Aceasta este aplicația Linux numită FASTQSim, care rulează online în Linux, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca FASTQsim_v2.0.tgz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită FASTQSim pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
FASTQSim să ruleze online în Linux
Ad
DESCRIERE
FASTQSim este un instrument care oferă funcționalitatea dublă a caracterizării setului de date Next-Gen Sequencing și generarea de date metagenomice.FASTQSim este independent de platforma de secvențiere și calculează distribuțiile lungimii de citire, scorurile de calitate, ratele de indel, ratele de mutație de un singur punct, dimensiunea indel și statistici similare pentru orice secvențiere
platformă. Pentru a crea seturi de date de antrenament sau de testare, FASTQSim are capacitatea de a converti secvențele țintă în citiri in silico cu potrivire
profiluri de eroare.
FASTQsim permite utilizatorului să simuleze seturi de date citite individuale care pot fi utilizate ca scenarii de testare standardizate pentru planificarea proiectelor de secvențiere sau pentru compararea software-ului metagenomic. În acest sens, seturile de date in silico generate cu instrumentul FASTQsim prezintă mai multe avantaje față de seturile de date naturale: sunt independente de platforma de secvențiere, sunt extrem de bine caracterizate și sunt mai puțin costisitoare de generat.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/fastqsim/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
