Aceasta este aplicația Linux numită Pontos, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca Pontos-3.0.jar. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Pontos pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
Pontos va rula online în Linux
DESCRIERE
Pontos este un program Java grafic, ușor de utilizat, pentru calcularea matricelor de distanță (sau similaritate) necorectate din alinierea secvenței ADN în format PHYLIP. De asemenea, creează aliniamente „diferențe” față de cele obișnuite (și invers).Poate face față lacunelor și ambiguităților în moduri diferite.
Golurile pot fi:
- toate folosite;
- toate ignorate;
- ignorat numai la sfârşitul secvenţelor, în perechi;
- ignorat doar la capete, dar acum global (de fapt, tăierea întregului aliniament la secvențele cele mai îndepărtate de la capete).
Ambiguitățile (lucruri precum R, Y, N, W etc. într-o secvență ADN) pot fi tratate astfel:
- considera ambiguitățile ca întotdeauna diferite;
- considera ambiguitatea ca parțial diferită (de exemplu, R ar fi 0.5 diferit de A sau G);
- ignora ambiguitățile în fiecare comparație pe perechi;
- eliminați toate coloanele, la nivel global, care arată orice ambiguitate.
Pontos a fost scris în Linux, dar ar trebui să ruleze în orice sistem în care funcționează Java. Pontos este licențiat sub versiunea 3 GPL.
Public
Știință/Cercetare, Utilizatori finali/Desktop
Interfața cu utilizatorul
Java Swing
Limbaj de programare
Java
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/pontos/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
