Aceasta este aplicația Windows numită PBSuite a cărei cea mai recentă versiune poate fi descărcată ca PBSuite_15.8.24.tgz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită PBSuite cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
SCREENSHOTS
Ad
PBSuite
DESCRIERE
Acesta găzduiește în prezent două proiecte create și întreținute de Adam English.
PBJelly - instrumentul de actualizare a genomului.
PBHoney - instrumentul de descoperire a variațiilor structurale
Ambele sunt incluse în codul PBSuite găsit în descărcări.
----- PBJelly -----
Citește ziarul
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly este o conductă extrem de automatizată care aliniază citirile de secvențiere lungi (cum ar fi citirile PacBio RS sau citirile lungi de 454 în format fasta) cu asamblarea schiței de mare încredere. PBJelly umple sau reduce cât mai multe goluri capturate posibil pentru a produce genomuri de schiță îmbunătățite.
----- PBHoney -----
Citește ziarul
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney este o implementare a două abordări de identificare a variantelor concepute pentru a exploata mapabilitatea ridicată a citirilor lungi (adică, mai mare de 10,000 bp). PBHoney ia în considerare atât discordanța intra-citire, cât și cozile tăiate moale ale citirilor lungi pentru a identifica variantele structurale.
Categorii
- Ansamblul genomului
- Upgrade genomului
- Variația structurală
- Evaluarea ansamblului
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Piton
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
