Aceasta este aplicația Linux numită Power Decoder, care rulează online în Linux, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca PowerDecoder-1.0.0.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Power Decoder pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
Power Decoder să ruleze online în Linux
Ad
DESCRIERE
Screeningul interferenței ARN (ARNi) folosind ac de păr scurt (sh)ARN este un instrument puternic, cu randament ridicat, pentru determinarea relevanței biologice a genelor pentru un fenotip. Evaluarea performanței unui ecran grupat shRNA este dificilă în practică; se poate estima performanța doar utilizând reproductibilitatea ca proxy pentru putere sau utilizând un număr mare de controale pozitive și negative validate. Aici, dezvoltăm un instrument software open-source, simulatorul Power Decoder, pentru generarea de experimente de screening combinate shRNA in silico care poate fi folosit pentru a estima puterea statistică a unui ecran. Folosind distribuția binomială negativă, modelează atât abundența relativă a mai multor shRNA-uri într-o singură replicare de screening, cât și zgomotul biologic dintre replici pentru fiecare shRNA individual. Simulatorul Power Decoder este scris în R și Python.Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/powerdecoder/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
