Это команда ilink, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
ilink - процедура оптимизации GEMINI для поиска локально оптимального значения тета-вектора
фракций рекомбинации
СИНТАКСИС
iLink [кредита] ipedfile.dat pedfile.dat
ОПИСАНИЕ
Эта страница руководства кратко документирует iLink команда. На самом деле это очень грубое намерение
предоставить справочную страницу, потому что дистрибутив Debian GNU / Linux требует, чтобы каждая программа
есть справочная страница. Любое улучшение будет очень оценено.
iLink является частью быстрая ссылка пакет программного обеспечения.
ILINK использует процедуру оптимизации GEMINI, чтобы найти локально оптимальное значение тета
вектор фракций рекомбинации. Если вы используете сценарии по умолчанию, созданные lcp, ваш
начальное предположение для теты составляет 1 во всех измерениях. GEMINI оценивает каждую тэту по ее
вероятность, стремясь найти тета-векторы, которые имеют более высокую вероятность происхождения.
Процедура GEMINI состоит из нескольких итераций. Каждой итерации соответствует одна строка
выход. Каждая итерация включает несколько оценок функции правдоподобия. Каждая итерация
имеет две фазы. На Фазе I GEMINI стремится улучшить текущую лучшую тэту. На этапе II,
GEMINI оценивает градиент правдоподобия относительно текущего лучшего тета
вектор. В первой итерации фаза I оценивает вероятность только на начальном этапе.
кандидат тета.
Когда ILINK выводит такую строку, как: maxcensor, можно уменьшить до -32767, она завершена.
оценка первой функции правдоподобия. На больших пробегах этот факт можно использовать для оценки
Продолжительность. Разумная приблизительная оценка количества вычислений функции:
10 * (количество измерений тета-вектора). Число измерений тета-вектора равно
в большинстве случаев на один меньше, чем количество локусов. Если разрешены малетета и женская тета
отличаться (для sexdif установлено значение 1), то количество измерений удваивается до 2 * (количество
loci - 1). Оценка других параметров (при установке fitmodel в true) также может увеличить
количество измерений.
Чтобы узнать больше о iLink может быть полезно прочитать файл
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK если у вас есть система Debian GNU / Linux.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
Могут быть варианты, но информации о них я не нашел. Пожалуйста, вперед
любую информацию о них[электронная почта защищена]>
Используйте ilink онлайн с помощью сервисов onworks.net
