Это команда masai_output_pe, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
masai_output_pe - Выход Масаи - Парный конечный режим
СИНТАКСИС
masai_output_pe [ОПЦИИ]
ОПИСАНИЕ
Масаи - это быстрый и точный картограф, основанный на приблизительных семенах и множественных
возврат.
Читать http://www.seqan.de/projects/masai чтобы получить больше информации.
(c) Авторские права 2011-2012 Энрико Сирагуса.
-h, --Помогите
Отображает это справочное сообщение.
--версия
Отображение информации о версии
Варианты сопряжения:
-ng, - без пробелов
Не выравнивайте показания по пробелам.
-ll, - длина библиотеки NUM
Длина библиотеки. По умолчанию: 220.
-Le, --библиотека-ошибка NUM
Допуск по длине библиотеки. По умолчанию: 50.
Параметры вывода:
-t, --tmp-папка STR
Укажите огромную временную папку. По умолчанию: использовать папку генома.
-o, --выходной файл ФАЙЛОВ
Укажите выходной файл. По умолчанию: использовать префикс имени файла для чтения. Допустимые типы файлов
являются: raw и sam.
-нк, - без сигары
Не выводить строку CIGAR. Это влияет только на вывод SAM.
Параметры отладки:
-й, --без свалки
Не сваливайте результаты.
Версия
masai_output_pe версия: 0.7.1 [14053] Последнее обновление 2013-05-16
Используйте masai_output_pe в Интернете с помощью сервисов onworks.net
