Aceasta este aplicația Linux numită SSC a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca SSC0.1.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SSC cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SSC
Ad
DESCRIERE
SSC este un instrument pentru prezicerea eficienței sgRNA din secvențele spacer. Suportă aplicațiile de optimizare a bibliotecilor sgRNA în ecranele de inhibare/activare CRISPR/Cas9 sau CRISPR/dCas9.DESCRIERE
- Extragerea secvențelor de distanțiere candidate din fișierul .fasta
- Preziceți eficiența sgRNA din secvențele distanțiere, pentru proiectarea bibliotecii în knockout CRISPR/Cas9 și inhibarea sau activarea CRISPR/dCas9.
- furnizează matrice care acceptă: distanțiere de 19-20 bps în knockout CRISPR/Cas9, optimizate pentru genomul uman și șoarece.
- furnizează matrice care acceptă: distanțiere de 19-21 bps în CRISPR/dCas9, optimizate pentru genomul uman.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/spacerscoringcrispr/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.