Aceasta este aplicația Linux numită ParamIT, care rulează online în Linux, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca ParamITPack-1.0.tar.bz2. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită ParamIT pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
ParamIT să ruleze online în Linux
DESCRIERE
ParamIT este un set de instrumente care ajută la dezvoltarea parametrizării câmpului de forță mecanică moleculară a moleculelor mici, asemănătoare tragerii, în cadrul protocolului CHARMM general force field (CGenFF). Setul de instrumente dezvoltat îi ajută pe cercetători în următoarele moduri: 1) automatizarea creării de fișiere multiple de intrare pentru programele de mecanică cuantică și moleculară, 2) automatizarea analizei rezultatelor și 3) înlocuirea utilizării programelor MM complete cu una mai rapidă specializată. Instrumentele dezvoltate includ: 1) generator de complexe moleculă-apă cu interfață grafică cu utilizatorul (GUI), 2) analiza semi-automată a frecvenței folosind matricea simbolică de distribuție a energiei potențiale și compararea coordonatelor interne optimizate, 3) GUI pentru adaptarea încărcăturii cu trei moduri : manual, eșantionare Monte-Carlo sau forță brută și 4) GUI pentru potrivirea termenilor diedri. Utilizarea acestor instrumente scade efortul de muncă, scade erorile de introducere manuală și reduce timpul necesar pentru eforturile precise de parametrizare MM.Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comandă, Tk
Limbaj de programare
C, Python
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/paramit/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.