Это команда bp_multi_hmmsearch.plp, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
multi_hmmsearch - выполнить поиск в нескольких файлах FASTA, используя
файл INDEX
СИНТАКСИС
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f файл_индекса
ОПИСАНИЕ
Технически это не скрипт Bio :: Tools :: Run, так как он не использует ни Bioperl, ни Bioperl-run.
компоненты, но это полезно.
обязательное Опции:
-p Профиль HMM, используемый для поиска.
-f INDEX файл, содержащий список файлов FASTA для нескольких
поиск.
Особый Опции:
-i Создать новый индексный файл с полученными файлами hmms. Это
полезно, если вы хотите передать этот список в качестве входных аргументов в
другие программы.
-h Показать эту документацию.
СВЯЗЬ
Рассылка Списки
Отзывы пользователей - неотъемлемая часть развития этого и других модулей Bioperl. послать
Ваши комментарии и предложения желательно направлять в список рассылки Bioperl. Ваше участие
очень ценится.
[электронная почта защищена] - Обсуждение
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - О списках рассылки
Reporting ошибки
Сообщайте об ошибках в систему отслеживания ошибок Bioperl, чтобы мы могли отслеживать ошибки и их
разрешающая способность. Отчеты об ошибках можно отправлять через Интернет:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Используйте bp_multi_hmmsearch.plp в Интернете с помощью сервисов onworks.net
