Это команда mia-2dmyocard-ica, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
mia-2dmyocard-ica - запустить анализ ICA на серии 2D-изображений
СИНТАКСИС
миа-2dmyocard-ica -i [опции]
ОПИСАНИЕ
миа-2dmyocard-ica Эта программа используется для запуска ICA на серии перфузий миокарда.
изображения для создания синтетических ссылок, которые можно использовать для коррекции движения по изображению
Регистрация. Если цель состоит в том, чтобы запустить полную компенсацию движения, лучше создать
набор сегментации и используйте mia-2dmyoica-nonrigid. Если входные данные заданы с помощью
segmentation set, то можно также использовать mia-2dmyocard-icaseries. Эта программа
в основном используется для тестирования различных вариантов запуска образа ICA forreference
творение.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
-i --in-base = (ввод, обязательно); io
имя входного файла или имя шаблона запроса XXXX.ext X = числа Для поддерживаемого файла
типы см. ПЛАГИНЫ: 2dimage / io
--coefs =
выводить коэффициенты микширования в этот файл
-o --out-base = (вывод); нить
база имен выходных файлов
-t --type = exr
тип выходного файла
Поддержанный ценности находятся:( @, BMP, ДКМ, ЭКС, JPEG, JPG, PNG, СЫРОЙ,
ТИФ, ТИФФ, V, ВИСТА, BMP, дсм, экср, JPEG, jpg, png сырье, тиф,
размолвка v, вид )
-k --skip = 2
пропустить изображения в начале серии пропустить изображения в начале серии
-e --end = 60
последнее изображение в сериипоследнее изображение в серии
-C --components = 0
номер компонентов, 0 = оценка автоматически nr. компонентов, 0 = оценка
автоматически
-m --strip-mean
вырезать среднее изображение из серии
-f --save-features =
сохранить изображение функции
-p - полосно-периодический
снимать только периодическую составляющую
-x --max-ica-iterations = 0
максимальное количество итераций решателя ICA; максимальное количество итераций решателя ICA.
-n --ica-нормализовать
ica_normalize изображения функций
--all-features =
сохранить все изображения функций в
-L --LV-crop-amp = 0
Усиление маски LV кропа, 0.0 = не обрезать Усиление маски кропа LV, 0.0
= не обрезать
-a --авто-компоненты
автоматическая оценка количества компонентов на основе корреляции. Подразумевает
-m и -n (экспериментальный)
Документи & Инфо
-V --verbose = предупреждение
многословность вывода, печать сообщений заданного уровня и более высокого приоритета.
Поддерживаемые приоритеты, начиная с самого низкого уровня:
info - Сообщения низкого уровня
прослеживать - Трассировка вызова функции
неудача - Сообщать об ошибках тестирования
предупреждение - Предупреждения
ошибка - Сообщать об ошибках
отлаживать - Вывод отладки
сообщение - Нормальные сообщения
роковой - Сообщать только о фатальных ошибках
--авторское право
распечатать информацию об авторских правах
-ч --помощь
распечатать эту справку
-? --использование
распечатать краткую справку
--версия
распечатайте номер версии и выйдите
Обработка
--threads = -1
Максимальное количество потоков для обработки, это число должно быть меньше
или равно количеству ядер логического процессора в машине. (-1:
автоматическая оценка) .Максимальное количество потоков для обработки.
число должно быть меньше или равно количеству ядер логического процессора в
машина. (-1: автоматическая оценка).
ПЛАГИНЫ: 2dimage / io
BMP Поддержка ввода / вывода 2D-изображений BMP
Распознаваемые расширения файлов: .BMP, .bmp.
Поддерживаемые типы элементов:
двоичные данные, 8 бит без знака, 16 бит без знака
пул данных Виртуальный ввод-вывод во внутренний пул данных и из него
Распознаваемые расширения файлов:. @
DICOM 2D-изображение io для DICOM
Распознаваемые расширения файлов: .DCM, .dcm.
Поддерживаемые типы элементов:
16 бит со знаком, 16 бит без знака
EXR плагин 2dimage io для изображений OpenEXR
Распознаваемые расширения файлов: .EXR, .exr.
Поддерживаемые типы элементов:
32 бита без знака, 32 бита с плавающей запятой
JPG плагин 2dimage io для изображений в серой шкале jpeg
Распознаваемые расширения файлов: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg.
Поддерживаемые типы элементов:
беззнаковый 8 бит
PNG плагин 2dimage io для изображений PNG
Распознаваемые расширения файлов: .PNG, .png.
Поддерживаемые типы элементов:
двоичные данные, 8 бит без знака, 16 бит без знака
сырье Поддержка вывода 2D-изображений в формате RAW
Распознаваемые расширения файлов: .RAW, .raw.
Поддерживаемые типы элементов:
двоичные данные, 8 бит со знаком, 8 бит без знака, 16 бит со знаком, 16 бит без знака,
32-разрядный со знаком, 32-разрядный без знака, 32-разрядный с плавающей запятой, 64-разрядный с плавающей запятой
бит
TIF Поддержка ввода / вывода 2D-изображений в формате TIFF
Распознаваемые расширения файлов: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff.
Поддерживаемые типы элементов:
двоичные данные, беззнаковые 8-битные, беззнаковые 16-битные, беззнаковые 32-битные
перспектива плагин 2dimage io для изображений Vista
Распознаваемые расширения файлов: .V, .VISTA, .v, .vista.
Поддерживаемые типы элементов:
двоичные данные, 8 бит со знаком, 8 бит без знака, 16 бит со знаком, 16 бит без знака,
32-разрядный со знаком, 32-разрядный без знака, 32-разрядный с плавающей запятой, 64-разрядный с плавающей запятой
бит
ПРИМЕР
Оцените синтетические ссылки из изображений imageXXXX.exr и сохраните их в refXXXX.exr
с использованием пяти независимых компонентов, означающих удаление, нормализацию и пропуск 2 изображений.
mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n
Авторы)
Герт Волльни
АВТОРСКИЕ ПРАВА
Это программное обеспечение защищено авторскими правами (c) 1999-2015 гг., Лейпциг, Германия, и Мадрид, Испания. Это приходит
с СОВЕРШЕННО ОТСУТСТВИЕМ ГАРАНТИЙ, и вы можете распространять его в соответствии с условиями GNU
ОБЩАЯ ОБЩЕСТВЕННАЯ ЛИЦЕНЗИЯ Версия 3 (или новее). Для получения дополнительной информации запустите программу с
вариант '- авторское право'.
Используйте mia-2dmyocard-ica онлайн с помощью сервисов onworks.net