Это команда fastq_quality_filter, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
fastq_quality_filter - фильтрует последовательности по качеству
ОПИСАНИЕ
использование: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Часть
FASTX Toolkit 0.0.14 от А. Гордона ([электронная почта защищена])
[-h] = Этот полезный экран справки.
[-q N] = минимальный показатель качества, который необходимо сохранить.
[-p N] = Минимальный процент баз, которые должны иметь качество [-q].
[-z] = Сжать вывод с помощью GZIP.
[-i ИНФАЙЛ]
= FASTA / Q входной файл. по умолчанию - STDIN.
[-o OUTFILE] = выходной файл FASTA / Q. по умолчанию - STDOUT. [-v] = Подробно -
сообщить количество последовательностей.
Если указано [-o],
отчет будет распечатан в STDOUT.
Если [-o] не указано (и вывод идет в STDOUT), отчет будет распечатан в
СТДЕРР.
Используйте fastq_quality_filter онлайн с помощью сервисов onworks.net
