Aceasta este aplicația Linux numită GenOO-HTS, care rulează online în Linux, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită GenOO-HTS pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
GenOO-HTS va rula online în Linux
DESCRIERE
GenOO-HTS [jee-noo] este o sursă deschisă; cadru Perl orientat pe obiecte dezvoltat special pentru proiectarea instrumentelor de analiză HTS (High Throughput Sequencing). Scopul principal al GenOO-HTS este de a face analize simple HTS ușoare și complicate. GenOO-HTS modelează entitățile biologice în obiecte Perl și oferă atribute și metode relevante care permit manipularea datelor de secvențiere de mare capacitate. Folosirea GenOO-HTS ca modul de dezvoltare de bază reduce cheltuielile generale și complexitatea gestionării datelor și a entităților biologice la îndemână. GenOO-HTS a fost proiectat pentru a fi flexibil, ușor de extins, cu structură modulară și cerințe minime pentru instrumente și biblioteci externe.Categorii
- Organizați entitățile biologice ca obiecte perl (regiuni genomice, gene, transcrieri, introni/exoni etc.)
- Organizați entitățile de secvențiere ca obiecte/atribute Perl (secvențierea citirilor, aliniamente etc.)
- Faceți I/O ușor din formate de fișiere utilizate pe scară largă (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Fii consecvent și ușor de extins
Public
Știință/Cercetare, Dezvoltatori
Limbaj de programare
Perl
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/genoo/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
