Это команда altree-convertp, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
altree-convert - Заголовок ...
СИНТАКСИС
altree-convert [параметры]
Опции:
--version версия программы
--short-help | h краткое справочное сообщение
- справочное сообщение с описанием опций
--man полная документация
--first-input-file | я входной файл 1
--second-input-file | j входной файл 2 (не обязательно)
--output-file | o выходной файл
--case-control-output | c вывод, содержащий nb случаев / элементов управления
--тип данных | t ДНК | ЧИСЛО
--phylo-prog | p PAUP | ФИЛИП
--reconstruct-prog | r ФАЗА | FAMHAP
--data-quali | q Тип данных: качественные или количественные
--nbind-threshold | s Минимальное количество особей, требуемых для сохранения гаплотипа
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
--версия
Распечатайте версию программы и выйдите.
--короткая-помощь
Распечатайте краткое справочное сообщение и выйдите.
--Помогите Распечатайте справочное сообщение с описанием опций и выходами.
--человек Печать страницы руководства и выход.
--first-input-file | я
Входной файл 1 (выход программы реконструкции гаплотипа)
- второй-входной-файл | j
Входной файл 2 (второй выходной файл famhap или файл, содержащий статус болезни)
--output-file | o
Выходной файл
--case-control-output | c
Выходной файл, содержащий количество наблюдений и элементов управления, несущих каждый гаплотип.
- тип данных | t «ДНК» | «СНП»
Тип данных: ДНК (ATGCU) или SNP (0-1)
--phylo-prog | p "филлип" | "пауп"
Программа реконструкции филогении
реконструировать-прог | г "фамхап | фаза"
Программа реконструкции гаплотипа
качество данных | q "качественный | количественный"
Тип анализируемых данных
nbind-threshold | s
Минимальное количество особей, несущих гаплотип, необходимое для его хранения.
дальнейший анализ. Если вы хотите сохранить все гаплотипы, вы должны изменить 0 на этот
переменная
ОПИСАНИЕ
Эта программа прочитает указанный входной файл (ы) и сгенерирует входной файл для
программное обеспечение для филогенетической реконструкции paup или phylip / paml
Используйте altree-convertp онлайн с помощью сервисов onworks.net
