gdcm2vtk - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

gdcm2vtk - конвертировать файл, поддерживаемый VTK, в DICOM.

СИНТАКСИС

gdcm2vtk [параметры] файл-вход файл-выход

ОПИСАНИЕ

Ассоциация gdcm2vtk принимает в качестве входных данных любой файл, поддерживаемый VTK (включая файл DICOM), и будет
сгенерировать в качестве вывода файл DICOM.

ПАРАМЕТРЫ

файл входного имени файла (поддерживается DICOM или VTK)

файл вывода имя файла (поддерживается DICOM или VTK)

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ

конкретный кредита
--force-rescale масштабирование силы.
- расстояние между усилиями и усилием.
--palette-color, если поддерживается, создать файл PALETTE COLOR.
--argb, если поддерживается, создать файл ARGB.
--compress, если поддерживается, создать сжатый файл.
--use-vtkdicom Использовать vtkDICOMImageReader (вместо GDCM).
--modality set Модальность.
--lower-left установить нижний левый.
--shift установить shift.
--scale установить масштаб.
- сжатие набора данных (MetaIO).
-T --study-uid UID исследования.
-S --series-uid UID серии.
--root-uid Корневой UID.

(сила) кредита
-J --jpeg Сжать изображение в формате jpeg.
-K --j2k Сжать изображение в формате j2k.
-L --jpegls Сжать изображение в формате jpeg-ls.
-R --rle Сжать изображение в режиме реального времени (только без потерь).

Генеральная кредита
-ч --помощь
распечатайте этот текст справки и выйдите

-v --версия
распечатать информацию о версии и выйти

-V - многословный
подробный режим (предупреждение + ошибка).

-W - предупреждение
режим предупреждения, печать предупреждений

-E - ошибка
режим ошибок, информация об ошибках печати

-D --отладка
режим отладки, печать отладочной информации

охрана окружающей среды переменная
GDCM_ROOT_UID корневой UID

ОПИСАНИЕ

Преобразуйте файл, поддерживаемый VTK, в DICOM.

Типичное использование:

Входной файл $ gdcm2vtk output.dcm

Он использует внутренний заводской механизм VTK для распознавания файла (функция CanRead). Видеть
Поддерживаемый файл VTK здесь:

Какие форматы файлов изображений VTK может читать и писать? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ# What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Если ваш входной файл состоит из 4 компонентов, 4-я композиция (альфа) будет удалена из вывода.
файл, поскольку DICOM больше не поддерживает альфа-компонент (см. параметр –argb).

Особое внимание было уделено следующему формату файла:

1. DICOM: Направляющие косинусы и vtkMedicalImageInformation передаются на выход.
2. BMP: файл можно сохранить с помощью таблицы поиска (см. --Palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties передается на выход.
4. MINC: На выход передаются направляющие косинусы.
5. TIFF: vtkTIFFReader в настоящее время находится в плохом состоянии в VTK (другое поведение в VTK 5.2 и git / master). Используйте его, только если знаете, что делаете.

CONVERT Метаизображение (МХД, мха)
$ gdcm2vtk входной файл output.mha

Эта команда преобразует входной файл DICOM: inputfile в файл MetaImage .mha. Тем же
идет для файла .mhd.

CONVERT MHA / MHD
$ gdcm2vtk входной файл output.mha

or

$ gdcm2vtk файл ввода output.mhd

Эта команда преобразует входной файл DICOM: inputfile в MetaImageData .mha / .mhd
.

CONVERT VTI
Входной файл $ gdcm2vtk output.vti

Эта команда преобразует входной файл DICOM: inputfile в XML VTK ImageData .vti.
.

CONVERT ВТК
$ gdcm2vtk файл ввода output.vtk

Эта команда преобразует входной файл DICOM: входной файл в старый структурированный VTK.
PointSets .vtk файл.

CONVERT DICOM

$ gdcm2vtk ввод.dcm вывод.dcm

vtkGDCMImageReader будет использоваться для чтения в файле DICOM, а не по умолчанию
vtkDICOMImageReader. См. Параметр –use-vtkdicom для использования vtkDICOMImageReader.

ПОЕЗДКА В ОБА КОНЦА DICOM К MHD К DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modality США --imageformat 7 выход.mhd выход.dcm

В приведенном выше разделе показано, как преобразовать DICOM с помощью фотометрической интерпретации
YBR_FULL (или даже YBR_FULL_422 с потерями) в другой формат файла: MetaImage (mhd). С
этот формат файла не обрабатывает цветовое пространство, мы должны явно установить его, используя
Параметр командной строки –imageformat. В этом случае требуется опция командной строки –modality.
случай, поскольку семейство классов хранения вторичных изображений захвата по умолчанию не допускает YBR
Фотометрическая интерпретация.

GDCM2VTK ПРИМЕЧАНИЯ

ВАЖНОЕ ПРИМЕЧАНИЕ: Внутренний структурированный VTK будет заполнен из входного DICOM, а затем
перейти к выходному модулю записи DICOM. Некоторая информация может быть потеряна во время конвертации
DICOM в VTK в DICOM. Эта опция в основном используется для проверки
Комбинация vtkGDCMImageReader / vtkGDCMImageWriter.

ВАЖНОЕ ПРИМЕЧАНИЕ. При преобразовании из формата с потерями, такого как JPEG, информация о
потеря важна. Выходной DICOM будет содержать необходимое изображение с потерями.
Атрибут сжатия, указывающий, что изображение было сжато с потерями где-то в
трубопровод. См. Также gdcmimg (лучшая обработка JPEG в целом).

ВАЖНОЕ ПРИМЕЧАНИЕ. При использовании –use-vtkdicom выходной файл DICOM всегда будет записан как
MR Image Storage, поскольку эта информация недоступна для самого считывателя. Это позволяет
правильную настройку ориентации изображения (пациент).

Используйте gdcm2vtk онлайн с помощью сервисов onworks.net