -adăugați la fișiere nu este specificat, codul pentru antet și implementare
fișierele sunt tipărite pe terminal.

În cazul în care -adăugați la fișiere este specificat, fișierele de clasă sunt de așteptat să fie în
directorul curent și numit .mână .cxx. Fișierul antet
trebuie să conțină acest text în secțiunea sa privată:

// ADD_NEW_MEMBERS_HERE

Fișierul de implementare trebuie să conțină acest text în secțiunea sa publică:

// ADD_NEW_METHODS_HERE

Dacă oricare dintre aceste șiruri de text lipsește, codul la care ar fi fost adăugat
fișierul (fișierele) este tipărit pe terminal.

Pentru fiecare membru, trebuie furnizate trei șiruri de text separate printr-un spațiu și acestea
sunt numele membrului tipul său de date și o descriere a membrului. Dacă
descrierea conține spații, descrierea trebuie inclusă între ghilimele duble ("").

Dacă tipul de date începe cu o literă mare, se presupune că este numele lui a
clasă. În acest caz, atât geterii const cât și non-const sunt creați, dar nu setter
este creat. În caz contrar, tipul de date este de așteptat să fie un tip primitiv și ambele a
getter și setter sunt create. Rețineți că AString și QString sunt tratate ca
tipuri primitive.

-clasa-creeaza

Creați antet de clasă (.h) și fișiere de implementare (.cxx).

Utilizare:

[-copy] [-event-class ] [-event-listener] [-no-parent] [-parent
]

OPŢIUNI

-copie

Adaugă constructor de copiere și operator de atribuire

-clasa-eveniment

Când creați o subclasă de evenimente, utilizarea acestei opțiuni va seta automat
clasa părinte la Eveniment și plasați valoarea tipului enumerat al evenimentului dat în
parametru pentru constructorul clasei de evenimente.

Pentru nu este nevoie să-l adăugați înaintea „EventTypeEnum::”.

-ascultător-eveniment

Implementați EventListenerInterface, astfel încât clasa să poată asculta evenimente.

- fără părinte

Clasa creată nu este derivată din nicio altă clasă. În mod implicit, clasa părinte este
CaretObject.

-mamă

Specificați clasa părinte (derivată din). În mod implicit, clasa părinte este
CaretObject.

-scenă

Implementați SceneableInterface astfel încât instanțe ale clasei să poată fi restaurate
din și salvate în scene.

-scenă-subclasă

Adaugă metode care pot fi apelate de superclasă, astfel încât această subclasă să poată salva
și restaurați datele către și dinspre scene.

Această opțiune ar trebui folosită numai atunci când se creează o clasă a cărei super clasă implementează
SceneableInterface

-algoritm-creare-clasă

Creați antetul clasei de algoritm (.h) și fișierele de implementare (.cxx).

Utilizare:



nume-clasa-algoritm

Numele obligatoriu al clasei de algoritm care TREBUIE să înceapă cu „Algoritm”

comutator-linie de comandă

Comutator de linie de comandă necesară pentru algoritm.

scurta descriere

O scurtă descriere obligatorie între ghilimele duble.

-class-create-enum

Creați antet de tip enumerat (.h) și fișiere de implementare (.cxx).

Utilizare:



enumerare-clasă-nume

Numele tipului enumerat.
Trebuie să se termine în „Enum”

număr-de-valori

Numărul de valori din tipul enumerat.

număr automat

Codurile întregi generate automat corespunzătoare valorilor enumerate.
Valoarea acestui parametru este „adevărat” și „fals”.

[nume-enum-1] [nume-enum-2]...[nume-enum-N]

Nume opționale pentru valorile enumerate.

Dacă numărul de nume listat este mai mare decât parametrul „număr-de-valori”,
„număr-de-valori” va deveni numărul de nume. Dacă numărul de nume este este
mai puțin decât „numărul de valori”, vor fi create intrări goale.

-operație-creare-clasă

Creați antet Clasa de operare (.h) și fișiere de implementare (.cxx).

Utilizare:

[-fără-parametri]

nume-clasa-operație

Numele obligatoriu al clasei de operație care TREBUIE să înceapă cu „Operațiune”

comutator-linie de comandă

Comutator de linie de comandă necesar pentru funcționare.

scurta descriere

O scurtă descriere obligatorie între ghilimele duble.

-fără parametri

Parametru opțional dacă operațiunea nu utilizează parametri.

-convertit-afin CONVERȚI UN FIȘIER AFIN ÎNTRE CONVENȚII

wb_command -convertit-afin

[-from-world] - intrarea este o „lume” afină NIFTI

- intrarea afină

[-from-flirt] - intrarea este o matrice de flirt

- intrarea afină - volumul sursă utilizat la generare
intrare

afine

- volumul țintă utilizat la generarea intrării

afine

[-to-world] - scrieți ieșirea ca o „lume” afină NIFTI

- ieșire - ieșire afină

[-to-flirt] - repetabil - scrie ieșire ca o matrice de flirt

- ieșire - ieșire afină - volumul dorit
aplica transformarea la - spațiul țintă pe care doriți să îl transformați
volum la

Meci

Matricele lumii NIFTI pot fi utilizate direct pe coordonatele mm prin intermediul matricei
înmulțire, folosesc sistemul de coordonate NIFTI, adică X pozitiv este corect,
Y pozitiv este anterior, iar pozitiv Z este superior.

Trebuie să specificați exact unul -din opțiune, dar puteți specifica mai multe -la
opțiuni și orice -la opțiunea care ia volume poate fi specificată de mai multe ori.

-convertirea-orientărilor-fibrelor CONVERȚI VOLUMELE PARAMETRILOR BINGHAM ÎN FIȘIER DE ORIENTARE FIBRE

wb_command -convertirea-orientărilor-fibrelor

- volumul etichetelor structurii cifti - ieșire - ieșire
fișier de orientare a fibrelor

[-fibre] - repetabil - specifică volumele parametrilor pentru o fibră

- rezistența medie a fibrei - abaterea standard a rezistenței fibrei
- unghiul theta - unghiul phi - unghi psi - Ka Bingham
parametru - parametrul kb bingham

Preia parametrii Bingham precalculați din fișierele de volum și îi convertește în
format workbench folosește pentru afișare. The argumentul trebuie să fie o etichetă
volum, unde etichetele folosesc aceste șiruri:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-convert-matrix4-to-matrix2 GENERĂ UN CIFTI MATRIX2 DIN MATRIX4 WBSPARSE

wb_command -convert-matrix4-to-matrix2

- un fișier wbsparse matrix4 - output - totalul
fibrele contează, ca fișier cifti

[-distances] - iesire distanta medie a traiectoriei

- ieșire - distanțele, ca fișier cifti

Această comandă face un fișier cifti din contorizarea fibrelor într-un fișier wbsparse matrix4,
si optional un al doilea fisier cifti de la distante.

-convert-matrix4-la-workbench-sparse CONVERȚI UN FIȘIER DE 3 FIȘIERE 4 ÎN UN FIȘIER SPARSE DE BANC DE LUCRU

wb_command -convert-matrix4-la-workbench-sparse

- primul fișier matrix4 - al doilea fișier matrix1
- al treilea fișier matrix4 - fișierul .fiberTEMP.nii
se aplică acest fișier de traiectorie

la

- lista de triplete ale indicelui voxel al substanței albe, așa cum sunt utilizate în

matricea traiectoriei

- ieșire - fișierul rar din workbench de ieșire

[-surface-seeds] - specifică spațiul de semințe de suprafață

- fișierul metric roi al tuturor nodurilor utilizate în spațiul de semințe

[-volume-seeds] - specifică spațiul de semințe de volum

- fișier cifti din care să utilizați mapările de volum -
dimensiunea de-a lungul fișierului cifti pentru a prelua maparea,

RÂND sau COLANĂ

Convertește ieșirea matricei 4 a lui probtrackx în format de fișier rar din workbench.
Exact unul dintre -semințe de suprafață și -volum-seminţe trebuie specificat.

-convert-warpfield CONVERTIȚI UN CÂMP WARP ÎNTRE CONVENȚII

wb_command -convert-warpfield

[-from-world] - intrarea este un câmp warp „world” NIFTI

- câmpul warp de intrare

[-from-fnirt] - intrarea este un câmp warp fnirt

- câmpul warp de intrare - volumul sursei folosit când
generând intrarea

warpfield

[-to-world] - scrieți ieșirea ca un câmp warp „world” NIFTI

- output - câmpul warp de ieșire

[-to-fnirt] - repetabil - scrie ieșire ca un câmp warpfield flirt

- output - câmpul warp de ieșire - volumul dorit
aplica câmpul warp la

NIFTI world warpfields pot fi utilizate direct pe coordonatele mm prin eșantionare
trei subvolume la coordonată și adăugarea valorilor eșantionate la coordonată
vector, ei folosesc sistemul de coordonate NIFTI, adică X este de la stânga la dreapta, Y este
posterior față de anterior, iar Z este inferior față de superior.

NOTĂ: această comandă nu inversează câmpul warp, iar pentru a deforma o suprafață, trebuie
utilizați inversul câmpului warp care deformează volumul corespunzător.

Trebuie să specificați exact unul -din opțiune, dar puteți specifica mai multe -la
opțiuni și orice -la opțiunea care ia volume poate fi specificată de mai multe ori.

-creeaza-semnat-distanta-volum CREAȚI VOLUM DE DISTANȚĂ SEMNATĂ DE LA SUPRAFAȚĂ

wb_command -creeaza-semnat-distanta-volum

- suprafata de intrare - un volum în spațiul de ieșire dorit
(dims, spațiere, origine) - ieșire - volumul de ieșire

[-roi-out] - scoate un volum roi de unde ieșirea are un calculat

valoare - output - volumul roi de ieșire

[-fill-value] - specificați o valoare de introdus în toți voxelii care nu primesc

atribuită o distanță - valoare de completat (implicit 0)

[-exact-limit] - specificați distanța pentru ieșirea exactă

- distanta in mm (implicit 5)

[-approx-limit] - specificați distanța pentru ieșire aproximativă

- distanta in mm (implicit 20)

[-approx-neighborhood] - vecinătate voxel pentru calcul aproximativ

- dimensiunea cubului de vecinătate măsurată de la centru la față, în

voxeli (implicit 2 = 5x5x5)

[-winding] - metoda de înfășurare pentru încercarea punctului interior al suprafeței

- numele metodei (implicit EVEN_ODD)

Calculează funcția de distanță semnată a suprafeței.
Distanța exactă este

calculat prin găsirea celui mai apropiat punct de pe orice triunghi de suprafață de centrul lui
voxelul. Distanța aproximativă este calculată începând cu aceste distanțe, folosind
metoda lui dijkstra cu o vecinătate de voxeli. Precizând prea mic sau exact
distanța poate produce rezultate neașteptate. Specificatorii validi pentru metodele de bobinare sunt
după cum urmează:

EVEN_ODD (implicit) NORMALE NEGATIVE NON-NERO

Metoda NORMALE utilizează normalele triunghiurilor și muchiilor sau cel mai apropiat triunghi
lovită de o rază din punct. Această metodă poate fi puțin mai rapidă, dar este doar
fiabil pentru o suprafață închisă care nu trece prin ea însăși. Toti ceilalti
metodele numără trecerile de intrare (pozitive) și de ieșire (negative) ale unei raze verticale din
punctul, apoi contează ca în interior dacă totalul este impar, negativ sau diferit de zero,
respectiv.

-estimare-fibre-binghams ESTIMĂ DISTRIBUȚIILE DE ORIENTARE A FIBRELOR DIN PROBE BEDPOSTX

wb_command -estimare-fibre-binghams

- probe de rezistență fibrei 1 - fibra 1 teta
mostre - mostre de fibre 1 phi - fibra 1
probe de rezistență - mostre de fibre 2 theta -
fibre 2 mostre phi - fibre 3 probe de rezistență
- mostre de fibre 3 theta - fibra 3 phi
mostre - volumul etichetelor structurii cifti - iesire -
ieșire fișier cifti fiber distributons

Această comandă face o estimare a unei distribuții bingham pentru fiecare fibră
orientare în fiecare voxel care este etichetat ca identificator de structură. Aceste etichete
provin din argument, care trebuie să aibă etichete care se potrivesc cu
următoarele șiruri:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-produse-fibră-puncte CALCULATEAZĂ PRODUSE DOT ALE ORIENTĂRILOR DE FIBRE CU NORMALE DE SUPRAFAȚĂ

wb_command -produse-fibră-puncte

- suprafața de delimitare alb/gri - orientarea fibrelor
fişier - distanta maxima de la orice nod de suprafata o fibra

populația poate fi, în mm

- testați pe suprafață pentru a stabili dacă o populație de fibre ar trebui

fi folosit

- output - metrica produselor punctuale - ieșire - o metrică
a valorilor f ale distribuţiilor fibrelor

Pentru fiecare vârf, această comandă găsește cea mai apropiată populație de fibre care satisface
testează și calculează valoarea absolută a produsului scalar al suprafeței
normal și direcția medie normalizată a fiecărei fibre. The testul trebuie
fie unul dintre INTERIOR, EXTERIOR sau ORICE, ceea ce face ca comanda să folosească numai fibra
populațiile care se află în interiorul suprafeței, în afara suprafeței sau să nu-i pese care
direcția este de la suprafață. Fiecare populație de fibre este scoasă separat
coloană metrică.

-fișier-conversie SCHIMBAȚI VERSIUNEA FORMATULUI DE FIȘIER

wb_command -fișier-conversie

[-border-version-convert] - scrieți un fișier chenar cu o versiune diferită

- fișierul chenar de intrare - versiunea formatului ca să scrie,
1 sau 3 (2 nu

exista)

- output - fișierul de margine de ieșire

[-surface] - trebuie specificat dacă intrarea este versiunea 1

- utilizați acest fișier de suprafață pentru structura și numărul de

vârfuri, ignorați granițele altor structuri

[-nifti-version-convert] - scrieți un fișier nifti cu o versiune diferită

- fișierul nifti de intrare - versiunea nifti pentru a scrie ca -
output - fișierul nifti de ieșire

[-cifti-version-convert] - scrieți un fișier cifti cu o versiune diferită

- fișierul cifti de intrare - versiunea cifti pentru a scrie ca
- output - fișierul cifti de ieșire

Puteți specifica o singură opțiune de nivel superior.

-fișier-informații LISTAȚI INFORMAȚII DESPRE CONȚINUTUL UNUI FIȘIER

wb_command -fișier-informații

- fișier de date

[-no-map-info] - nu afișează informații despre hărți pentru fișierele care acceptă hărți

[-only-step-interval] - suprima ieșirea normală, imprimă intervalul

între hărți

[-only-number-of-maps] - suprima ieșirea normală, imprimă numărul de hărți

[-only-map-names] - suprima ieșirea normală, imprimă numele tuturor hărților

Listați informații despre conținutul unui fișier de date.
Unul singur -numai opțiune

poate fi specificat.
Informațiile enumerate atunci când nr -numai opțiunea este prezentă

depinde de tipul fișierului de date.

-foci-get-proiecție-vertix OBȚINE VERTEX DE PROIECTIE PENTRU FOCI

wb_command -foci-get-proiecție-vertix

- dosarul focarelor - suprafata aferenta fisei focarelor
- ieșire - fișierul metric de ieșire

[-name] - selectați o focalizare după nume

- numele focarului

Pentru fiecare focus, este creată o coloană în , iar vârful cu cele mai multe
influența asupra proiecției sale i se atribuie o valoare de 1 în acea coloană, împreună cu toate celelalte
vârfuri 0. Dacă -Yam este utilizat, va fi folosit doar un focus.

-foci-list-coords COORDONATE DE FOCUL DE IEȘIRE ÎNTR-UN FIȘIER TEXT

wb_command -foci-list-coords

- Fișierul focarelor de intrare - ieșire - coordonatele de ieșire
fisier text

[-names-out] - scoate numele focarelor

- ieșire - fișier text pentru a pune numele focarelor

Ieșiți coordonatele pentru fiecare focalizare din fișierul focare și, opțional, focalizarea
nume într-un al doilea fișier text.

-foci-resantionare FOCUL DE PROIECT PE O SUPRAFAȚĂ ALTA

wb_command -foci-resantionare

- fișierul focarelor de intrare - output - fișierul focarelor de ieșire

[-left-surfaces] - suprafețele din stânga pentru reeșantionare

- suprafața pe care sunt proiectate în prezent focarele - cel
suprafață pe care să proiecteze focarele

[-right-surfaces] - suprafețele potrivite pentru reeșantionare

- suprafața pe care sunt proiectate în prezent focarele - cel
suprafață pe care să proiecteze focarele

[-cerebellum-surfaces] - suprafețele cerebelului pentru reeșantionare

- suprafața pe care sunt proiectate în prezent focarele - cel
suprafață pe care să proiecteze focarele

[-discard-distance-from-surface] - ignorați distanța pe care se află focarele deasupra

sau sub suprafața actuală

[-restore-xyz] - puneți coordonatele xyz originale în focare, mai degrabă

decât coordonatele obţinute din neproiecţie

Unproiects focusuri din pentru structură, apoi le proiectează
. Dacă focarele au distanțe semnificative deasupra sau sub suprafață, utilizați
suprafețe anatomice. Dacă focarele ar trebui să fie la suprafață, utilizați sfere înregistrate
si optiunile -distanta-de-aruncare-de-suprafata și -restaurare-xyz.

-gifti-all-labels-to-rois FACEȚI ROIS DIN TOATE Etichetele într-o coloană de cadouri

wb_command -gifti-all-labels-to-rois

- fișierul de intrare etichetă gifti - numărul sau numele hărții etichetei
a folosi - ieșire - fișierul metric de ieșire

Fișierul de valori de ieșire are o coloană pentru fiecare etichetă din harta de intrare specificată,
in afara de ??? etichetă, fiecare dintre ele conține un ROI al tuturor nodurilor care sunt
setată la eticheta corespunzătoare.

-gifti-convertit Convertiți fișierul GIFTI într-o codificare diferită

Utilizare:



codificare cadou

Codificare GIFTI necesară.

intrare-fișier-cadou

Este necesară introducerea numelui fișierului GIFTI.

ieșire-gifti-file

Numele fișierului GIFTI de ieșire necesar.

Codificări GIFTI valide:

ASCII BASE64_BINARY GZIP_BASE64_BINARY EXTERNAL_FILE_BINARY

-gifti-label-add-prefix ADĂUGAȚI PREFIX LA TOATE NUMELE DE ETICHETE ÎNTR-UN FIȘIER DE ETICHETE GIFTI

wb_command -gifti-label-add-prefix

- fișierul etichetă de intrare - șirul de prefix de adăugat -
output - fișierul de etichetă de ieșire

Pentru fiecare etichetă, alta decât „???”, adăugați înainte la numele etichetei.

-gifti-label-to-roi FĂ O ETICĂ CADOU ÎNTR-O METRICĂ ROI

wb_command -gifti-label-to-roi

- fișierul de intrare etichetă gifti - output - metrica de ieșire
fişier

[-name] - selectați eticheta după nume

- numele etichetei pentru care doriți să obțineți un roi

[-key] - selectați etichetă după tastă

- cheia de etichetă pentru care doriți un roi

[-map] - selectați o singură hartă de etichetă de utilizat

- numărul sau numele hărții

Pentru fiecare hartă în , este creată o hartă în unde toate locațiile
etichetat cu sau cu o cheie de li se acordă valoarea 1 și
toate celelalte locații sunt date 0. Exact una dintre -Yam și -cheie trebuie specificat.
Specifica -Hartă pentru a folosi o singură hartă din .

-eticheta-dilata DILATĂ UN FIȘIER DE ETICĂ

wb_command -eticheta-dilata

- eticheta de intrare - suprafata pe care sa se dilate -
distanta in mm pentru a dilata etichetele - output - fișierul de etichetă de ieșire

[-bad-vertex-roi] - specificați un roi de vârfuri de suprascris, mai degrabă decât

vârfuri cu cheia neetichetată - fișier metric, valorile pozitive denotă
vârfuri de a avea

valorile lor au fost înlocuite

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru a dilata

- numărul coloanei sau numele

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

Completează informațiile de etichetă pentru toate nodurile desemnate ca greșite, până la limita specificată
distanță de alte etichete. Dacă -bad-vertex-roi este specificat, toate nodurile,
inclusiv cele cu cheia neetichetată, sunt bune, cu excepția vârfurilor cu a
valoare pozitivă în rentabilitatea investiției. Dacă nu este specificat, numai vârfurile cu
cheile neetichetate sunt proaste.

-label-export-table TABEL DE ETICHETE DE EXPORT DIN GIFTI CA TEXT

wb_command -label-export-table

- fișierul etichetă de intrare - output - fișierul text de ieșire

Preia tabelul de etichete din fișierul de etichete gifti și îl scrie într-un format text
potrivindu-se cu ceea ce se asteapta de -metric-label-import.

-etichetă-mască MASTĂ UN FIȘIER ETICHETĂ

wb_command -etichetă-mască

- fișierul de etichete de mascat - metrica măștii - iesire -
fișierul de etichetă de ieșire

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

În mod implicit, eticheta de ieșire este o copie a etichetei de intrare, dar cu „neutilizat”
etichetați acolo unde metrica măștii nu este pozitivă. dacă -coloană este specificat, cel
ieșirea conține doar o coloană, versiunea mascata a coloanei de intrare specificate.

-etichetă-merge FUNCȚI FIȘIERE ETICHETE ÎNTR-UN FIȘIER NOU

wb_command -etichetă-merge

- ieșire - eticheta de ieșire

[-label] - repetabil - specifică o etichetă de intrare

- un fișier etichetă din care să folosiți coloanele

[-coloană] - repetabil - selectați o singură coloană de utilizat

- numărul coloanei sau numele

[-up-to] - utilizați o gamă inclusivă de coloane

- numărul sau numele ultimei coloane de inclus

[-reverse] - utilizați intervalul în ordine inversă

Preia unul sau mai multe fișiere de etichetă și construiește un fișier de etichetă nou prin concatenare
coloane din ele. Fișierele de intrare trebuie să aibă același număr de vârfuri și
aceeași structură.

Exemplu: wb_command -etichetă-merge out.label.gii -eticheta primul.etichetă.gii -coloană 1
-eticheta a doua.etichetă.gii

Acest exemplu ar lua prima coloană de la first.label.gii și toate subvolumele
de la second.label.gii și scrieți-le pe out.label.gii.

-etichetă-modificare-chei SCHIMBAȚI VALORILE CHEIE ÎNTR-UN FIȘIER DE ETICĂ

wb_command -etichetă-modificare-chei

- fișierul etichetă de intrare - fișier text cu cheie veche și nouă
valorile - ieșire - fișier etichetă de ieșire

[-coloană] - selectați o singură coloană de utilizat

- numărul coloanei sau numele

ar trebui să aibă linii de forma „oldkey newkey”, astfel:

3 5 5 8 8 2

Acest lucru ar schimba eticheta curentă cu tasta „3” pentru a utiliza în schimb tasta „5”, 5
ar folosi 8, iar 8 ar folosi 2. Orice coliziune a valorilor cheie are ca rezultat o etichetă
care nu a fost specificat în fișierul de remapare fiind remapat la un alt alt neutilizat
cheie. Remapează mai mult de o cheie la aceeași cheie nouă sau aceeași cheie la mai multe
o cheie nouă, duce la o eroare. Acest lucru nu va schimba aspectul fișierului
atunci când este afișat, va schimba cheile în date în același timp.

-etichetă-resantionare RESAMPLONAȚI UN FIȘIER DE ETICHETĂ LA O MĂSĂ DIFERITĂ

wb_command -etichetă-resantionare

- fișierul de etichetă de reeșantionat - o suprafata sfera cu
plasa care este fișierul de etichete

în prezent

- o suprafață sferă care este în registru cu

și are rețeaua de ieșire dorită

- numele metodei - output - fișierul de etichetă de ieșire

[-area-surfs] - specificați suprafețele pe care să faceți corecția zonei vârfurilor pe baza

- o suprafata anatomica relevanta cu

ochiurilor de plasă

- o suprafata anatomica relevanta cu plasă

[-area-metrics] - specificați valorile zonei de vârf pentru a face corectarea zonei

pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru plasă

[-current-roi] - utilizați un roi de intrare pe rețeaua curentă pentru a exclude non-date

vârfuri - roi, ca fișier metric

[-valid-roi-out] - afișează ROI-ul nodurilor care au primit date de la valid

vârfuri sursă - output - valoarea roi de ieșire ca metrică

[-largest] - utilizați numai eticheta vârfului cu cea mai mare greutate

Reeșantionează un fișier de etichetă, având în vedere două suprafețe sferice care sunt în registru. Dacă
metoda face corectarea zonei, exact una dintre -zona-surfuri or -zonă-metrică trebuie să fie
specificat.

-cel mai mare opțiunea are ca rezultat cel mai apropiat comportament de vârf atunci când este utilizată cu BARYCENTRIC,
folosește valoarea vârfului sursă care are cea mai mare pondere. Când -cel mai mare
nu este specificat, greutățile vârfurilor sunt însumate în funcție de eticheta lor
corespunde și se folosește eticheta cu cea mai mare sumă.

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

Metoda ADAP_BARY_AREA este recomandată pentru datele de etichetă, deoarece ar trebui să fie
mai bine la rezolvarea vârfurilor care sunt în apropierea mai multor etichete sau în caz de
subeșantionarea.

-label-to-border TRAGAȚI CHEMINURI ÎN jurul Etichetelor

wb_command -label-to-border

- suprafata de folosit pentru informatiile vecinilor - Intrarea
fișier etichetă - output - fișierul de margine de ieșire

[-placement] - setați cât de departe sunt desenate punctele de margine de-a lungul marginii

- fracțiune de-a lungul marginii din interiorul vârfului (implicit 0.33)

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

Pentru fiecare etichetă, găsește toate marginile rețelei care traversează limita etichetei,
și trasează granițe prin ele. În mod implicit, acest lucru se face pe toate coloanele din
fișier de intrare, folosind numele hărții ca nume de clasă pentru chenar.

-metadate-eliminare-provenență ELIMINAȚI INFORMAȚII DE PROVENȚĂ DIN METADATE FIȘIERULUI

wb_command -metadate-eliminare-provenență

- fisierul din care se elimina informatiile de provenienta -
output - numele ca să salveze fișierul modificat

Elimină câmpurile de metadate de proveniență adăugate de workbench în timpul procesării.

-metadate-string-inlocuire ÎNLOCUIȚI UN ȘIR ÎN TOATE METADALE UNUI FIȘIER

wb_command -metadate-string-inlocuire

- fișierul în care se înlocuiește metadatele - șirul de găsit
- sfoară de înlocuit cu - ieșire
- numele ca să salveze fișierul modificat

[-case-insensitive] - se potrivește și cu variația majusculelor

Înlocuiește toate aparițiile de în metadatele și numele hărților ale
cu .

-metric-convertire CONVERTĂ FIȘIERUL METRIC ÎN NIFTI FALS

wb_command -metric-convertire

[-to-nifti] - converti metric în nifti

- metrica de convertit - output - fișierul nifti de ieșire

[-from-nifti] - convertiți nifti în metrică

- fișierul nifti de convertit - fișier de suprafață pentru a utiliza numărul de
noduri si structura din - ieșire - fișierul metric de ieșire

Scopul acestei comenzi este de a converti între fișierele metrice și nifti1, astfel încât
programele gifti-unware pot opera pe date. Trebuie să specificați exact unul dintre
opțiunile.

-metric-dilata DILATĂ UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-dilata

- metrica de dilatare - suprafața pe care se calculează -
distanta in mm de dilatare - output - metrica de ieșire

[-bad-vertex-roi] - specificați un roi de vârfuri de suprascris, mai degrabă decât

vârfuri cu valoare zero - fișier metric, valorile pozitive denotă
vârfuri de a avea

valorile lor au fost înlocuite

[-data-roi] - specificați un roi unde există date

- fișier metric, valorile pozitive denotă vârfuri care au

de date

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru a dilata

- numărul coloanei sau numele

[-nearest] - utilizați cea mai apropiată valoare bună în loc de o medie ponderată

[-linear] - completați valorile cu interpolare liniară de-a lungul celei mai puternice

gradient

[-exponent] - utilizați un alt exponent în funcția de ponderare

- exponentul „n” de utilizat în (zonă / (distanță ^ n)) ca

funcția de ponderare (implicit 2)

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

Pentru toate nodurile metrice care sunt desemnate drept rele, dacă se învecinează cu un non-rea
vârf cu date sau se află în distanța specificată a unui astfel de vârf, înlocuiți
valoare cu o medie ponderată la distanță a vârfurilor apropiate care nu sunt greșite care au date,
în caz contrar setați valoarea la zero. Nu conteaza cat de mic este, dilatarea va
folosiți întotdeauna cel puțin vârfurile vecine imediate. Dacă - cel mai apropiat este specificat, ea
va folosi în schimb valoarea de la cel mai apropiat vârf care nu este rău cu date în interval
a unei medii ponderate.

If -bad-vertex-roi este specificat, numai vârfurile cu o valoare pozitivă în ROI sunt
rău. Dacă nu este specificat, numai vârfurile care au date, cu valoarea zero,
sunt rele. Dacă -data-roi nu este specificat, se presupune că toate nodurile au date.

Rețineți că -zone-corectate opțiunea folosește o corecție aproximativă pentru modificare
în distanțe de-a lungul unei suprafețe medii de grup.

-estimare-metrică-fwhm ESTIMARE FWHM NETEZEA UNUI FIȘIER METRIC

wb_command -estimare-metrică-fwhm

- suprafața de utilizat pentru informații despre distanță și vecinătate -
metrica de intrare

[-roi] - utilizați numai date dintr-un ROI

- fișierul metric de utilizat ca ROI

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru a estima netezimea

- numărul coloanei sau numele

Estimează netezimea coloanelor metrice, imprimând estimările la standard
ieșire. Aceste estimări ignoră variația spațierii vârfurilor.

-metric-extrema GĂSIȚI EXTREMA ÎNTR-UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-extrema

- suprafața de utilizat pentru informații despre distanță - metrica la
găsi extrema de - distanta minima dintre extremele identificate ale
la fel

tip

- output - metrica extrema de ieșire

[-presmooth] - netezește metrica înainte de a găsi extreme

- sigma pentru miezul de netezire gaussian, în mm

[-roi] - ignora valorile din afara zonei selectate

- zona în care se găsește extremele, ca metrică

[-threshold] - ignora extremele mici

- cea mai mare valoare de luat în considerare pentru a fi minimă - cel mai mic
valoare de luat în considerare pentru a fi un maxim

[-sum-columns] - scoateți suma coloanelor extreme în loc de fiecare

coloană separat

[-consolidate-mode] - utilizați consolidarea minimelor locale în loc de a

cartier mare

[-only-maxima] - găsiți doar maximele

[-only-minima] - găsiți doar minimele

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru a găsi extreme

- numărul coloanei sau numele

Găsește extreme într-un fișier metric, astfel încât să nu existe două extreme de același tip
în unul de altul. Extremele sunt etichetate ca -1 pentru minime, 1 pentru
maxima, 0 altfel. Dacă -doar-maxima or -doar-minime este specificat, atunci va fi
ignora extreme care nu sunt de tipul specificat. Aceste opțiuni se exclud reciproc.

If -Rege este specificat, nu numai că nu sunt utilizate datele din afara roiului, ci orice vârf activ
marginea ROI nu va fi niciodată socotită ca extremă, în cazul în care ROI scade
pe un gradient, care altfel ar genera extreme acolo unde ar trebui să existe
nici unul.

If -suma-coloane este specificat, aceste coloane extreme sunt însumate, iar rezultatul are
o singură coloană cu acest rezultat.

În mod implicit, un punct de date este o extremă numai dacă este mai extrem decât oricare altul
punctul de date care se află în interior din ea. Dacă -modul-consolidare este folosit, ea
în schimb, începe prin a găsi toate punctele de date care sunt mai extreme decât cele imediate
vecini, apoi în timp ce există orice extremă în interior unul de altul, luați
cele două extreme cele mai apropiate una de cealaltă și le îmbină într-una singură printr-o medie ponderată
pe baza câte extreme originale au fost îmbinate în fiecare.

În mod implicit, toate coloanele de intrare sunt utilizate fără netezire, utilizare -coloană pentru a specifica a
o singură coloană de utilizat și -netedă pentru a netezi intrarea înainte de a găsi
extrem.

-metric-fals-corelație COMPARAȚI CORELAȚIA LOCAL ȘI ÎN/PRIN SULCI/GYRI

wb_command -metric-fals-corelație

- suprafața cu care se calculează distanța geodezică și 3D - cel
metrica pentru a corela <3D-dist> - distanța maximă 3D de verificat în jurul fiecărui vârf
- distanta geodezică maximă de utilizat pentru vecinătate

corelație

- distanta geodezica minima de utilizat pentru vecini

corelație

- output - metrica de ieșire

[-roi] - selectați o regiune de interes care are date

- regiunea, ca fișier metric

[-dump-text] - descărcați măsurile brute utilizate într-un fișier text

- fișierul text de ieșire

Pentru fiecare vârf, calculați corelația medie într-un interval de geodezică
distante care nu traverseaza un sulcus/girus, si corelarea cu cel mai apropiat
vârf care traversează un sulcus/gyrus. Se consideră că un vârf traversează un sulcus/girus dacă
distanța 3D este mai mică de o treime din distanța geodezică. Fișierul de ieșire
conține raportul dintre aceste corelații și câteva hărți suplimentare de ajutor
explica raportul.

-metric-umple-găuri UMPLAȚI GĂURI ÎN-O METRIC ROI

wb_command -metric-umple-găuri

- suprafata de folosit pentru informatiile vecinilor - ROI-ul de intrare
metric - output - valoarea ROI de ieșire

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

Găsește toate zonele conectate care nu sunt incluse în rentabilitatea investiției și le scrie pe cele
toate, cu excepția celui mai mare, din punct de vedere al suprafeței.

-metric-găsi-clustere FILTRAȚI CLUSTELE DUPĂ ZONA DE SUPRAFAȚĂ

wb_command -metric-găsi-clustere

- suprafața pe care se calculează - metrica de intrare
- prag pentru valorile datelor - prag pentru
aria clusterului, în mm^2 - output - metrica de ieșire

[-mai puțin decât] - găsiți valori mai mici decât , Decat

mai mare

[-roi] - selectați o regiune de interes

- roiul, ca metrică

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

[-size-ratio] - ignoră grupurile mai mici decât o anumită fracțiune a

cel mai mare grup de pe hartă - fracțiunea din suprafața celui mai mare cluster

[-distanță] - ignoră grupurile aflate la o distanță dată de

cel mai mare cluster - cât de departe de cel mai mare cluster poate fi un cluster,
margine

la muchie, în mm

[-start] - începe etichetarea clusterelor de la o altă valoare decât 1

- valoarea de dat primul cluster găsit

Afișează o metrică cu numere întregi diferite de zero pentru toate nodurile într-un spațiu suficient de mare
cluster și zerouri în altă parte. Numerele întregi denotă apartenența la cluster (în mod implicit,
primul cluster găsit va folosi valoarea 1, al doilea cluster 2 etc). Implicit, valori
mai mare ca sunt considerate a fi într-un cluster, utilizați -mai puțin decât la
testați pentru valori mai mici decât pragul. Pentru a aplica acest lucru ca mască datelor sau
pentru a face un prag mai complicat, vezi -metric-matematică.

-metric-gradient GRADIENTUL SUPRAFAȚEI UNUI DOSAR METRIC

wb_command -metric-gradient

- suprafața pe care se calculează gradientul - metrica la
calcula gradientul de - output - magnitudinea gradientului

[-presmooth] - netezește metrica înainte de a calcula gradientul

- sigma pentru miezul de netezire gaussian, în mm

[-roi] - selectați o regiune de interes pentru a lua gradientul

- zona în care se ia gradientul, ca metrică

[-match-columns] - pentru fiecare coloană de intrare, utilizați coloana corespunzătoare

din roi

[-vectors] - vectori gradient de ieșire

- ieșire - vectorii ca fișier metric

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru a calcula gradientul

- numărul coloanei sau numele

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-average-normals] - medie a normalelor fiecărui vârf cu sale

vecinii înainte de a le folosi pentru a calcula gradientul

La fiecare vârf, vecinii imediati sunt desfășurați pe un plan tangent la
suprafața la vârf (în special, perpendicular pe normal). Gradientul este
calculate folosind o regresie între pozițiile desfășurate ale vârfurilor și
valorile lor. Gradientul este dat apoi de pantele regresiei și
reconstruit ca un vector gradient 3D. În mod implicit, ia gradientul tuturor
coloane, fără pre-netezire, pe toată suprafața, fără a media
normale ale suprafeţei între vecini.

Atunci când se utilizează -zone-corectate, rețineți că este o corecție aproximativă. Face
se preferă netezirea pe suprafeţe individuale înainte de mediere/gradient, când
posibil, pentru a utiliza structura originală a suprafeței.

Specificarea unei rentabilități a investiției va restricționa gradientul pentru a utiliza numai date de unde este rentabilitatea investiției
metrica este pozitivă și zerouri de ieșire oriunde valoarea ROI nu este pozitivă.

În mod implicit, prima coloană a valorii roi este utilizată pentru toate coloanele de intrare. Când
-coloane de potrivire este specificat la -Rege opțiunea, valorile de intrare și roi trebuie să aibă
același număr de coloane și pentru fiecare index al coloanei de intrare, aceeași coloană
indicele este utilizat în metrica roi. Dacă -coloane de potrivire opțiunea pentru -Rege este utilizat
in timp ce -coloană este de asemenea utilizată opțiunea, numărul de coloane din metrica roi trebuie
potriviți valoarea de intrare și va folosi coloana roi cu indexul
coloana de intrare selectată.

Metrica de ieșire vectorială este organizată astfel încât componentele X, Y și Z din a
o singură coloană de intrare sunt coloane consecutive.

-metric-label-import IMPORTAȚI UN FIȘIER DE ETICHETE GIFTI DIN UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-label-import

- fișierul de metrică de intrare - fișier text care conține valorile
și nume pentru etichete - output - fișierul de etichete gifti de ieșire

[-discard-others] - setați orice valori care nu sunt menționate în lista de etichete la

??? eticheta

[-unlabeled-value] - setați valoarea care va fi interpretată ca neetichetată

- valoarea numerică pentru neetichetat (implicit 0)

[-coloană] - selectați o singură coloană de importat

- numărul coloanei sau numele

[-drop-unused-labels] - eliminați orice valoare de etichetă neutilizată din etichetă

tabel

Creează un nou fișier de etichetă gifti dintr-un fișier de valori cu valori asemănătoare etichetei. Poţi
specificați șirul gol ('' va funcționa pe linux/mac) pentru , care
va fi tratat ca și cum ar fi un fișier gol. Fișierul cu lista de etichete trebuie să aibă linii de
urmatorul format:



Nu specificați cheia „fără etichetă” în fișier, se presupune că 0 înseamnă că nu
etichetat dacă nu -valoare-neetichetată este specificat. Numele etichetelor trebuie să fie separat
linie, dar poate conține spații sau alte caractere neobișnuite (dar nu linie nouă).
Spațiile albe sunt tăiate de la ambele capete ale numelui etichetei, dar sunt păstrate dacă se află în
mijlocul unei etichete. Valorile roșu, verde, albastru și alfa trebuie să fie numere întregi din
de la 0 la 255 și va specifica culoarea în care este desenată eticheta (alfa de 255 înseamnă
opac, care este probabil ceea ce doriți). În mod implicit, va seta noi nume de etichetă
cu nume de LABEL_# pentru orice valori întâlnite care nu sunt menționate în listă
fisier, precizati -arunca-altii pentru a seta în schimb acești voxeli la cheia „neetichetată”.

-mască-metrică MASCHEA UN FIȘIER METRIC

wb_command -mască-metrică

- metrica de intrare - metrica măștii - ieșire - the
metrica de ieșire

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

În mod implicit, valoarea de ieșire este o copie a valorii de intrare, dar cu zerouri
oriunde metrica măștii nu este pozitivă. dacă -coloană este specificat, ieșirea
conține doar o coloană, versiunea mascata a coloanei de intrare specificate.

-metric-matematică EVALUAȚI EXPRESIA PE FIȘIERE METRICE

wb_command -metric-matematică

- expresia a evalua, între ghilimele - ieșire - the
metrica de ieșire

[-fixnan] - înlocuiți rezultatele NaN cu o valoare

- valoarea cu care se înlocuiește NaN

[-var] - repetabil - o metrică de utilizat ca variabilă

- numele variabilei, așa cum este utilizat în expresie - metrica
fișier de utilizat ca această variabilă

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

[-repeat] - reutilizați o singură coloană pentru fiecare coloană de calcul

Această comandă evaluează la fiecare vârf de suprafață în mod independent. Acolo
trebuie să fie cel puțin unul -var opțiunea (pentru a obține structura, numărul de vârfuri și
numărul de coloane de la), chiar dacă specificat în acesta nu este folosit în
. Toate valorile trebuie să aibă același număr de vârfuri. Numele de fișiere sunt
nu este valabil în , utilizați un nume de variabilă și a -var opțiunea cu potrivire
pentru a specifica un fișier de intrare. Dacă -coloană opțiunea este dată oricărui -var
opțiunea, este utilizată o singură coloană din acel fișier. Dacă -repeta este specificat, fișierul
trebuie fie să aibă o singură coloană, fie să aibă -coloană opțiunea specificată. Toate filele
care nu folosesc -repeta trebuie să aibă același număr de coloane solicitate pentru a fi utilizate.
Formatul de este după cum urmează:

Expresiile constau din constante, variabile, operatori, paranteze și funcții,
în notație infixă, cum ar fi „exp(-x + 3) * scară'. Variabilele sunt șiruri de orice
lungime, folosind caracterele az, AZ, 0-9 și _, dar nu poate lua numele unui
numită constantă. În prezent, există o singură constantă numită PI. Operatorii
sunt +, -, *, /, ^, >, <, >=, <=, ==, !=, !, &&, ||. Acestea se comportă ca în C, cu excepția
că ^ este exponențiație, adică pow(x, y), și are o prioritate mai mare decât altele
operatori binari (de asemenea, '-3^-4^-5' înseamnă '-(3^(-(4^-5)))'). <=, >=, == și !=
operatorilor li se oferă o cantitate mică de spațiu de mișcare, egală cu o milioneme din
mai mică dintre valorile absolute ale valorilor comparate.

Operatorii de comparație și logici returnează 0 sau 1, puteți face mascarea cu expresii
precum „x * (mască > 0)”. Pentru toți operatorii logici, o intrare este considerată adevărată dacă
este mai mare decât 0. Expresia „0 < x < 5” nu este greșită din punct de vedere sintactic, dar
NU va face ceea ce se dorește, deoarece este evaluat de la stânga la dreapta, adică „((0
x) < 5)', care va returna întotdeauna 1, așa cum sunt ambele rezultate posibile ale unei comparații
mai mic de 5. Se generează un avertisment dacă este detectată o expresie de acest tip.
Utilizați ceva de genul „x > 0 && x < 5” pentru a obține comportamentul dorit.

Spațiul alb dintre elemente este ignorat, „ sin ( 2 * x ) ” este echivalent cu
„sin(2*x)”, dar „s in(2*x)” este o eroare. Înmulțirea implicită nu este permisă,
expresia „2x” va fi analizată ca variabilă. Parantezele sunt (), nu se folosesc
[] sau {}. Funcțiile necesită paranteze, expresia „sin x” este o eroare.

Sunt acceptate următoarele funcții:

sin: 1 argument, sinusul argumentului (unitățile sunt radiani) cos: 1 argument, the
cosinus al argumentului (unitățile sunt radiani) tan: 1 argument, tangenta lui
argument (unitățile sunt radiani) asin: 1 argument, inversul sinusului argumentului,
în radiani acos: 1 argument, inversul cosinusului argumentului, în radiani
atan: 1 argument, inversul tangentei argumentului, în radiani atan2: 2
argumente, atan2(y, x) returnează inversul tangentei lui

(y/x), în radiani, determinând cadranul după semnul ambelor argumente

sinh: 1 argument, sinusul hiperbolic al argumentului cosh: 1 argument, the
cosinus hiperbolic al argumentului tanh: 1 argument, tangenta hiperbolocă a lui
argument asinh: 1 argument, sinusul hiperbolic invers al argumentului acosh: 1
argument, cosinusul hiperbolic invers al argumentului atanh: 1 argument, the
tangenta hiperboloc inversă a argumentului ln: 1 argument, logaritmul natural al
argumentul exp: 1 argument, constanta e ridicată la puterea argumentului
log: 1 argument, logaritmul de bază 10 al argumentului sqrt: 1 argument, pătratul
rădăcina argumentului abs: 1 argument, valoarea absolută a argumentului etaj: 1
argument, cel mai mare întreg nu mai mare decât runda argumentului: 1 argument, the
cel mai apropiat număr întreg, cu legăturile rotunjite la o distanță de

zero

ceil: 1 argument, cel mai mic număr întreg nu mai mic decât argumentul min: 2 argumente,
min(x, y) returnează y dacă (x > y), x altfel max: 2 argumente, max(x, y) returnează y
dacă (x < y), x altfel mod: 2 argumente, mod(x, y) = x - y * floor(x / y), sau 0 dacă
y == 0 clamp: 3 argumente, clamp(x, low, high) = min(max(x, low), high)

-metric-merge FUNCȚI FIȘIERE METRICE ÎNTR-UN FIȘIER NOU

wb_command -metric-merge

- output - metrica de ieșire

[-metric] - repetabil - specifică o metrică de intrare

- un fișier de valori din care să folosești coloanele

[-coloană] - repetabil - selectați o singură coloană de utilizat

- numărul coloanei sau numele

[-up-to] - utilizați o gamă inclusivă de coloane

- numărul sau numele ultimei coloane de inclus

[-reverse] - utilizați intervalul în ordine inversă

Preia unul sau mai multe fișiere de metrică și construiește un fișier de metrică nou prin concatenare
coloane din ele. Fișierele de valori de intrare trebuie să aibă același număr de vârfuri
și aceeași structură.

Exemplu: wb_command -metric-merge out.func.gii -metric primul.func.gii -coloană 1
-metric secunda.func.gii

Acest exemplu ar lua prima coloană de la first.func.gii, urmată de all
coloane din second.func.gii și scrieți aceste coloane în out.func.gii.

-metric-palette SETĂ PALETA UNUI FIȘIER METRIC

wb_command -metric-palette

- metrica de modificat - modul de cartografiere

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

[-pos-percent] - procentaj min/max pentru colorarea datelor pozitive

- percentila pentru cele mai puțin pozitive date - cel
percentila pentru datele cele mai pozitive

[-neg-percent] - procentaj min/max pentru colorarea datelor negative

- percentila pentru datele cele mai puțin negative - cel
percentila pentru datele cele mai negative

[-pos-user] - valori min/max ale utilizatorului pentru colorarea datelor pozitive

- valoarea pentru cele mai puțin pozitive date - valoarea
pentru cele mai pozitive date

[-neg-user] - valorile min/max ale utilizatorului pentru colorarea datelor negative

- valoarea pentru cele mai puțin negative date - valoarea
pentru cele mai negative date

[-interpolate] - interpolează culorile

- boolean, dacă se interpolează

[-disp-pos] - afișează date pozitive

- boolean, dacă să fie afișat

[-disp-neg] - afișați date pozitive

- boolean, dacă să fie afișat

[-disp-zero] - afișați datele mai aproape de zero decât limita minimă

- boolean, dacă să fie afișat

[-palette-name] - setează paleta utilizată

- numele paletei

[-thresholding] - setează pragul

- setarea pragului - afișează valori în interiorul sau în afara pragurilor
- pragul inferior - pragul superior

Fișierul de valori inițial este suprascris cu versiunea modificată.
By

implicit, toate coloanele din fișierul metric sunt ajustate la noile setări, utilizați
-coloană opțiunea de a schimba o singură coloană. Setările de cartografiere nu sunt specificate în
opțiunile vor fi preluate din prima coloană. The argumentul trebuie să fie unul dintre
următoarele:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

The argument la -nume-paleta trebuie să fie unul dintre următoarele:

PSYCH PSYCH-NU-NIMIC ROY-BIG ROY-BIG-BL Portocaliu-Galben Gri_Interp_Pozitiv
Gray_Interp clear_brain videen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG roșu-galben albastru-albastru deschis FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256

The argument la -pragării trebuie să fie unul dintre următoarele:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

The argument la -pragării trebuie să fie unul dintre următoarele:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-metric-reduce Efectuați OPERAȚIUNEA DE REDUCERE ÎN PRIN COLOANELE METRICE

wb_command -metric-reduce

- metrica de redus - operatorul de reducere de utilizat
- output - metrica de ieșire

[-exclude-outliers] - exclude valorile aberante din fiecare vector prin standard

deviere - numărul de abateri standard sub media până la

include

- numărul de abateri standard peste medie până la

include

Pentru fiecare vârf de suprafață, ia datele pe coloane ca un vector și funcționează
reducerea specificată pe aceasta, punând rezultatul în coloana de ieșire unică la
acel vârf. Operatorii de reducere sunt următorii:

MAX: valoarea maximă MIN: valoarea minimă INDEXMAX: indicele bazat pe 1 al
valoarea maximă INDEXMIN: indicele bazat pe 1 al valorii minime SUM: adăugați toate valorile
PRODUS: înmulțiți toate valorile MEDIA: media datelor STDEV: standardul
abatere (numitorul N) SAMPSTDEV: abaterea standard a eșantionului (N-1
numitor) VARIANCE: varianţa datelor MEDIANA: mediana datelor
MODE: modul datelor COUNT_NONZERO: numărul de elemente nenule din
de date

-metric-regresie REGRESE METRICA DIN UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-regresie

- metrica de la care să regresezi - output - metrica de ieșire

[-roi] - regresează doar în interiorul unui roi

- aria de utilizat pentru regresie, ca metrică

[-coloană] - selectați o singură coloană din care să regresați

- numărul coloanei sau numele

[-remove] - repetabil - specifică o măsurătoare pentru a regresa

- fișierul metric de utilizat

[-remove-column] - selectați o coloană de utilizat, mai degrabă decât toate

- numărul coloanei sau numele

[-keep] - repetabil - specifică o valoare de inclus în regresie, dar nu

elimina - fișierul metric de utilizat

[-keep-column] - selectați o coloană de utilizat, mai degrabă decât toate

- numărul coloanei sau numele

Pentru fiecare regresor, media sa pe suprafață este scăzută din datele sale. Fiecare
Harta de intrare este apoi regresată față de acestea și un termen constant. Rezultați
pante regresizate ale tuturor regresorilor specificati cu -elimina sunt multiplicate cu lor
hărțile regresoare respective, iar acestea sunt scăzute din harta de intrare.

-metric-elimină-insule ELIMINAȚI INSULELE DIN O METRICĂ ROI

wb_command -metric-elimină-insule

- suprafata de folosit pentru informatiile vecinilor - ROI-ul de intrare
metric - output - valoarea ROI de ieșire

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

Găsește toate zonele conectate în rentabilitatea investiției și le pune la zero pe toate, cu excepția celei mai mari, în
din punct de vedere al suprafeței.

-metric-resantionare RESAMPLONAȚI UN FIȘIER METRIC ÎNTR-O OPERE DIFERITĂ

wb_command -metric-resantionare

- fișierul metric de reeșantionat - o suprafata sfera cu
plasa care este metrica

în prezent

- o suprafață sferă care este în registru cu

și are rețeaua de ieșire dorită

- numele metodei - output - metrica de ieșire

[-area-surfs] - specificați suprafețele pe care să faceți corecția zonei vârfurilor pe baza

- o suprafata anatomica relevanta cu

ochiurilor de plasă

- o suprafata anatomica relevanta cu plasă

[-area-metrics] - specificați valorile zonei de vârf pentru a face corectarea zonei

pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru plasă

[-current-roi] - utilizați un roi de intrare pe rețeaua curentă pentru a exclude non-date

vârfuri - roi, ca fișier metric

[-valid-roi-out] - afișează ROI-ul nodurilor care au primit date de la valid

vârfuri sursă - output - valoarea roi de ieșire ca metrică

[-major] - utilizați numai valoarea vârfului cu cea mai mare pondere

Reeșantionează un fișier metric, având în vedere două suprafețe sferice care sunt în registru. Dacă
metoda face corectarea zonei, exact una dintre -zona-surfuri or -zonă-metrică trebuie să fie
specificat.

-current-roi opțiunea maschează doar intrarea, ieșirea poate fi ușor dilatată
comparație, luați în considerare utilizarea -mască-metrică pe ieșire la utilizare -current-roi.

-cel mai mare opțiunea are ca rezultat cel mai apropiat comportament de vârf atunci când este utilizată cu BARYCENTRIC,
în loc să facă o medie ponderată, folosește valoarea vârfului sursă care
are cea mai mare greutate pentru fiecare vârf țintă. Acest lucru este destinat în principal
reeșantionarea valorilor ROI.

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

Metoda ADAP_BARY_AREA este recomandată pentru datele metrice obișnuite, deoarece aceasta
ar trebui să utilizeze toate datele în timpul eșantionării, spre deosebire de BARYCENTRIC.

-metric-rois-din-extrema CREAȚI HĂRȚI METRICE ROI DIN HĂRȚI EXTREMA

wb_command -metric-rois-din-extrema

- suprafața de utilizat pentru distanța geodezică - metrica de intrare
fişier - limita distanței geodezice de la vârf, în mm - iesire -
fișierul metric de ieșire

[-gaussian] - generează un nucleu gaussian în loc de un ROI plat

- sigma pentru nucleul gaussian, în mm

[-roi] - selectați o regiune de interes de utilizat

- zona de utilizat, ca metrică

[-overlap-logic] - cum să gestionați suprapunerea ROI-urilor, implicit ALLOW

- metoda de rezolvare a suprapunerilor

[-coloană] - selectați o singură coloană de intrare de utilizat

- numărul coloanei sau numele

Pentru fiecare valoare diferită de zero din fiecare hartă, creați o hartă cu un ROI în jurul locației respective.
În cazul în care -gaussian este specificată opțiunea, apoi sunt ieșite nucleele gaussiene normalizate
în loc de rentabilitatea investiției. The argument la -logica-suprapunere trebuie să fie unul dintre PERMISI,
CEL MAI APROPIAT sau EXCLUDE. ALLOW este valoarea implicită și înseamnă că ROI-urile sunt tratate
independent și se pot suprapune. CLOEST înseamnă că rentabilitatea investiției nu se poate suprapune și asta
niciun ROI nu conține vârfuri care sunt mai aproape de un alt vârf de semințe. EXCLUDE înseamnă
că ROI-urile nu se pot suprapune și că orice vârf în intervalul mai mult de o ROI
nu aparține niciunui ROI.

-metric-rois-to-border trageți margini în jurul valorii de ROIS METRIC

wb_command -metric-rois-to-border

- suprafata de folosit pentru informatiile vecinilor - metrica de intrare
care conțin ROI - numele de utilizat pentru clasa de margini de ieșire
- output - fișierul de margine de ieșire

[-placement] - setați cât de departe sunt desenate punctele de margine de-a lungul marginii

- fracțiune de-a lungul marginii din interiorul vârfului (implicit 0.33)

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

Pentru fiecare coloană ROI, găsește toate marginile rețelei care traversează limita
ROI și trasează granițe prin ele. În mod implicit, acest lucru se face pe toate coloanele din
fișierul de intrare, folosind numele hărții ca nume pentru graniță.

-metric-netezire NETEZIȚI UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-netezire

- suprafata pentru a netezi - metrica pentru a netezi
- sigma pentru funcția nucleu gaussian, în mm
- output - metrica de ieșire

[-roi] - selectați o regiune de interes pentru a netezi

- Roi pentru a netezi în interior, ca măsurătoare

[-match-columns] - pentru fiecare coloană de intrare, utilizați coloana corespunzătoare

din roi

[-fix-zeros] - tratează valorile zero ca nefiind date

[-coloană] - selectați o singură coloană pentru a netezi

- numărul coloanei sau numele

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

[-method] - selectați metoda de netezire, implicit GEO_GAUSS_AREA

- denumirea metodei de netezire

Neteziți un fișier metric pe o suprafață.
În mod implicit, netezește toate coloanele de intrare

pe toata suprafata, precizati -coloană pentru a utiliza o singură coloană de intrare și -Rege la
netedă numai acolo unde metrica roi este mai mare decât 0, scoțând zerouri în altă parte.

Atunci când se utilizează -Rege, datele de intrare din afara ROI nu sunt utilizate pentru a calcula netezirea
valorile. În mod implicit, prima coloană a valorii roi este utilizată pentru toate intrările
coloane. Când -coloane de potrivire este specificat la -Rege opțiunea, intrarea și roi
valorile trebuie să aibă același număr de coloane, iar pentru fiecare index al coloanei de intrare,
același indice de coloană este utilizat în metrica roi. Dacă -coloane de potrivire opțiunea pentru
-Rege este folosit în timp ce -coloană este de asemenea folosită opțiunea, numărul de coloane trebuie
potrivire între valoarea roi și valoarea de intrare și va folosi coloana roi cu
indexul coloanei de intrare selectate.

-fix-zerouri opțiunea face ca netezirea să nu folosească o valoare de intrare dacă este zero,
dar totuși scrieți o valoare netezită la vârf. Acest lucru este util pentru zerouri care
indică lipsa de informații, împiedicându-i să reducă intensitatea
vârfuri apropiate, dând în același timp zeroului o valoare extrapolată.

-zone-corectate opțiunea este destinată atunci când este inevitabil să netezi pe a
suprafața medie a grupului, este doar o corecție aproximativă pentru reducerea
structura într-o suprafață medie de grup. Este mai bine să netezi datele
indivizi înainte de medie, atunci când este fezabil.

Valori valabile pentru sunteți:

GEO_GAUSS_AREA - folosește un nucleu geodezic gaussian și se normalizează pe baza vârfului
zonă pentru a lucra mai fiabil pe suprafețe neregulate

GEO_GAUSS_EQUAL - folosește un nucleu gaussian geodezic și se normalizează presupunând fiecare
vârful are o importanță egală

GEO_GAUSS - se potrivește netezirea geodezică gaussiană din caret5, dar nu verifică
sâmburi pentru a avea o importanță inegală

Metoda GEO_GAUSS_AREA este implicită, deoarece este de obicei alegerea corectă.
GEO_GAUSS_EQUAL poate fi alegerea corectă atunci când suma valorilor vârfurilor este mai mare
semnificativă atunci integrala de suprafață (suma valorilor .* zone), de exemplu când
netezirea zonelor de vârf (suma este suprafața totală, în timp ce suprafața
integrală este suma pătratelor ariilor vârfurilor). Metoda GEO_GAUSS nu este
recomandat, există în principal pentru a replica metode de studii făcute cu caret5
netezire geodezică.

-metric-stats STATISTICA SPAȚIALĂ PE UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-stats

- metrica de intrare

[-reduce] - folosește o operație de reducere

- operatia de reducere

[-percentila] - dați valoarea la o percentilă

- percentila de găsit

[-coloană] - afișează numai rezultatul pentru o coloană

- numărul coloanei sau numele

[-roi] - luați în considerare numai datele din interiorul unui roi

- roi, ca fișier metric

[-match-maps] - fiecare coloană de intrare folosește coloana corespunzătoare

din dosarul roi

[-show-map-name] - imprimați indexul hărții și numele înainte de fiecare ieșire

Pentru fiecare coloană a intrării este tipărit un singur număr, rezultat din
operație de reducere sau percentilă specificată. Utilizare -coloană pentru a da numai ieșire pentru a
o singură coloană. Utilizare -Rege să ia în considerare numai datele dintr-o regiune. Exact unul dintre
-reduce or -percentila trebuie specificat.

Argumentul către -reduce opțiunea trebuie să fie una dintre următoarele:

MAX: valoarea maximă MIN: valoarea minimă INDEXMAX: indicele bazat pe 1 al
valoarea maximă INDEXMIN: indicele bazat pe 1 al valorii minime SUM: adăugați toate valorile
PRODUS: înmulțiți toate valorile MEDIA: media datelor STDEV: standardul
abatere (numitorul N) SAMPSTDEV: abaterea standard a eșantionului (N-1
numitor) VARIANCE: varianţa datelor MEDIANA: mediana datelor
MODE: modul datelor COUNT_NONZERO: numărul de elemente nenule din
de date

-metric-tfce FACEȚI TFCE PE UN FIȘIER METRIC

wb_command -metric-tfce

- suprafața pe care se calculează - metrica pe care să rulați TFCE
- output - metrica de ieșire

[-presmooth] - netezește metrica înainte de a rula TFCE

- sigma pentru miezul de netezire gaussian, în mm

[-roi] - selectați o regiune de interes pe care să rulați TFCE

- zona pe care se rulează TFCE, ca metrică

[-parametri] - setați parametrii pentru integrala TFCE

- exponent pentru zona clusterului (implicit 1.0) - exponent pentru valoarea de prag
(implicit 2.0)

[-coloană] - selectați o singură coloană

- numărul coloanei sau numele

[-corrected-areas] - zone de vârf de utilizat în loc de a le calcula

suprafata - ariile de vârfuri corectate, ca metrică

Îmbunătățirea clusterului fără prag este o metodă de creștere a valorii relative a
regiuni care ar forma clustere într-un test standard de prag. Aceasta este
realizat prin evaluarea integralei a:

e(h, p)^E * h^H * dh

la fiecare vârf p, unde h variază de la 0 la valoarea maximă a datelor și e(h,
p) este întinderea clusterului care conține vârful p la pragul h. Negativ
valorile sunt îmbunătățite în mod similar prin negarea datelor, rularea aceluiași proces și
negând rezultatul.

Atunci când se utilizează -netedă implementate cu -zone-corectate, rețineți că este aproximativ
corecție în cadrul algoritmului de netezire (corecția TFCE este exactă). Face
netezirea pe suprafețe individuale înainte de mediere/TFCE este de preferat, atunci când este posibil,
pentru a lega mai bine dimensiunea nucleului de netezire de dimensiunea caracteristică originală.

Metoda TFCE este explicată în: Smith SM, Nichols TE., „Threshold-free cluster
îmbunătățire: abordarea problemelor de netezire, dependență de prag și
localizare în inferența cluster.” Neuroimage. 2009 ian 1;44(1):83-98. PMID:
18501637

-maparea-metric-la-volum HARTĂ FIȘIER METRIC LA VOLUM

wb_command -maparea-metric-la-volum

- fișierul de metrică de intrare - suprafata din care se foloseste coordonatele
- un fișier de volum în spațiul de volum de ieșire dorit -
output - fișierul volumului de ieșire

[-nearest-vertex] - folosește valoarea de la vârful cel mai apropiat de voxel

centru - cât de departe de suprafață pentru a mapa valorile la voxeli, în mm

[-ribbon-constrained] - folosește algoritmul de mapare cu constrângere panglică

- suprafața interioară a panglicii - suprafaţa exterioară a
panglica

[-voxel-subdiv] - diviziunile voxelilor în timp ce se estimează greutățile voxelilor

- numărul de subdiviziuni, implicit 3

Mapează valorile dintr-un fișier de valori într-un fișier de volum.
Trebuie să specificați

exact o opțiune de metodă de mapare.
- cel mai apropiat vârf metoda foloseste

valoare de la vârful cel mai apropiat de centrul voxelului (utilă pentru valori întregi). The
-constrâns de panglică metoda folosește aceeași metodă ca în -cartarea-volum-la-suprafață,
apoi folosește greutățile în sens invers.

-operaţie-metrică-vectorală FACEȚI O OPERAȚIE VECTORALĂ PE FIȘIERE METRICE

wb_command -operaţie-metrică-vectorală

- primul fișier de intrare vectorial - al doilea fișier de intrare vectorial
- ce operație vectorială să faci - output - fișierul de ieșire

[-normalize-a] - normalizează vectorii primei intrări

[-normalize-b] - normalizează vectorii a doua intrare

[-normalize-output] - normalizează vectorii de ieșire (nu este valabil pentru dot

produs)

[-magnitude] - afișează mărimea rezultatului (nu este valabil pentru dot

produs)

Efectuează o operație vectorială pe două fișiere metrice (care trebuie să aibă un multiplu de 3
coloane). Oricare dintre intrări poate avea mai mulți vectori (mai mult de 3 coloane),
dar nu ambele (cel puțin una trebuie să aibă exact 3 coloane). The -magnitudinea și
-normalizare-ieșire opțiunile pot să nu fie specificate împreună sau cu o operațiune care
returnează un scalar (produs punctual). The parametrul trebuie să fie unul dintre
Următor:

CU CRUCE ADAUGĂ SCADĂ

-metric-vector-spre-roi GĂSIȚI DACĂ VECTORII INDICĂ CARE UN ROI

wb_command -metric-vector-spre-roi

- suprafața pe care se calculează - Roi pentru a găsi cel mai scurt
cale spre - output - metrica de ieșire

[-roi] - nu calculați pentru vârfuri din afara unui roi

- regiunea de calculat în interior, ca metrică

La fiecare vârf, calculați vectorul de-a lungul începutului celei mai scurte căi către ROI.

-statistici-ponderate-metrice STATISTICI SPAȚIALE PONDERATE PE UN FIȘIER METRIC

wb_command -statistici-ponderate-metrice

- metrica de intrare

[-area-surface] - folosiți zonele de vârf ca ponderi

- suprafața de utilizat pentru zonele de vârf

[-weight-metric] - utilizați ponderi dintr-un fișier de metrică

- fișier metric care conține greutățile

[-coloană] - afișează numai rezultatul pentru o coloană

- numărul coloanei sau numele

[-roi] - luați în considerare numai datele din interiorul unui roi

- roi, ca fișier metric

[-match-maps] - fiecare coloană de intrare folosește coloana corespunzătoare

din dosarul roi

[-mean] - calculează media ponderată

[-stdev] - calculează abaterea standard ponderată

[-eșantion] - estimați stdev populației din eșantion

[-percentila] - calculează percentila ponderată

- percentila de găsit

[-sum] - calculează suma ponderată

[-show-map-name] - imprimați indexul hărții și numele înainte de fiecare ieșire

Pentru fiecare coloană a intrării este tipărit un singur număr, rezultat din
operațiune specificată. Utilizare -coloană pentru a oferi numai rezultate pentru o singură coloană. Utilizare
-Rege să ia în considerare numai datele dintr-o regiune. Exact unul dintre -reduce or
-percentila trebuie specificat și exact unul dintre -Rău, -stdev, -percentila or
-sumă trebuie specificat.

Utilizarea -sumă implementate cu -zonă-suprafață (Sau -greutate-metrică cu o metrică care conține similare
date) este echivalent cu integrarea în raport cu suprafața. De exemplu, dacă
doriți să găsiți suprafața într-un roi, procedați astfel:

$ wb_command -metric-weighted-stats roi.func.gii -sum -area-surface

midthickness.surf.gii

-nifti-informatii AFIȘAȚI INFORMAȚII DESPRE UN FIȘIER NIFTI/CIFTI

wb_command -nifti-informatii

- dosarul nifti/cifti de examinat

[-print-header] - afișează conținutul antetului

[-print-matrix] - scoateți valorile în matrice (numai cifti)

[-print-xml] - imprimă XML cifti (numai cifti)

[-version] - convertiți XML într-o anumită versiune CIFTI (implicit este

versiunea cifti a fișierului) - versiunea CIFTI de utilizat

Trebuie să specificați cel puțin unul -imprimare-* opțiune.

-probtrackx-dot-convert CONVERȚI UN FIȘIER .DOT DIN PROBTRACKX ÎN CIFTI

wb_command -probtrackx-dot-convert

- introduceți fișierul .dot - ieșire - fișier cifti de ieșire

[-row-voxels] - maparea de ieșire de-a lungul unui rând va fi voxeli

- un fișier text care conține indici IJK pentru voxeli

utilizat

- un volum de eticheta cu dimensiunile si forma folosita, cu

etichete de structură

[-row-surface] - maparea de ieșire de-a lungul unui rând va fi vârfuri de suprafață

- un fișier metric cu valori pozitive pe toate nodurile utilizate

[-row-cifti] - preia maparea de-a lungul unui rând dintr-un fișier cifti

- fișierul cifti din care să ia maparea - la ce dimensiune
luați harta de-a lungul, RÂND sau COLONA

[-col-voxels] - maparea de ieșire de-a lungul unei coloane va fi voxeli

- un fișier text care conține indici IJK pentru voxeli

utilizat

- un volum de eticheta cu dimensiunile si forma folosita, cu

etichete de structură

[-col-surface] - maparea de ieșire de-a lungul unei coloane va fi de suprafață

vârfuri - un fișier metric cu valori pozitive pe toate nodurile utilizate

[-col-cifti] - luați maparea de-a lungul unei coloane dintr-un fișier cifti

- fișierul cifti din care să ia maparea - la ce dimensiune
luați harta de-a lungul, RÂND sau COLONA

[-transpose] - transpune matricea de intrare

[-make-symmetric] - transformă intrarea de jumătate de pătrat în ieșire matrice completă

NOTĂ: exact unul -rând opțiune și una -col trebuie folosită opțiunea.

Dacă fișierul de intrare nu are indecșii sortați în ordinea corectă, aceasta
comanda poate dura mai mult decât se aștepta. Precizând -transpune va transpune
matricea de intrare înainte de a încerca să-și pună valorile în fișierul cifti, adică
este necesar în prezent pentru cel puțin matricea 2 pentru a o afișa așa cum este prevăzut. Cum
fișierul cifti este afișat se bazează pe care -rând se specifica optiunea: daca -row-voxels
este specificat, apoi va afișa date pe felii de volum. Numele etichetelor din
volumul (volumele) de etichetă trebuie să aibă următoarele nume, celelalte nume sunt ignorate:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-set-hărți-nume SETĂ NUMELE UNEI SAU MAI MULTOR HĂRȚI ÎNTR-UN FIȘIER

wb_command -set-hărți-nume

- fișierul pentru a seta numele hărții

[-name-file] - utilizați un fișier text pentru a înlocui toate numele hărților

- fișier text care conține numele hărților, câte unul pe linie

[-map] - repetabil - specificați o hartă pentru a seta numele

- indexul hărții pentru a schimba numele - numele de setat pentru
Hartă

Setează numele uneia sau mai multor hărți pentru metrică, formă, etichetă, volum, cifti scalar sau
fișiere de etichete cifti. Dacă -nume-fișier nu este specificată opțiunea -Hartă opțiunea trebuie
fi specificat cel puțin o dată. The -Hartă opțiunea nu poate fi folosită când -nume-fișier is
specificat.

-set-structură SETARE STRUCTURA UNUI FIȘIER DE DATE

wb_command -set-structură

- fișierul pentru a seta structura - structura de fixat
fișierul către

[-surface-type] - setează tipul unei suprafețe (utilizat numai dacă fișierul este un

fișier de suprafață) - denumirea tipului de suprafață

[-surface-secondary-type] - setează tipul secundar al unei suprafețe (numai

folosit dacă fișierul este un fișier de suprafață) - denumirea tipului secundar de suprafață

Fișierul existent este modificat și rescris cu același nume de fișier.
Valabil

valorile pentru numele structurii sunt:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT CEREBELLUM ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBEL_DREPTA CEREBRAL_ALB_MATERIALE_STÂNGA CEREBRAL_ALB_MATERIULUI_DREPTA CORTEX
DIENCEPHALON_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALON_VENTRAL_RIGHT HIPPOCAMPUS_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Numele valide pentru tipul de suprafață sunt:

RECONSTRUCȚIE NECUNOSCUT ANATOMIC UMFLAT FOARTE_UMFLAT SFERIC SEMI_SFERIC
COCA PLATĂ ELIPSOIDĂ

Numele valide pentru tipul secundar de suprafață sunt:

PIAL DE GROSIME MEDIA GRI_ALB INVALID

-spectacol-scenă RENDAREA SCENEI ÎN FĂRĂ ECRAN LA UN FIȘIER IMAGINĂ

wb_command -spectacol-scenă

- fișierul scenei - nume sau număr (începând cu unu)
a scenei în

fisierul scenei

- numele fișierului imagine de ieșire - lățimea imaginii (imaginilor) de ieșire
- înălțimea imaginii (imaginilor) de ieșire

Redați conținutul ferestrelor browserului afișat într-o scenă în fișiere imagine. The
Numele fișierului imagine ar trebui să fie similar cu „capture.png”. Dacă există o singură imagine pentru
randați, numele imaginii nu se va schimba. Dacă există mai multe imagini de randat,
va fi inserat un index în numele imaginii: „capture_01.png”, „capture_02.png”
etc

Formatul imaginii este determinat de extensia fișierului imagine. Formate de imagine
disponibile pe acest sistem sunt:

bmp ico jpeg jpg png ppm tif tiff xbm xpm

Notă: Formatele de imagine disponibile pot varia în funcție de sistemul de operare.

-semnat-distanţa-la-suprafaţă CALCULATEAZA DISTANTA SEMNATA DE LA O SUPRAFATA LA ALTA

wb_command -semnat-distanţa-la-suprafaţă

- suprafața de comparație pe care se măsoară distanța semnată
- suprafata de referinta care defineste distanta semnata

funcţie

- output - metrica de ieșire

[-winding] - metoda de înfășurare pentru încercarea punctului interior al suprafeței

- numele metodei (implicit EVEN_ODD)

Calculați funcția de distanță semnată a suprafeței de referință la fiecare vârf de pe
suprafata de comparatie. NOTĂ: această relație NU este simetrică, linia de la a
vârf la cel mai apropiat punct de pe suprafața „ref” (cel care definește semnul
funcție de distanță) se va alinia doar cu normala suprafeței „ref”. Valabil
specificatorii pentru metodele de bobinare sunt următorii:

EVEN_ODD (implicit) NORMALE NEGATIVE NON-NERO

Metoda NORMALE utilizează normalele triunghiurilor și muchiilor sau cel mai apropiat triunghi
lovită de o rază din punct. Această metodă poate fi puțin mai rapidă, dar este doar
fiabil pentru o suprafață închisă care nu trece prin ea însăși. Toti ceilalti
metodele numără trecerile de intrare (pozitive) și de ieșire (negative) ale unei raze verticale din
punctul, apoi contează ca în interior dacă totalul este impar, negativ sau diferit de zero,
respectiv.

-spec-file-merge FUNCȚI DOUĂ FIȘIERE DE SPECIFICAȚI ÎN UNUL

wb_command -spec-file-merge

- primul fișier cu specificații de îmbinat - al doilea fișier cu specificații de îmbinat
- ieșire - fișier de specificații de ieșire

Fișierul cu specificații de ieșire conține fiecare fișier care se află în oricare dintre fișierele cu specificații de intrare.

-regresie-afina de suprafata REGRESAȚI TRANSFORMAREA AFINĂ DINTRE SUPRAFEȚE PE ACEEAȘI ȚIE

wb_command -regresie-afina de suprafata

- suprafata de deformat - suprafața care să se potrivească cu coordonatele
- output - fișierul afin de ieșire

Utilizați regresia liniară pentru a calcula o afină care minimizează suma pătratelor lui
diferențele de coordonate dintre suprafața țintă și suprafața sursei deformate.
Rețineți că aceasta are o tendință de a micșora suprafața care este deformată. Ieșirea
este scrisă ca o matrice „lume” NIFTI, vezi -convertit-afin pentru a-l converti pentru utilizare în
alt software.

-suprafață-aplicare-afină APLICAȚI TRANSFORMAREA AFINE LA FIȘIERUL DE SURFACE

wb_command -suprafață-aplicare-afină

- suprafata de transformat - fisierul afin - ieșire
- suprafaţa transformată de ieşire

[-flirt] - TREBUIE folosit dacă afine este un afin de flirt

- volumul sursă utilizat la generarea afinei
- volumul țintă utilizat la generarea afinei

Pentru matricele de flirt, trebuie să utilizați -flirt opțiune, deoarece matricele de flirt nu sunt
o descriere completă a transformării de coordonate pe care o reprezintă. Dacă -flirt
opțiunea nu este prezentă, afinul trebuie să fie o afină „lume” nifti, care poate fi
obtinut cu -convertit-afin comandă sau aff_conv din suita 4dfp.

-suprafață-aplicare-warpfield APLICAȚI WARPFIELD LA FIȘIERUL DE SURFACE

wb_command -suprafață-aplicare-warpfield

- suprafata de transformat - câmpul warp INVERS
- ieșire - suprafața transformată de ieșire

[-fnirt] - TREBUIE folosit dacă se folosește un fnirt warpfield

- câmpul warp înainte

NOTĂ: deformarea unei suprafețe necesită inversarea câmpului warp folosit pentru a deforma
volumul cu care se aliniază. Antetul warp-ului înainte este necesar -fnirt
opțiune pentru a interpreta corect deplasările în câmpul warp fnirt.

În cazul în care -fnirt opțiunea nu este prezentă, câmpul warp trebuie să fie o „lume” nifti
warpfield, care poate fi obținut cu -convert-warpfield comanda.

-suprafață-medie FIȘIERE DE SURFACE MEDIE ÎMPREUNĂ

wb_command -suprafață-medie

- output - suprafața medie a ieșirii

[-stddev] - calculează abaterea standard a eșantionului 3D

- output - metrica de ieșire pentru eșantionul 3D

deviație standard

[-uncertainty] - calculează caret5 „incertitudine”

- output - metrica de ieșire pentru incertitudine

[-surf] - repetabil - specifică o suprafață de inclus în medie

- un fișier de suprafață la medie

Abaterea standard a eșantionului 3D este calculată ca „sqrt(sum(squaredlength(xyz -
medie(xyz)))/(n - 1))'.

Incertitudinea este o măsură moștenită utilizată în caret5 și este calculată ca „sum(lungime(xyz
- medie(xyz)))/n'.

-suprafață-cel mai apropiat-vârf GĂSIȚI CEL MAI APROPRIAT VERTEX DE SURFAFĂ DE COORDONATE

wb_command -suprafață-cel mai apropiat-vârf

- suprafata de utilizat - fișier text cu coordonatele
- output - fișierul text de ieșire cu numere de vârf

Pentru fiecare triplă de coordonate XYZ, găsiți cel mai apropiat vârf din suprafață și ieșiți
numărul de vârf într-un fișier text.

-coordonatele-suprafeței-la-metrică REALIZATI DOSARUL METRIC AL COORDONATELOR DE SURFACE

wb_command -coordonatele-suprafeței-la-metrică

- suprafata de utilizat coordonatele - ieșire - the
metrica de ieșire

Pune coordonatele suprafeței într-un fișier metric cu 3 hărți, ca x, y, z.

-suprafata-strat-cortex CREAȚI SUPRAFAȚĂ APROXIMAND UN STRAT CORTICAL

wb_command -suprafata-strat-cortex

- suprafața substanței albe - suprafaţa pialului
- la ce fracție de volum să plaseze stratul - iesire -
suprafața de ieșire

[-placement-out] - scoateți plasarea ca o fracțiune de distanță față de pial

la alb - output - output metric

[-untwist] - opțiune temporară pentru compararea metodelor, specificați pentru a utiliza vechi

metodă

Suprafețele de intrare trebuie să aibă corespondență de vârf.
Suprafața de ieșire

este generată prin plasarea vârfurilor între cele două suprafețe astfel încât să fie închis
volumul în cadrul oricărui petic mic al suprafețelor noi și albe este fracțiunea dată
a volumului aceluiași plasture între suprafața pial și albă (adică,
specificând 0 ar da suprafața albă, 1 ar da suprafața pial).

-suprafata-creeaza-sfera GENERAȚI O SFERĂ CU ZONE DE VERTEX COHERENTE

wb_command -suprafata-creeaza-sfera

- numărul dorit de vârfuri - ieșire - ieșire
sferă

Generează o sferă prin împărțirea regulată a triunghiurilor unui icosaedru, care urmează
cât mai aproape de numărul dorit de vârfuri posibil și modificându-l pentru a avea
zone de vârf foarte asemănătoare pentru toate vârfurile. Pentru a genera o pereche de vertex-matched
sferele stânga și dreapta, folosiți această comandă, atunci -surface-flip-lr pentru a genera
altă sferă, atunci -set-structură pe fiecare. De exemplu:

$ wb_command -surface-create-sphere 6000 Sphere.6k.R.surf.gii
$ wb_command -surface-flip-lr Sphere.6k.R.surf.gii Sphere.6k.L.surf.gii
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.R.surf.gii CORTEX_RIGHT
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.L.surf.gii CORTEX_LEFT

-suprafață-tăiat-reeșantionare RESAMPLONAȚI O SUPRAFĂȚĂ TĂIETĂ

wb_command -suprafață-tăiat-reeșantionare

- fișierul de suprafață de reeșantionat - o suprafață de sferă
cu plasa pe care suprafața de intrare

este în prezent

- o suprafață sferă care este în registru cu

și are rețeaua de ieșire dorită

- output - fișierul suprafeței de ieșire

Reeșantionează un fișier de suprafață, având în vedere două suprafețe sferice care sunt în registru.
Se folosește reeșantionarea baricentrică, deoarece este de obicei mai bună pentru reeșantionare
suprafețe și pentru că oricum este necesar să se descopere noua topologie.

-suprafata-distorsiunea MĂSURAȚI DISTORSIUNEA ÎNTRE SUPRAFEȚE

wb_command -suprafata-distorsiunea

- suprafata de referinta - cele distorsionate
suprafaţă - output - metrica distorsiunii la ieșire

[-smooth] - netezește datele zonei

- sigma nucleului de netezire în mm

[-caret5-method] - utilizați metoda de distorsiune a suprafeței de la caret5

[-edge-method] - calculează distorsiunea lungimii marginilor mai degrabă decât a zonelor

Această comandă, atunci când nu este utilizată -caret5-metoda or -metoda-marginea, este echivalent cu utilizarea
-suprafaţa-vertex-ariile pe fiecare suprafață, netezind ambele valori de ieșire cu
metoda GEO_GAUSS_EQUAL pe suprafata de la care au venit daca -neted este specificat și
apoi folosind formula „ln (distorsionat/referință)/ln(2)' pe rezultatele netezite.

Atunci când se utilizează -caret5-metoda, folosește metoda distorsiunii suprafeței de la caret5, care
ia jurnalul de bază 2 al raportului dintre suprafețele de plăci, apoi face media acestor rezultate la
fiecare vârf și apoi netezește rezultatul pe suprafața de referință.

Atunci când se utilizează -metoda-marginea, -neted opțiunea este ignorată și ieșirea la fiecare
vârful este media lui 'abs(ln(refEdge/distortEdge)/ln(2))' ​​peste toate marginile
conectat la vârf.

-surface-flip-lr Oglindiți o suprafață prin avionul YZ

wb_command -surface-flip-lr

- suprafața de răsturnat - ieșire - suprafața inversată de ieșire

Această comandă anulează coordonatele x a fiecărui vârf și răstoarnă suprafața
normale, astfel încât să aveți o suprafață de mâna opusa cu aceleași caracteristici
și corespondența nodurilor, cu normale compatibile cu suprafața originală. Acea
este, dacă suprafața de intrare are normale îndreptate spre exterior, suprafața de ieșire va fi și ea
au normalii cu fața spre exterior.

-surface-flip-normals ROTOARE TOATE PLACILE PE O SUPRAFAȚA

wb_command -surface-flip-normals

- suprafața pentru a răsturna normalele - ieșire - ieșire
suprafaţă

Întoarce toate triunghiurile de pe o suprafață, ceea ce duce la răsturnarea normalelor de suprafață
altă direcție (în interior vs în exterior). Dacă transformi o suprafață cu o afină
care are un determinant negativ sau un câmp warp care inversează în mod similar suprafața, tu
poate ajunge la o suprafață care are valori normale îndreptate spre interior, care poate avea afișare
Probleme. Folosirea acestei comenzi va rezolva problema.

-suprafață-generează-umflat SUPRAFAȚA GENERATE UMFLATĂ

wb_command -suprafață-generează-umflat

- suprafata anatomica - iesire -
suprafața umflată de ieșire - ieșire - ieșire foarte
suprafata umflata

[-iterations-scale] - scalare opțională a iterațiilor

- iterații-valoare la scară

Generați suprafețe umflate și foarte umflate. Suprafețele de ieșire sunt „potrivite”
(au același interval XYZ) la suprafața anatomică. În cele mai multe cazuri, o scară de iterații
de 1.0 (implicit) este suficient. Cu toate acestea, dacă suprafața conține un număr mare de
noduri (150,000), încercați o scară de iterații de 2.5.

-suprafață-geodezică-distanță CALCULATEAZA DISTANTA GEODEZICA DE LA UN VEREX LA TOATA SUPRAFATA

wb_command -suprafață-geodezică-distanță

- suprafața pe care se calculează - vârful pentru a calcula geodezică
distanta de la - output - metrica de ieșire

[-naive] - folosiți numai vecini, nu accesați triunghiurile cu crawlere (nu este recomandat)

[-limit] - opriți la o anumită distanță

- distanta in mm la care se poate opri

dacă nu -limită este specificat, calculează distanța geodezică față de cea specificată
vârf la toate celelalte. Rezultatul este scos ca un fișier de valori cu o singură coloană, cu a
Valoarea -1 pentru vârfurile pentru care distanța nu a fost calculată. Dacă -naiv nu este
specificat, folosește nu doar vecini imediati, ci și vecini derivati ​​din
târându-se prin perechi de triunghiuri care împărtășesc o margine.

-suprafata-geodezic-rois TRAGAȚI GEODESIC ROIS LIMITAT LA VERTICELE

wb_command -suprafata-geodezic-rois

- suprafata pe care se deseneaza - limita distanței geodezice de la vârf,
în mm - un fișier text care conține vârfurile pentru a desena ROI-urile

în jurul

- output - metrica de ieșire

[-gaussian] - generează un nucleu gaussian în loc de un ROI plat

- sigma pentru nucleul gaussian, în mm

[-overlap-logic] - cum să gestionați suprapunerea ROI-urilor, implicit ALLOW

- metoda de rezolvare a suprapunerilor

[-names] - denumește coloanele din fișierul text

- un fișier text care conține nume de coloane, câte unul pe linie

Pentru fiecare vârf din fișierul listă, este creată o coloană în metrica de ieșire și un
ROI în jurul acelui vârf este desenat în acea coloană. Fiecare coloană de valori va avea zerouri
în afara distanţei geodezice spaţiate de , iar implicit va avea un
valoare de 1.0 în interiorul acestuia. Dacă -gaussian este specificată opțiunea, valorile din interior
ROI va forma în schimb un gaussian cu valoarea specificată a sigma, normalizat
astfel încât suma valorilor diferite de zero din coloana metrică este 1.0. The
argument pentru -logica-suprapunere trebuie să fie unul dintre PERMITERE, CEL MAI APROAPE sau EXCLUDE. ALLOW este
implicit și înseamnă că ROI-urile sunt tratate independent și se pot suprapune. CEL MAI APROPIAT
înseamnă că ROI-urile nu se pot suprapune și că niciun ROI nu conține vârfuri mai apropiate
la un alt vârf de semințe. EXCLUDE înseamnă că ROI-urile nu se pot suprapune și că oricare
vârful în intervalul mai mult de o ROI nu aparține niciunei ROI.

-suprafață-umflare INFLAȚIA SUPRAFĂȚEI

wb_command -suprafață-umflare

- suprafata anatomica - dosarul de suprafață la
umfla - numărul de cicluri de netezire
- puterea de netezire (interval [0.0 - 1.0])
- netezirea iterațiilor - factorul de inflatie
- ieșire - fișier de suprafață de ieșire

Umflați o suprafață efectuând cicluri care constau în netezire urmată de
umflare (pentru a corecta contracția cauzată de netezire).

-informații-de-suprafață AFIȘAȚI INFORMAȚII DESPRE O SUPRAFAȚĂ

wb_command -informații-de-suprafață

- Suprafața pentru care sunt afișate informații

Sunt afișate informații despre suprafață, inclusiv vârfuri, triunghiuri, casete de delimitare,
și spațierea.

-potrivire-suprafață POSIBILITATE DE SURFACE

wb_command -potrivire-suprafață

- Se potrivește (de referință) la suprafață - Dosar
suprafata care contine care va fi transformata - Fișier de suprafață
după transformare

Fișierul de suprafață de intrare va fi transformat astfel încât intervalele de coordonate ale acestuia (limitând
caseta) se potrivesc cu cea a fișierului de suprafață de potrivire

-suprafață-modificare-sferă SCHIMBAȚI RAZA ȘI OPȚIONAL RECENTĂ O SFERĂ

wb_command -suprafață-modificare-sferă

- sfera de modificat - raza pe care ar trebui să o iasă sfera de ieșire
avea - ieșire - sfera de ieșire

[-recenter] - recentrează sfera prin intermediul casetei de delimitare

Această comandă poate fi utilă dacă ați folosit -suprafață-resantionare a reeșantiona o sferă,
care pot suferi de probleme în general neprezente în
-suprafata-sfera-proiect-neproiect. Dacă sfera ar trebui să fie deja centrată în jur
originea, folosind -recentrează se poate schimba ușor înainte de a schimba raza,
ceea ce este probabil să fie de nedorit.

Dacă nu este aproape de sferic sau nu este centrat în jurul originii și
-recentrează nu este utilizat, este imprimat un avertisment.

-normale de suprafață IEȘIȚI NORMALE VERTEX CA FIȘIER METRIC

wb_command -normale de suprafață

- suprafața de ieșire a normalelor - ieșire - normalul
vectori

Calculează vectorii normali ai fișierului de suprafață și îi scoate pe 3 coloane
fișier metric.

-suprafață-resantionare RESAMPLONAȚI O SUPRAFAȚĂ LA O MARE DIFERITĂ

wb_command -suprafață-resantionare

- fișierul de suprafață de reeșantionat - o suprafață de sferă
cu plasa pe care suprafața de intrare

este în prezent

- o suprafață sferă care este în registru cu

și are rețeaua de ieșire dorită

- numele metodei - output - fișierul suprafeței de ieșire

[-area-surfs] - specificați suprafețele pe care să faceți corecția zonei vârfurilor pe baza

- o suprafata relevanta cu plasă - A
suprafata relevanta cu plasă

[-area-metrics] - specificați valorile zonei de vârf pentru a face corectarea zonei

pe - un fișier metric cu zone de vârf pentru

ochiurilor de plasă

- un fișier metric cu zone de vârf pentru plasă

Reeșantionează un fișier de suprafață, având în vedere două suprafețe sferice care sunt în registru. Dacă
metoda face corectarea zonei, exact una dintre -zona-surfuri or -zonă-metrică trebuie să:
fi specificat. Această opțiune nu este utilizată în circumstanțe normale, dar este prevăzută
completitudine.

The argumentul trebuie să fie unul dintre următoarele:

ADAP_BARY_AREA BARYCENTRIC

Metoda BARICENTRICĂ este recomandată pentru suprafețele anatomice, cu excepția cazului în care sunt
destul de aspru, pentru a minimiza netezirea.

Pentru suprafețe tăiate (inclusiv hărți plate), utilizați -suprafață-tăiat-reeșantionare.

În loc să reeșantioneze o suprafață sferică, -suprafata-sfera-proiect-neproiect
se recomandă comanda.

- netezirea suprafetei NETEZIREA SUPRAFEȚEI

wb_command - netezirea suprafetei

- pila de suprafata sa netezi - puterea de netezire
(intervalele [0.0 - 1.0]) - netezirea iterațiilor -
output - fișier de suprafață de ieșire

Netezește o suprafață prin medierea nodurilor cu vecinii lor.

-suprafata-sfera-proiect-neproiect DEFORMĂ O SFERĂ DUPĂ O ÎNREGISTRARE

wb_command -suprafata-sfera-proiect-neproiect

- sfera cu rețeaua de ieșire dorită - A
sferă care se aliniază cu sphere-in - sfera-proiect-la
deformat în spațiul de ieșire - ieșire - sfera de ieșire

Fiecare vârf al este proiectat să a obtine
greutăți baricentrice, care sunt apoi folosite pentru a dezaproiecta din .
Rezultă o sferă cu topologia de , dar coordonatele s-au schimbat
prin deformarea dintre și .
și trebuie să aibă aceeași topologie ca fiecare
altele, dar poate avea o topologie diferită.

-distanta-3d-suprafata-la-suprafata CALCULATEAZA DISTANTA INTRE VERTICELE CORESPONDENTE

wb_command -distanta-3d-suprafata-la-suprafata

- suprafața de comparat cu referința - cel
suprafață de folosit ca referință - ieșire - distanțele de ieșire

[-vectors] - scoate vectorii de deplasare

- ieșire - vectorii de ieșire

Calculează diferența vectorială dintre vârfurile fiecărei suprafețe cu aceeași
index, ca (comp - ref) și scoateți magnitudinele și, opțional, deplasarea
vectori.

-suprafaţa-vertex-ariile MĂSURĂ AREA SUPRAFEȚEI DE CARE FIECARE VERTEX ESTE RESPONSABIL

wb_command -suprafaţa-vertex-ariile

- suprafata de masurat - output - metrica de ieșire

Fiecare vârf primește o treime din aria fiecărui triunghi din care face parte.

-suprafata-pana-volum MĂSURAȚI VOLUMUL PER-VERTEX ÎNTRE SUPRAFEȚE

wb_command -suprafata-pana-volum

- suprafata interioara - suprafața exterioară -
output - metrica de ieșire

Calculați volumul ariei fiecărui vârf de la o suprafață la alta. Suprafetele
trebuie să aibă corespondență de noduri.

-test unitar

-volum-afin-resantionare RESAMPLATE VOLUMUL FOLOSIND TRANSFORMA AFINĂ

wb_command -volum-afin-resantionare

- volum de reeșantionat - fisierul afin de aplicat
- un fișier de volum în spațiul de volum pe care îl doriți pentru

producție

- metoda reeșantionării - ieșire - volumul de ieșire

[-flirt] - TREBUIE folosit dacă afine este un afin de flirt

- volumul sursă utilizat la generarea afinei
- volumul țintă utilizat la generarea afinei

Reeșantionați un fișier de volum cu o transformare afină.
Recomandată

metodele sunt CUBIC (spline cubic) pentru majoritatea datelor și ENCLOSING_VOXEL pentru datele de etichetă.
Parametrul trebuie să fie unul dintre:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-volum-toate-etichetele-la-rois FACEȚI ROIS DIN TOATE Etichetele într-un cadru de volum

wb_command -volum-toate-etichetele-la-rois

- fișierul etichetei volumului de intrare - numărul sau denumirea etichetei
harta de utilizat - output - fișierul volumului de ieșire

Volumul de ieșire are un cadru pentru fiecare etichetă din cadrul de intrare specificat, altele
decât ??? etichetă, fiecare dintre ele conține un ROI al tuturor voxelilor care sunt setate la
eticheta corespunzătoare.

-plan-captură-volum INTERPOLAȚI IMAGINEA DIN AVION PRIN VOLUM

wb_command -plan-captură-volum

- fișierul de volum din care se interpolează - numele sau numărul de
subvolumul de utilizat - tipul de interpolare - lățimea imaginii de ieșire,
în pixeli - înălțimea imaginii de ieșire, în pixeli - valoare de redat
ca negru - valoarea pentru a reda ca alb - coordonata x a
partea stângă jos a imaginii de ieșire - coordonata y a fundului
stânga imaginii de ieșire - coordonata z din stânga jos a
imaginea de ieșire - coordonata x din dreapta jos a ieșirii
imagine - coordonata y din dreapta jos a imaginii de ieșire
- coordonata z din dreapta jos a imaginii de ieșire
- coordonata x din stânga sus a imaginii de ieșire -
coordonata y din stânga sus a imaginii de ieșire - coordonata z a
stânga sus a imaginii de ieșire - ieșire - imaginea de ieșire

NOTĂ: Dacă doriți să generați o imagine cu toate capabilitățile GUI
redare, vezi -spectacol-scenă.

Redă o imagine a unui plan arbitrar prin fișierul de volum, cu un simplu
paletă liniară în tonuri de gri. Parametrul trebuie să fie unul dintre:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-volum-copiere-extensii COPIAȚI DATELE EXTINSE ÎN ALLT FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-copiere-extensii

- fișierul de volum care conține datele voxel de utilizat
- fișierul de volum care conține extensiile de utilizat - ieșire - the
volumul de ieșire

[-drop-unknown] - nu copiați extensii pe care workbench nu le înțelege

Această comandă copiază informațiile dintr-un fișier de volum care nu este o parte critică
antetul standard sau matricea de date, de exemplu, numele hărților, setările paletei, tabele de etichete.
If -drop-necunoscut nu este specificat, de asemenea, copiază tipuri similare de set de informații
prin alt software.

-volum-creare CREAȚI UN FIȘIER DE VOLUM GOL

wb_command -volum-creare

- lungimea primei dimensiuni - lungimea celei de-a doua dimensiuni -
lungimea dimensiunii a treia - ieșire - volumul de ieșire

[-plumb] - setat prin ordinea axei și spațiere/offset

- un șir de caractere precum „XYZ” care specifică care este index

care dimensiune spaţială

- modificarea coordonatei x din creșterea relevantei

index

- modificarea coordonatei y de la creșterea relevantei

index

- modificarea coordonatei z din creșterea celei relevante

index

- coordonata x a primului voxel - coordonata y a
primul voxel - coordonata z a primului voxel

[-sform] - setat printr-un nifti sform

- creșterea coordonatei x din creșterea indicelui i
- creșterea coordonatei x din creșterea indicelui j - crestere in
coordonata x din incrementarea indicelui k - coordonata x a primului voxel
- creșterea coordonatei y din creșterea indicelui i
- creșterea coordonatei y din creșterea indicelui j - crestere in
coordonata y din incrementarea indicelui k - coordonata y a primului voxel
- creșterea coordonatei z din creșterea indicelui i
- creșterea coordonatei z din creșterea indicelui j - crestere in
coordonata z din creșterea indicelui k - coordonata z a primului voxel

Creează un fișier de volum plin de zerouri.
Exact unul dintre -plumb or -sform

trebuie specificat.

-volum-dilata DILAȚI UN FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-dilata

- volumul de dilatat - distanta in mm pana la dilatare -
metoda de dilatare de utilizat - ieșire - volumul de ieșire

[-bad-voxel-roi] - specificați un roi de voxeli de suprascris, mai degrabă decât

voxeli cu valoarea zero - fișier de volum, valorile pozitive denotă voxeli la
avea

valorile lor au fost înlocuite

[-data-roi] - specificați un roi unde există date

- fișier de volum, valorile pozitive denotă voxeli care au

de date

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a dilata

- numărul sau numele subvolumului

Pentru toți voxelii care sunt desemnați ca rele, dacă se învecinează cu un voxel care nu este rău
date sau se află în distanța specificată a unui astfel de voxel, înlocuiți valoarea din
voxel defectuos cu o valoare calculată din voxeli nedeficienți din apropiere care au date,
în caz contrar setați valoarea la zero. Nu conteaza cat de mic este, dilatarea va
folosiți întotdeauna cel puțin voxelurile vecine de față.

În mod implicit, voxelii care au date cu valoarea 0 sunt proaste, specificați -bad-voxel-roi
pentru a număra voxelii ca fiind rele numai dacă sunt selectați de roi. Dacă -data-roi nu este
specificat, se presupune că toți voxelii au date.

Valori valabile pentru sunteți:

NEAREST - utilizați valoarea de la cel mai apropiat voxel bun WEIGHTED - utilizați un ponderat
medie bazată pe distanță

-estimare-volum-fwhm ESTIMARE FWHM NETEZEA UNUI VOLUM

wb_command -estimare-volum-fwhm

- volumul de intrare

[-roi] - utilizați numai date dintr-un ROI

- volumul de utilizat ca ROI

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a estima netezimea

- numărul sau numele subvolumului

Estimează netezimea volumului de intrare în direcțiile X, Y și Z separat,
imprimarea estimărilor la ieşirea standard. Dacă -subvolum nu este specificat, fiecare
subvolumul este estimat și afișat separat.

-volum-extrema GĂSIȚI EXTREMA ÎNTR-UN FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-extrema

- fișier de volum pentru a găsi extremele - distanta minima
între extremele identificate ale aceluiași

tip

- output - volumul extrema de ieșire

[-presmooth] - netezește volumul înainte de a găsi extreme

- sigma pentru miezul de netezire gaussian, în mm

[-roi] - ignora valorile din afara zonei selectate

- zona in care se gaseste extreme

[-threshold] - ignora extremele mici

- cea mai mare valoare de luat în considerare pentru a fi minimă - cel mai mic
valoare de luat în considerare pentru a fi un maxim

[-sum-subvols] - scoateți suma subvolumelor extreme în loc de fiecare

subvolum separat

[-consolidate-mode] - utilizați consolidarea minimelor locale în loc de a

cartier mare

[-only-maxima] - găsiți doar maximele

[-only-minima] - găsiți doar minimele

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a găsi extreme

- numărul sau numele subvolumului

Găsește extreme într-un fișier de volum, astfel încât să nu existe două extreme de același tip
în unul de altul. Extremele sunt etichetate ca -1 pentru minime, 1 pentru
maxima, 0 altfel. Dacă -doar-maxima or -doar-minime este specificat, atunci va fi
ignora extreme care nu sunt de tipul specificat. Aceste opțiuni se exclud reciproc.

If -sum-subvols este specificat, aceste subvolume extreme sunt însumate și rezultatul
are un singur subvolum cu acest rezultat.

În mod implicit, un punct de date este o extremă numai dacă este mai extrem decât oricare altul
punctul de date care se află în interior din ea. Dacă -modul-consolidare este folosit, ea
în schimb, începe prin a găsi toate punctele de date care sunt mai extreme decât cele imediate
vecini, apoi în timp ce există orice extremă în interior unul de altul, luați
cele două extreme cele mai apropiate una de cealaltă și le îmbină într-una singură printr-o medie ponderată
pe baza câte extreme originale au fost îmbinate în fiecare.

În mod implicit, toate subvolumele de intrare sunt utilizate fără netezire, utilizare -subvolum la
specificați un singur subvolum de utilizat și -netedă pentru a netezi intrarea înainte
găsirea extremelor.

-volum-umplere-găuri UMPLU GĂURI ÎN UN VOLUM ROI

wb_command -volum-umplere-găuri

- volumul ROI de intrare - output - volumul ROI de ieșire

Găsește toate părțile conectate la față care nu sunt incluse în rentabilitatea investiției și umple toate, dar
cea mai mare cu unele.

-grupuri-de-găsirea-volumului FILTRAȚI CLUSTELE DUPĂ VOLUM

wb_command -grupuri-de-găsirea-volumului

- volumul de intrare - prag pentru valorile datelor
- pragul pentru volumul clusterului, în mm^3 - iesire -
volumul de ieșire

[-mai puțin decât] - găsiți valori mai mici decât , Decat

mai mare

[-roi] - selectați o regiune de interes

- the roi, ca fișier de volum

[-subvolum] - selectați un singur subvolum

- numărul sau numele subvolumului

[-size-ratio] - ignoră grupurile mai mici decât o anumită fracțiune a

cel mai mare grup de pe hartă - fracțiunea din volumul celui mai mare cluster

[-distanță] - ignoră grupurile aflate la o distanță dată de

cel mai mare cluster - cât de departe de cel mai mare cluster poate fi un cluster,
margine

la muchie, în mm

[-start] - începe etichetarea clusterelor de la o altă valoare decât 1

- valoarea de dat primul cluster găsit

Emite un volum cu numere întregi diferite de zero pentru toți voxelii într-un spațiu suficient de mare
cluster și zerouri în altă parte. Numerele întregi denotă apartenența la cluster (în mod implicit,
primul cluster găsit va folosi valoarea 1, al doilea cluster 2 etc). Implicit, valori
mai mare ca sunt considerate a fi într-un cluster, utilizați -mai puțin decât la
testați pentru valori mai mici decât pragul. Pentru a aplica acest lucru ca mască datelor sau
pentru a face un prag mai complicat, vezi -volum-matematică.

-volum-gradient GRADIENTUL UNUI FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-gradient

- volumul de intrare - ieșire - gradientul de ieșire
magnitudine volum

[-presmooth] - netezește volumul înainte de a calcula gradientul

- sigma pentru funcția de ponderare gaussiană, în mm

[-roi] - selectați o regiune de interes pentru a lua gradientul

- regiunea în care se va lua gradientul

[-vectori] - vectori de ieșire

- ieșire - vectorii ca fișier de volum

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a lua gradientul

- numărul sau numele subvolumului

Calculează gradientul volumului făcând regresii liniare pentru fiecare voxel,
luând în considerare numai vecinii de față cu excepția cazului în care există prea puțini vecini de față. The
vectorul gradient este construit din derivatele parțiale ale liniarului rezultat
funcția, iar mărimea acestui vector este rezultatul. Dacă este specificat, volumul
Ieșirea vectorială este aranjată cu componentele x, y și z dintr-un subvolum ca
subvolume consecutive.

-volum-etichetă-export-tabel EXPORTAȚI TABEL DE ETICHETE DIN VOLUM CA TEXT

wb_command -volum-etichetă-export-tabel

- fișierul etichetei volumului de intrare - numărul sau denumirea etichetei
harta de utilizat - output - fișierul text de ieșire

Preia tabelul de etichete din harta de etichete de volum și îl scrie într-un format text
potrivindu-se cu ceea ce se asteapta de -volum-etichetă-import.

-volum-etichetă-import IMPORTAȚI UN VOLUM DE ETICĂ ÎN FORMATUL CARET

wb_command -volum-etichetă-import

- volumul etichetei de importat - fișier text care conține
valori și nume pentru etichete - ieșire - volumul etichetei bancului de lucru de ieșire

[-discard-others] - setați orice voxeli cu valori care nu sunt menționate în etichetă

lista la ??? eticheta

[-unlabeled-value] - setați valoarea care va fi interpretată ca neetichetată

- valoarea numerică pentru neetichetat (implicit 0)

[-subvolum] - selectați un singur subvolum de importat

- numărul sau numele subvolumului

[-drop-unused-labels] - eliminați orice valoare de etichetă neutilizată din etichetă

tabel

Creează un nou volum cu informații despre etichetă în antetul din caret nifti
format de extensie. Puteți specifica șirul gol ('' va funcționa pe linux/mac) pentru
, care va fi tratat ca și cum ar fi un fișier gol. Lista de etichete
fișierul trebuie să aibă linii de următorul format:



Nu specificați cheia „fără etichetă” în fișier, se presupune că 0 înseamnă că nu
etichetat dacă nu -valoare-neetichetată este specificat. Numele etichetelor trebuie să fie separat
linie, dar poate conține spații sau alte caractere neobișnuite (dar nu linie nouă).
Spațiile albe sunt tăiate de la ambele capete ale numelui etichetei, dar sunt păstrate dacă se află în
mijlocul unei etichete. Valorile roșu, verde, albastru și alfa trebuie să fie numere întregi din
de la 0 la 255 și va specifica culoarea în care este desenată eticheta (alfa de 255 înseamnă
opac, care este probabil ceea ce doriți). În mod implicit, va seta noi nume de etichetă
cu nume de LABEL_# pentru orice valori întâlnite care nu sunt menționate în listă
fisier, precizati -arunca-altii pentru a seta în schimb acești voxeli la cheia „neetichetată”.

-volume-label-to-roi FĂ O ETICĂ DE VOLUM ÎNTR-UN VOLUM ROI

wb_command -volume-label-to-roi

- fișierul etichetei volumului de intrare - ieșire - volumul de ieșire
fişier

[-name] - selectați eticheta după nume

- numele etichetei pentru care doriți să obțineți un roi

[-key] - selectați etichetă după tastă

- cheia de etichetă pentru care doriți un roi

[-map] - selectați o singură hartă de etichetă de utilizat

- numărul sau numele hărții

Pentru fiecare hartă în , este creată o hartă în unde toate locațiile
etichetat cu sau cu o cheie de li se acordă valoarea 1 și
toate celelalte locații sunt date 0. Exact una dintre -Yam și -cheie trebuie specificat.
Specifica -Hartă pentru a folosi o singură hartă din .

-eticheta-volum-la-suprafață-mapping HARTĂ UN VOLUM DE ETICĂ PE UN FIȘIER DE ETICHETE DE SURFACE

wb_command -eticheta-volum-la-suprafață-mapping

- volumul de la care să mapați datele - suprafața pe care să mapați datele
- output - fișierul de etichete gifti de ieșire

[-subvol-select] - selectați un singur subvolum pentru a mapa

- numărul sau numele subvolumului

Folosește metoda de mapare a voxelului de anexare pentru a mapa datele etichetelor într-un fișier de etichetă Gifti.

-volum-matematică EVALUAȚI EXPRESIA PE FIȘIERE DE VOLUM

wb_command -volum-matematică

- expresia a evalua, între ghilimele - ieșire - the
volumul de ieșire

[-fixnan] - înlocuiți rezultatele NaN cu o valoare

- valoarea cu care se înlocuiește NaN

[-var] - repetabil - un fișier de volum de utilizat ca variabilă

- numele variabilei, așa cum este utilizat în expresie - volumul
fișier de utilizat ca această variabilă

[-subvolum] - selectați un singur subvolum

- numărul sau numele subvolumului

[-repeat] - reutilizați un singur subvolum pentru fiecare subvolum de calcul

Această comandă evaluează la fiecare voxel în mod independent.
Acolo

trebuie să fie cel puțin unul -var opțiunea (pentru a obține spațiul de volum), chiar dacă
specificat în acesta nu este folosit în . Toate volumele trebuie să aibă același volum
spaţiu. Numele de fișiere nu sunt valide în , utilizați un nume de variabilă și a -var
opțiune cu potrivire pentru a specifica un fișier de intrare. Dacă -subvolum opțiunea este
dat oricărui -var opțiunea, este utilizat un singur subvolum din acel fișier. Dacă -repeta is
specificat, fișierul trebuie fie să aibă un singur subvolum, fie să aibă -subvolum
opțiunea specificată. Toate fișierele care nu sunt folosite -repeta trebuie să aibă același număr de
subvolumele solicitate a fi utilizate. Formatul de este după cum urmează:

Expresiile constau din constante, variabile, operatori, paranteze și funcții,
în notație infixă, cum ar fi „exp(-x + 3) * scară'. Variabilele sunt șiruri de orice
lungime, folosind caracterele az, AZ, 0-9 și _, dar nu poate lua numele unui
numită constantă. În prezent, există o singură constantă numită PI. Operatorii
sunt +, -, *, /, ^, >, <, >=, <=, ==, !=, !, &&, ||. Acestea se comportă ca în C, cu excepția
că ^ este exponențiație, adică pow(x, y), și are o prioritate mai mare decât altele
operatori binari (de asemenea, '-3^-4^-5' înseamnă '-(3^(-(4^-5)))'). <=, >=, == și !=
operatorilor li se oferă o cantitate mică de spațiu de mișcare, egală cu o milioneme din
mai mică dintre valorile absolute ale valorilor comparate.

Operatorii de comparație și logici returnează 0 sau 1, puteți face mascarea cu expresii
precum „x * (mască > 0)”. Pentru toți operatorii logici, o intrare este considerată adevărată dacă
este mai mare decât 0. Expresia „0 < x < 5” nu este greșită din punct de vedere sintactic, dar
NU va face ceea ce se dorește, deoarece este evaluat de la stânga la dreapta, adică „((0
x) < 5)', care va returna întotdeauna 1, așa cum sunt ambele rezultate posibile ale unei comparații
mai mic de 5. Se generează un avertisment dacă este detectată o expresie de acest tip.
Utilizați ceva de genul „x > 0 && x < 5” pentru a obține comportamentul dorit.

Spațiul alb dintre elemente este ignorat, „ sin ( 2 * x ) ” este echivalent cu
„sin(2*x)”, dar „s in(2*x)” este o eroare. Înmulțirea implicită nu este permisă,
expresia „2x” va fi analizată ca variabilă. Parantezele sunt (), nu se folosesc
[] sau {}. Funcțiile necesită paranteze, expresia „sin x” este o eroare.

Sunt acceptate următoarele funcții:

sin: 1 argument, sinusul argumentului (unitățile sunt radiani) cos: 1 argument, the
cosinus al argumentului (unitățile sunt radiani) tan: 1 argument, tangenta lui
argument (unitățile sunt radiani) asin: 1 argument, inversul sinusului argumentului,
în radiani acos: 1 argument, inversul cosinusului argumentului, în radiani
atan: 1 argument, inversul tangentei argumentului, în radiani atan2: 2
argumente, atan2(y, x) returnează inversul tangentei lui

(y/x), în radiani, determinând cadranul după semnul ambelor argumente

sinh: 1 argument, sinusul hiperbolic al argumentului cosh: 1 argument, the
cosinus hiperbolic al argumentului tanh: 1 argument, tangenta hiperbolocă a lui
argument asinh: 1 argument, sinusul hiperbolic invers al argumentului acosh: 1
argument, cosinusul hiperbolic invers al argumentului atanh: 1 argument, the
tangenta hiperboloc inversă a argumentului ln: 1 argument, logaritmul natural al
argumentul exp: 1 argument, constanta e ridicată la puterea argumentului
log: 1 argument, logaritmul de bază 10 al argumentului sqrt: 1 argument, pătratul
rădăcina argumentului abs: 1 argument, valoarea absolută a argumentului etaj: 1
argument, cel mai mare întreg nu mai mare decât runda argumentului: 1 argument, the
cel mai apropiat număr întreg, cu legăturile rotunjite la o distanță de

zero

ceil: 1 argument, cel mai mic număr întreg nu mai mic decât argumentul min: 2 argumente,
min(x, y) returnează y dacă (x > y), x altfel max: 2 argumente, max(x, y) returnează y
dacă (x < y), x altfel mod: 2 argumente, mod(x, y) = x - y * floor(x / y), sau 0 dacă
y == 0 clamp: 3 argumente, clamp(x, low, high) = min(max(x, low), high)

-volum-imbinare FUNCȚI FIȘIERE DE VOLUM ÎNTR-UN FIȘIER NOU

wb_command -volum-imbinare

- output - fișierul volumului de ieșire

[-volum] - repetabil - specifică un fișier de volum de intrare

- un fișier de volum din care să utilizați subvolume

[-subvolum] - repetabil - selectați un singur subvolum de utilizat

- numărul sau numele subvolumului

[-up-to] - utilizați o gamă inclusivă de subvolume

- numărul sau numele ultimului subvolum către

include

[-reverse] - utilizați intervalul în ordine inversă

Preia unul sau mai multe fișiere de volum și construiește un nou fișier de volum prin concatenare
subvolume din ele. Fișierele de volum de intrare trebuie să aibă același spațiu de volum.

Exemplu: wb_command -volum-imbinare afară.nii -volum întâi.nii -subvolum 1 -volum
a doua.nii

Acest exemplu ar lua primul subvolum de la first.nii, urmat de toate
subvolume de la secund.nii și scrieți-le pe out.nii.

-volum-paletă SETĂ PALETA UNUI FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-paletă

- fișierul de volum de modificat - modul de cartografiere

[-subvolum] - selectați un singur subvolum

- numărul sau numele subvolumului

[-pos-percent] - procentaj min/max pentru colorarea datelor pozitive

- percentila pentru cele mai puțin pozitive date - cel
percentila pentru datele cele mai pozitive

[-neg-percent] - procentaj min/max pentru colorarea datelor negative

- percentila pentru datele cele mai puțin negative - cel
percentila pentru datele cele mai negative

[-pos-user] - valori min/max ale utilizatorului pentru colorarea datelor pozitive

- valoarea pentru cele mai puțin pozitive date - valoarea
pentru cele mai pozitive date

[-neg-user] - valorile min/max ale utilizatorului pentru colorarea datelor negative

- valoarea pentru cele mai puțin negative date - valoarea
pentru cele mai negative date

[-interpolate] - interpolează culorile

- boolean, dacă se interpolează

[-disp-pos] - afișează date pozitive

- boolean, dacă să fie afișat

[-disp-neg] - afișați date pozitive

- boolean, dacă să fie afișat

[-disp-zero] - afișați datele mai aproape de zero decât limita minimă

- boolean, dacă să fie afișat

[-palette-name] - setează paleta utilizată

- numele paletei

[-thresholding] - setează pragul

- setarea pragului - afișează valori în interiorul sau în afara pragurilor
- pragul inferior - pragul superior

Fișierul de volum original este suprascris cu versiunea modificată.
By

implicit, toate coloanele fișierului de volum sunt ajustate la noile setări, utilizați
-subvolum opțiunea de a schimba un singur subvolum. Setările de cartografiere nu sunt specificate în
opțiunile vor fi preluate din primul subvolum. The argumentul trebuie să fie unul dintre
următoarele:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

The argument la -nume-paleta trebuie să fie unul dintre următoarele:

PSYCH PSYCH-NU-NIMIC ROY-BIG ROY-BIG-BL Portocaliu-Galben Gri_Interp_Pozitiv
Gray_Interp clear_brain videen_style fidl raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG roșu-galben albastru-albastru deschis FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256

The argument la -pragării trebuie să fie unul dintre următoarele:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

The argument la -pragării trebuie să fie unul dintre următoarele:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-volum-colet-reeșantionare COLETE DE VOLUM NETEDE ȘI RESEMPLANTATE

wb_command -volum-colet-reeșantionare

- volumul datelor de intrare - volumul etichetei unde se află
parcelele sunt în prezent - volumul etichetei unde ar trebui să fie coletele
- sigma nucleului gaussian pentru a netezi în timpul reeșantionării -
ieșire - volum de ieșire

[-fix-zeros] - tratează valorile zero ca nefiind date

[-subvolume] - selectați un singur subvolum ca intrare

- numărul sau numele subvolumului

Netezește și reeșantionează regiunea din interiorul fiecărei etichete în parcele curbate în regiunea de
același nume de etichetă în pachetele noi. Orice voxeli din regiunea etichetei de ieșire dar
din afara regiunii etichetei de intrare va fi extrapolată din datele din apropiere. The
-fix-zerouri opțiunea face ca netezirea să nu folosească o valoare de intrare dacă este zero, dar
scrieți în continuare o valoare netezită în voxel și după ce netezirea este completă, va fi
verificați orice valori rămase de zero și completați-le cu valori extrapolate.

Notă: toate volumele trebuie să aibă aceleași dimensiuni și distanțe.
Pentru a utiliza un

spațiu de ieșire diferit, vezi -volum-colet-reeșantionare-generic.

-volum-colet-reeșantionare-generic COLETELE NETEDE ȘI RESEMPLANTATE DE VOLUM DIN DIFERIT VOLUM
SPACE

wb_command -volum-colet-reeșantionare-generic

- volumul datelor de intrare - volumul etichetei unde se află
parcelele sunt în prezent - volumul etichetei unde ar trebui să fie coletele
- sigma nucleului gaussian pentru a netezi în timpul reeșantionării -
ieșire - volum de ieșire

[-fix-zeros] - tratează valorile zero ca nefiind date

[-subvolume] - selectați un singur subvolum ca intrare

- numărul sau numele subvolumului

Netezește și reeșantionează regiunea din interiorul fiecărei etichete în parcele curbate în regiunea de
același nume de etichetă în pachetele noi. Orice voxeli din regiunea etichetei de ieșire dar
din afara regiunii etichetei de intrare va fi extrapolată din datele din apropiere. The
-fix-zerouri opțiunea face ca netezirea să nu folosească o valoare de intrare dacă este zero, dar
scrieți în continuare o valoare netezită în voxel și după ce netezirea este completă, va fi
verificați orice valori rămase de zero și completați-le cu valori extrapolate.
Volumul de ieșire va folosi spațiul de volum al pachetelor noi, care nu este necesar
să fie în același spațiu de volum ca și intrarea.

-volum-colet-netezirea COLETELE NETEDE ÎN VOLUM SEPARAT

wb_command -volum-colet-netezirea

- volumul pentru a netezi - un volum de etichetă care conține
parcele pentru a netezi - sigma nucleului de netezire gaussian, în mm
- ieșire - volumul de ieșire

[-fix-zeros] - tratează valorile zero ca nefiind date

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a netezi

- numărul sau numele subvolumului

Volumul este netezit în cadrul fiecărei etichete din volumul etichetei folosind numai datele de la
în cadrul etichetei. Echivalent cu rularea netezirii volumului cu rentabilitatea investiției care se potrivește fiecăreia
etichetați separat, adăugând apoi volumele rezultate, dar mai rapid.

-volum-reduce Efectuați OPERAȚIE DE REDUCERE PE SUBVOLUME

wb_command -volum-reduce

- fișierul de volum de redus - operatorul de reducere de utilizat
- ieșire - volumul de ieșire

[-exclude-outliers] - exclude valorile aberante din fiecare serie temporală în funcție de standard

deviere - numărul de abateri standard sub media până la

include

- numărul de abateri standard peste medie până la

include

Pentru fiecare voxel, preia datele din subvolume ca vector și efectuează
reducerea specificată pe aceasta, punând rezultatul în volumul de ieșire unic la aceea
voxel. Operatorii de reducere sunt următorii:

MAX: valoarea maximă MIN: valoarea minimă INDEXMAX: indicele bazat pe 1 al
valoarea maximă INDEXMIN: indicele bazat pe 1 al valorii minime SUM: adăugați toate valorile
PRODUS: înmulțiți toate valorile MEDIA: media datelor STDEV: standardul
abatere (numitorul N) SAMPSTDEV: abaterea standard a eșantionului (N-1
numitor) VARIANCE: varianţa datelor MEDIANA: mediana datelor
MODE: modul datelor COUNT_NONZERO: numărul de elemente nenule din
de date

-volum-elimină-insule ELIMINAȚI INSULELE DIN UN VOLUM ROI

wb_command -volum-elimină-insule

- volumul ROI de intrare - output - volumul ROI de ieșire

Găsește toate părțile conectate la față ale rentabilității investiției și le pune la zero pe toate, cu excepția celei mai mari.

-volum-reorientare SCHIMBAȚI ORDINEA VOXELĂ A UNUI FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-reorientare

- volumul de reorientat - orientarea dorită
- afară - volumul reorientat

Modifică ordinea voxelilor și informațiile despre spațierea antetului/origina astfel încât
valoarea oricărui punct spațial este neschimbată. Șirurile de orientare arată ca „LPI”,
ceea ce înseamnă că primul indice este de la stânga la dreapta, al doilea este posterior față de anterior și
al treilea este inferior superiorului. Caracterele valide sunt:

L de la stânga la dreapta

R de la dreapta la stânga

P posterior spre anterior

Un anterior spre posterior

sunt inferior superiorului

S superior față de inferior

-volum-rois-din-extrema CREAȚI HĂRȚI DE VOLUM ROI DIN HĂRȚI EXTREMA

wb_command -volum-rois-din-extrema

- volumul de intrare - limita de distanta fata de centrul voxelului, in mm
- ieșire - volumul de ieșire

[-gaussian] - generează un nucleu gaussian în loc de un ROI plat

- sigma pentru nucleul gaussian, în mm

[-roi] - selectați o regiune de interes de utilizat

- regiunea de utilizat

[-overlap-logic] - cum să gestionați suprapunerea ROI-urilor, implicit ALLOW

- metoda de rezolvare a suprapunerilor

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a lua gradientul

- numărul sau numele subvolumului

Pentru fiecare valoare diferită de zero din fiecare hartă, creați o hartă cu un ROI în jurul locației respective.
În cazul în care -gaussian este specificată opțiunea, apoi sunt ieșite nucleele gaussiene normalizate
în loc de rentabilitatea investiției. The argument la -logica-suprapunere trebuie să fie unul dintre PERMISI,
CEL MAI APROPIAT sau EXCLUDE. ALLOW este valoarea implicită și înseamnă că ROI-urile sunt tratate
independent și se pot suprapune. CLOEST înseamnă că rentabilitatea investiției nu se poate suprapune și asta
niciun ROI nu conține vârfuri care sunt mai aproape de un alt vârf de semințe. EXCLUDE înseamnă
că ROI-urile nu se pot suprapune și că orice vârf în intervalul mai mult de o ROI
nu aparține niciunui ROI.

-volum-set-spațiu SCHIMBAȚI INFORMAȚII DE SPAȚIU VOLUM

wb_command -volum-set-spațiu

- volumul de intrare - ieșire - volumul de ieșire

[-plumb] - setat prin ordinea axei și spațiere/offset

- un șir de caractere precum „XYZ” care specifică care este index

care dimensiune spaţială

- modificarea coordonatei x din creșterea relevantei

index

- modificarea coordonatei y de la creșterea relevantei

index

- modificarea coordonatei z din creșterea celei relevante

index

- coordonata x a primului voxel - coordonata y a
primul voxel - coordonata z a primului voxel

[-sform] - setat printr-un nifti sform

- creșterea coordonatei x din creșterea indicelui i
- creșterea coordonatei x din creșterea indicelui j - crestere in
coordonata x din incrementarea indicelui k - coordonata x a primului voxel
- creșterea coordonatei y din creșterea indicelui i
- creșterea coordonatei y din creșterea indicelui j - crestere in
coordonata y din incrementarea indicelui k - coordonata y a primului voxel
- creșterea coordonatei z din creșterea indicelui i
- creșterea coordonatei z din creșterea indicelui j - crestere in
coordonata z din creșterea indicelui k - coordonata z a primului voxel

Scrie o copie a fișierului de volum, cu informațiile de spațiere modificate ca
specificat. Nu are loc nicio reordonare a datelor voxel. Exact unul dintre -plumb or
-sform trebuie specificat.

-netezirea volumului NETEZIȚI UN FIȘIER DE VOLUM

wb_command -netezirea volumului

- volumul pentru a netezi - sigma nucleului de netezire gaussian,
în mm - ieșire - volumul de ieșire

[-roi] - uniformizează numai din datele dintr-un ROI

- volumul de utilizat ca ROI

[-fix-zeros] - tratează valorile zero ca nefiind date

[-subvolum] - selectați un singur subvolum pentru a netezi

- numărul sau numele subvolumului

Netezire gaussiană pentru volume.
În mod implicit, netezește toate subvolumele cu

fără ROI, dacă este dat ROI, doar voxelii pozitivi din volumul ROI își au valorile
folosit și toți ceilalți voxeli sunt setate la zero. Netezirea unui volum non-ortogonal va
fi semnificativ mai lent, deoarece operația nu poate fi separată în
Neteziri unidimensionale fără a distorsiona forma miezului.

-fix-zerouri opțiunea face ca netezirea să nu folosească o valoare de intrare dacă este zero,
dar totuși scrieți o valoare netezită la voxel. Acest lucru este util pentru zerouri care
indică lipsa de informații, împiedicându-i să reducă intensitatea
voxeli din apropiere, dând în același timp zero o valoare extrapolată.

-volum-statistici STATISTICA SPAȚIALĂ PE UN FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-statistici

- volumul de intrare

[-reduce] - folosește o operație de reducere

- operatia de reducere

[-percentila] - dați valoarea la o percentilă

- percentila de găsit

[-subvolume] - afișează numai ieșirea pentru un subvolum

- numărul sau numele subvolumului

[-roi] - luați în considerare numai datele din interiorul unui roi

- the roi, ca fișier de volum

[-match-maps] - fiecare subvolum de intrare folosește corespunzătoare

subvolum din fișierul roi

[-show-map-name] - imprimați indexul hărții și numele înainte de fiecare ieșire

Pentru fiecare subvolum al intrării, este tipărit un singur număr, rezultat din
operație de reducere sau percentilă specificată. Utilizare -subvolum pentru a da numai ieșire
pentru un singur subvolum. Utilizare -Rege să ia în considerare numai datele dintr-o regiune.
Exact unul dintre -reduce or -percentila trebuie specificat.

Argumentul către -reduce opțiunea trebuie să fie una dintre următoarele:

MAX: valoarea maximă MIN: valoarea minimă INDEXMAX: indicele bazat pe 1 al
valoarea maximă INDEXMIN: indicele bazat pe 1 al valorii minime SUM: adăugați toate valorile
PRODUS: înmulțiți toate valorile MEDIA: media datelor STDEV: standardul
abatere (numitorul N) SAMPSTDEV: abaterea standard a eșantionului (N-1
numitor) VARIANCE: varianţa datelor MEDIANA: mediana datelor
MODE: modul datelor COUNT_NONZERO: numărul de elemente nenule din
de date

-volum-tfce FACEȚI TFCE PE UN FIȘIER DE VOLUM

wb_command -volum-tfce

- volumul pe care rulează TFCE - ieșire - volumul de ieșire

[-presmooth] - netezește volumul înainte de a rula TFCE

- sigma pentru miezul de netezire gaussian, în mm

[-roi] - selectați o regiune de interes pe care să rulați TFCE

- zona pe care să rulați TFCE, ca volum

[-parametri] - setați parametrii pentru integrala TFCE

- exponent pentru volumul clusterului (implicit 0.5) - exponent pentru valoarea de prag
(implicit 2.0)

[-subvolum] - selectați un singur subvolum

- numărul sau numele subvolumului

Îmbunătățirea clusterului fără prag este o metodă de creștere a valorii relative a
regiuni care ar forma clustere într-un test standard de prag. Aceasta este
realizat prin evaluarea integralei a:

e(h, p)^E * h^H * dh

la fiecare vârf p, unde h variază de la 0 la valoarea maximă a datelor și e(h,
p) este întinderea clusterului care conține vârful p la pragul h. Negativ
valorile sunt îmbunătățite în mod similar prin negarea datelor, rularea aceluiași proces și
negând rezultatul.

Această metodă este explicată în: Smith SM, Nichols TE., „Threshold-free cluster
îmbunătățire: abordarea problemelor de netezire, dependență de prag și
localizare în inferența cluster.” Neuroimage. 2009 ian 1;44(1):83-98. PMID:
18501637

-cartarea-volum-la-suprafață HARTĂ VOLUM PENTRU SUPRAFAȚĂ

wb_command -cartarea-volum-la-suprafață

- volumul de la care să mapați datele - suprafața pe care să mapați datele
- ieșire - fișierul metric de ieșire

[-trilinear] - folosește interpolarea volumului triliniar

[-enclosing] - utilizați valoarea voxelului de încadrare

[-cubic] - folosește spline cubice

[-ribbon-constrained] - folosește algoritmul de mapare cu constrângere panglică

- suprafața interioară a panglicii - suprafaţa exterioară a
panglica

[-volume-roi] - folosește un volum roi

- fișierul de volum

[-voxel-subdiv] - diviziunile voxelilor în timp ce se estimează greutățile voxelilor

- numărul de subdiviziuni, implicit 3

[-output-weights] - scrieți greutățile voxelului pentru un vârf într-un volum

fişier - numărul vârfurilor pentru care se obține ponderile voxelului, bazat pe 0
- ieșire - volum în care să scrieți greutățile

[-myelin-style] - utilizați metoda din cartografierea mielinei

- un volum roi al panglicii corticale pentru aceasta

emisferă

- o pilă metrică de grosime corticală - miez de guassian în mm
pentru ponderarea voxelilor în interval

[-subvol-select] - selectați un singur subvolum pentru a mapa

- numărul sau numele subvolumului

Trebuie să specificați exact o metodă de mapare.
Anexarea voxelului folosește

valoarea de la voxel vârful se află în interior, în timp ce trilinear face un liniar 3D
interpolare bazată pe voxelii imediat de fiecare parte a vârfurilor
poziție.

Metoda de cartografiere panglică construiește un poliedru de la vecinii vârfului
fiecare suprafață și estimează cantitatea din volumul acestui poliedr care cade
în interiorul oricăror voxeli din apropiere, pentru a le folosi ca ponderi pentru eșantionare. Volumul ROI este
util pentru a exclude efectele de volum parțial ale voxelilor prin care trec suprafețele și
va face ca maparea să ignore voxelii care nu au o valoare pozitivă în
masca. Numărul de subdiviziune specifică modul în care se aproximează cuantumul
volumul pe care poliedrul se intersectează, prin împărțirea fiecărui voxel în NxNxN bucăți și
verificând dacă centrul fiecărei piese se află în interiorul poliedrului. Daca ai
voxeli foarte mari, luați în considerare creșterea acesteia dacă obțineți zerouri în ieșire.

Metoda stilului myelin folosește o parte a comenzii caret5 myelin mapping pentru a face
mapare: pentru fiecare vârf de suprafață, luați toți voxelii mai aproape decât grosimea de la
vârfuri care se află în ROI-ul panglicii și la mai puțin de jumătate din valoarea grosimii
de la vârf de-a lungul direcției normalei suprafeței și aplicați un gaussian
nucleul cu sigma specificat pentru a obține greutățile de utilizat.

-volum-vector-operare FACEȚI O OPERAȚIE VECTORALĂ PE FIȘIERE DE VOLUM

wb_command -volum-vector-operare

- primul fișier de intrare vectorial - al doilea fișier de intrare vectorial
- ce operație vectorială să faci - output - fișierul de ieșire

[-normalize-a] - normalizează vectorii primei intrări

[-normalize-b] - normalizează vectorii a doua intrare

[-normalize-output] - normalizează vectorii de ieșire (nu este valabil pentru dot

produs)

[-magnitude] - afișează mărimea rezultatului (nu este valabil pentru dot

produs)

Efectuează o operație vectorială pe două fișiere de volum (care trebuie să aibă un multiplu de 3
subvolume). Oricare dintre intrări poate avea mai mulți vectori (mai mult de 3
subvolume), dar nu ambele (cel puțin unul trebuie să aibă exact 3 subvolume). The
-magnitudinea și -normalizare-ieșire este posibil ca opțiunile să nu fie specificate împreună sau cu
Operațiunea DOT. The parametrul trebuie să fie unul dintre următoarele:

CU CRUCE ADAUGĂ SCADĂ

-volum-warpfield-resantionare RESAMPLEARE VOLUM CU WARPFIELD

wb_command -volum-warpfield-resantionare

- volum de reeșantionat - câmpul warp de aplicat
- un fișier de volum în spațiul de volum pe care îl doriți pentru

producție

- metoda reeșantionării - ieșire - volumul de ieșire

[-fnirt] - TREBUIE folosit dacă se folosește un fnirt warpfield

- volumul sursă utilizat la generarea câmpului warp

Reeșantionați un fișier de volum cu un câmp warp.
Metodele recomandate sunt

CUBIC (spline cubică) pentru majoritatea datelor și ENCLOSING_VOXEL pentru datele de etichetă. The
parametru trebuie să fie unul dintre:

CUBIC ENCLOSING_VOXEL TRILINEAR

-statistici-ponderate-volum STATISTICI SPAȚIALE PONDERATE PE UN FIȘIER DE VOLUM

wb_command -statistici-ponderate-volum

- volumul de intrare

[-weight-volume] - utilizați greutăți dintr-un fișier de volum

- fișierul de volum care conține greutățile

[-subvolume] - afișează numai ieșirea pentru un subvolum

- numărul sau numele subvolumului

[-roi] - luați în considerare numai datele din interiorul unui roi

- the roi, ca fișier de volum

[-match-maps] - fiecare subvolum de intrare folosește corespunzătoare

subvolum din fișierul roi

[-mean] - calculează media ponderată

[-stdev] - calculează abaterea standard ponderată

[-eșantion] - estimați stdev populației din eșantion

[-percentila] - calculează percentila ponderată

- percentila de găsit

[-sum] - calculează suma ponderată

[-show-map-name] - imprimați indexul hărții și numele înainte de fiecare ieșire

Pentru fiecare subvolum al intrării, este tipărit un singur număr, rezultat din
operațiune specificată. Dacă -greutate-volum nu este specificat, volumul fiecărui voxel este
folosit. Utilizare -subvolum pentru a oferi numai ieșire pentru un singur subvolum. Utilizare -Rege la
luați în considerare numai datele dintr-o regiune. Exact unul dintre -Rău, -stdev, -percentila
or -sumă trebuie specificat.

Utilizarea -sumă fără -greutate-volum este echivalent cu integrarea cu privire la
volum.

-wbsparse-merge-dens FUNCȚI FIȘIERE WBSPARSE DE-A lungul unei dimensiuni dense

wb_command -wbsparse-merge-dens

- ce dimensiune se îmbină, RÂND sau COLANĂ - ieșire
- fișierul de ieșire wbsparse

[-wbsparse] - repetabil - specifică un fișier wbsparse de intrare

- un fișier wbsparse de îmbinat

Fișierele de intrare wbsparse trebuie să aibă mapări care se potrivesc de-a lungul direcției, nu
specificate, iar maparea de-a lungul direcției specificate trebuie să fie modele ale creierului.

-zip-scene-file ZIP UN FIȘIER DE SCENA ȘI FIȘIERELE DE DATE

wb_command -zip-scene-file

- fișierul de scenă din care faceți fișierul zip - numele
a folderului creat când fișierul zip este

dezarhivat

- out - fișierul zip care va fi creat

[-base-dir] - specificați un director în care toate fișierele de date sunt undeva

în interior, aceasta va deveni rădăcina structurii de directoare a fișierului zip
- directorul

Dacă fișierul zip există deja, acesta va fi suprascris.
If -base-dir nu este

specificat, directorul care conține fișierul scenei este utilizat pentru directorul de bază.
Fișierul de scenă trebuie să conțină numai căi relative și niciun fișier de date nu poate fi în exterior
directorul de bază.

-zip-spec-file ZIP UN FIȘIER DE SPECIFICAȚI ȘI FIȘIERELE ACESTE DE DATE

wb_command -zip-spec-file

- fișierul de specificații de adăugat la fișierul zip - numele
a folderului creat când fișierul zip este

dezarhivat

- out - fișierul zip care va fi creat

[-base-dir] - specificați un director în care toate fișierele de date sunt undeva

în interior, aceasta va deveni rădăcina structurii de directoare a fișierului zip
- directorul

Dacă fișierul zip există deja, acesta va fi suprascris.
If -base-dir nu este

specificat, directorul care conține fișierul spec este utilizat pentru directorul de bază.
Fișierul cu specificații trebuie să conțină doar căi relative și niciun fișier de date nu poate fi în afara
directorul de bază. Fișierele de scenă din fișierele de specificații nu sunt verificate pentru ce fișiere
fac referire, asigurați-vă că toate fișierele de date la care se face referire de fișierele de scenă sunt de asemenea
la care face referire fișierul cu specificații.

Utilizați wb_command online folosind serviciile onworks.net