Aceasta este aplicația Linux numită software-ul GMATA pentru markerul Genomic SSR a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca GMATAv2.2.jar. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită software GMATA pentru markerul Genomic SSR cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
Software GMATA pentru markerul genomic SSR
DESCRIERE
Ce este software-ul GMATA v21
Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) este un software pentru analize Simple Sequence Repeats (SSR) și proiectarea și maparea markerului SSR în orice secvențe ADN. Are urmatoarele functii:
1. minerit SSR;
2. Analiză statistică și reprezentare grafică;
3. Vizualizare grafică a locilor SSR;
4. Proiectare marker;
5. Cartografierea electronică și investigarea transferabilității markerilor.
GMATA este precis, sensibil și rapid. A fost conceput pentru a procesa seturi mari de date de secvențe genomice, în special secvențe mari de genom întreg. În teorie, genomurile de orice dimensiune pot fi analizate cu ușurință prin GMATA. Software-ul GMATA funcționează pe server, desktop sau chiar laptop și poate rula în interfața grafică cu doar clicuri sau poate rula în linia de comandă sau în conductă automată. De asemenea, este multi-platformă și acceptă Unix/Linux, Win și Mac. Rezultatele din software-ul GMATA pot fi afișate direct grafic cu caracteristicile genomului sau genelor în Gbrowser și pot fi integrate cu ușurință cu orice bază de date genomică.
DESCRIERE
- Exploatarea SSR cea mai precisă și rapidă în orice secvențe mari
- Analiză statistică completă și reprezentare grafică
- Afișarea loci SSR și a graficului marker în Gbrowser cu caracteristici ale genomului
- Proiectarea markerului specific SSR și PCR simulată
- Cartografierea electronică și investigarea transferabilității markerilor
- disponibil și la https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/gmata/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.