Это команда maf2anchors.pl, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
maf2anchors - конвертирует файлы maf в наборы привязок Murasaki
СИНТАКСИС
maf2anchors
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
--prefix =
использовать в качестве префикса для имен выходных файлов (в противном случае используется )
--rifts =
допускать до перекатов.
--fakeseqs
генерировать файлы фиктивной длины последовательности и заглушки последовательности на основе данных длины последовательности
в файле MAF
--доверять
доверять аннотации комментария, добавленной TBA во вторую строку файла (если она есть)
что в нем перечислено дерево, использованное при выравнивании, и все задействованные последовательности. По умолчанию
на. используйте --notrust, чтобы не доверять тегам TBA (технически эти данные не являются частью
спецификация формата файла и просто забита комментариями, которые производит TBA, но
может не присутствовать или быть точным для всех файлов MAF, поэтому мы даем вам возможность
не доверяйте этому).
--Сортировать
Отсортируйте последовательности, найденные с помощью --trust (так, чтобы они соответствовали выходным данным,
произошло с --notrust).
Используйте maf2anchors.pl онлайн с помощью сервисов onworks.net