Aceasta este aplicația Linux numită StatAlign, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca StatAlign-v2.1.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită StatAlign pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
StatAlign pentru a rula în Linux online
Ad
DESCRIERE
StatAlign este un pachet software extensibil pentru analiza bayesiană a secvențelor de proteine, ADN și ARN. Aliniamente multiple, arbori filogenetici și parametri evolutivi sunt co-estimați într-un cadru Markov Chain Monte Carlo, permițând măsurarea fiabilă a preciziei rezultatelor.Această abordare elimină artefactele comune de care suferă metodele tradiționale, cu prețul unui timp de calcul crescut. Aceste artefacte includ dependența filogeniei construite de o singură aliniere (probabil suboptimală) și părtinire față de arborele de ghidare pe care se bazează alinierea.
Modelele din spatele analizei permit compararea secvențelor îndepărtate evolutiv: modelul de inserție-ștergere TKF92 poate fi cuplat la un model de substituție arbitrară. O gamă largă de modele pentru datele de nucleotide și aminoacizi este inclusă în pachet, iar sistemul de gestionare a plug-in-ului asigură că pot fi adăugate cu ușurință noi modele.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/statalign/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.