Aceasta este aplicația Linux numită MDcons (Molecular Dynamics consensus) a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca mdcons-src-2.0.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MDcons (Molecular Dynamics Consensus) cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
MDcons (consensul dinamicii moleculare)
DESCRIERE
MDcons este un instrument de analiză a contactelor conservate în timpul simulărilor de dinamică moleculară (MD) ale complexelor bazate pe proteine, ARN, ADN și ligand. Intrarea este fie o traiectorie Molecular Dynamics, fie un set de instantanee. Intrarea poate fi, de asemenea, un singur instantaneu. Ieșirile sunt (1) o hartă a celor mai/mai puțin frecvente contacte conservate în timpul MD (2) o listă a celor mai/mai puțin frecvente contacte conservate în timpul MD.
Categorii
- MDcons rulează cu peste 2000 de instantanee MD în mai puțin de 2 minute
- MDcons se ocupă atât de complexe de proteine, ARN și ADN
- MDcons gestionează traiectorii/instantaneele cu sau fără identificator de lanț
- MDcons este compatibil cu GROMACS
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal, linie de comandă
Limbaj de programare
Fortran, Python
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/mdcons/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
