АнглийскийФранцузскийИспанский

Запустить серверы | Ubuntu > | Fedora > |


Значок OnWorks

micalc - Интернет в облаке

Запустите micalc в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks через Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS

Это команда micalc, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.

ПРОГРАММА:

ИМЯ


micalc - выполняет основную математику с наборами данных

ОПИСАНИЕ


micalc: выполняет основную математику с наборами данных

Форматы файлов автоматически идентифицируются по их расширению. Для двоичного
операции с двумя входными файлами, будет использоваться протокол первого входного файла
для выходного файла.

Микальк может be используемый in one of что собой представляет после режимы:
Бинарная операция с наборами данных и / или скалярными числами:

micalc [-if1 | -в 1 ] -op
[-if2 | -в 2
] -из

Накопление одного набора данных:

Микальк -если -op

Преобразование (величина, логарифм, отрицание, инверсия или acos) одних данных
задавать:

Микальк -если -op -из

Статистика одного набора данных:

Микальк -если [-иметь в виду ] [-stdev ] [-fluct
] [-tcourse ] [- hist
-HistSlots [-histmin ] [-histmax ]
[-rightstairs] [-histfract] [-loghist]]

Дополнительно опции:
-маска

Файл читать опции:
-Дата: Дата сканирования [ггггммдд] (по умолчанию = 20140807ггггммдд)

-fp: FOV в направлении фазы [мм] (по умолчанию = 220.0 мм)

-пт: FOV в направлении чтения [мм] (по умолчанию = 220.0 мм)

-фс: FOV в направлении среза [мм] (по умолчанию = 5.0 мм)

-номер: Количество последовательных измерений (по умолчанию = 1)

-nx: Количество точек в направлении чтения (по умолчанию = 128)

-ни: Количество точек в направлении фазы (по умолчанию = 128)

-nz: Количество точек в направлении среза (по умолчанию = 1)

-рождение: Дата рождения пациента [ггггммдд] (по умолчанию = 00000000ггггммдд)

-пид: Уникальный идентификатор пациента (по умолчанию = Неизвестно)

-pname: Полное имя пациента (по умолчанию = Неизвестно)

-псекс: Пол пациента (параметры = MFO, по умолчанию = O)

-вес: Вес пациента [кг] (по умолчанию = 50.0 кг)

-ученый: Имя ученого (по умолчанию = Неизвестно)

-сд: Расстояние между срезами (от центра к центру) [мм] (по умолчанию = 10.0 мм)

-серд: Описание серии (по умолчанию = Неизвестно)

-серно: Серийный номер (по умолчанию = 1)

-st: Толщина среза [мм] (по умолчанию = 5.0 мм)

-шпилька: Описание исследования (по умолчанию = неизвестно)

-tcname: Имя передающей катушки (по умолчанию = Неизвестно)

-чай: Время до эха последовательности [мс] (по умолчанию = 80.0 мс)

-время: Время сканирования [ччммсс] (по умолчанию = 091012ччммсс)

-тр: Время между последовательными возбуждениями [мс] (по умолчанию = 1000.0 мс)

-cplx: Рассматривать данные как сложные и извлекать данный компонент (параметры = нет абс.
imag, по умолчанию = нет)

-дс: Индекс набора данных для извлечения при чтении нескольких наборов данных

-фильтр: Читать только те наборы данных, параметр протокола которых 'key' содержит строку
'значение' (дается в формате 'ключ = значение')

-fmap: Для уменьшения использования памяти сохраняйте отображение файлов после чтения (сырых) данных, но при записи
в массив приведет к сбою

-jdx: Если присутствует несколько массивов JDX, выберите это

-диалект: Читать данные с использованием заданного диалекта формата. (по умолчанию диалект отсутствует)

-рф: Формат чтения, используйте его для переопределения расширения файла (options = autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, по умолчанию = автоопределение)

-пропускать: Пропустить это количество байтов перед чтением необработанных данных (по умолчанию = 0)

Файл записывать опции:
-приложить: Добавить в существующий файл, только для необработанных данных

-fnamepar: Разделенный пробелами список параметров протокола для включения при создании уникальных
имена файлов

-без масштаба: Не изменять масштаб значений при сохранении целых чисел.

-Трещина: Принудительное разделение пар протокол-данные на отдельные файлы.

Типа: Тип представления изображения (опции = автоматическое с плавающей запятой double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit, по умолчанию = автоматически)

-wдиалект: Записывать данные, используя заданный диалект формата. (по умолчанию диалект отсутствует)

-вф: Формат записи, используйте его для переопределения расширения файла (options = autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, по умолчанию = автоопределение)

-wp: Сохраните протокол отдельно в этот файл.

Фильтры прикладной в вход файл (ы) и маска:
-выровнять : Выровнять данные по геометрии (расположению вокселей)
внешний файл

-автомаска : Создать маску с использованием автоматического порога на основе гистограммы

-кластер : Создание кластеров ненулевых вокселей соседних / следующих соседей, отсортированных по размеру

-свернуть <convolution kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp), диаметр ядра [мм]>: Свертка в пространственных измерениях

- детренд <Number of low frequency components to be removed,Zero mean of resulting
timecourse>: убрать медленный дрейф с течением времени

-редактировать <Position/range string in the format (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),new value
of voxel>: редактировать значения отдельных вокселей

-маска гена : Создать маску, включающую все воксели со значением
в заданном диапазоне

-изотроп : сделать воксели изображения изотропными посредством интерполяции (изображение
геометрия не изменится)

-НЧ : Фильтрация нижних частот

-Максимум : Обрезать все значения выше максимального значения

-максип : Выполнить проецирование с максимальной интенсивностью
по заданному направлению

-слияние : Объединение наборов данных в один набор данных путем расширения измерения времени.

-мин : Вырезать все значения ниже минимального значения

-минип : Выполнить проецирование с минимальной интенсивностью
по заданному направлению

-ноНаН : Заменяет каждое NaN заданным значением

-пфлип : Перевернуть данные по фазе

-пранг : Выбрать диапазон в
фазовое направление

-проект : Выполнить среднее прогнозирование на заданное
направление

-квантильная маска : Создать маску, включающую все воксели выше данного дробного
порог

-ресемпл : Временное изменение размера данных изображения

-размер : Пространственное изменение размера данных изображения

-резать : преобразовывает изображение к заданному
ориентация

-rflip : Перевернуть данные в направлении чтения

гниль : Вращение в плоскости

-ранжировать : Выбрать диапазон в
читать направление

-масштаб : Масштабировать значения изображения

-флип : Отразить данные в направлении среза

-сдвиг <readDirection shift [pixel],phaseDirection shift [pixel],sliceDirection shift
[пиксель]>: сдвиг данных по пространству

-слайстайм : Правильно для
разные моменты времени получения срезов

-сплейс : соединяет
изображение в заданном направлении

-оранжевый : Выбрать диапазон в
направление среза

-swapdim <[rps] [-], [rps] [-], [rps] [-]>: поменять местами / отразить размеры, указав направление
тройной с добавленным дополнительным знаком отражения

-плитка : Объединение фрагментов в квадратное 2D-изображение

-странный : Выбрать диапазон в
направление времени

-сдвиг : Сдвиг данных во времени

-типмакс : Вырезать все значения выше максимума определенного типа данных

-typemin : Вырезать все значения ниже минимума определенного типа данных

-использовать маску : Создать 1D набор данных, включая все значения в маске из файла

Другое опции:
-v или для отладки / отслеживания всех компонентов или одного
компонент соответственно. Возможные значения для уровня журнала: 0 (noLog), 1 (errorLog),
2 (журнал предупреждений), 3 (журнал информации).

-h, --Помогите, -Помощь, --версия : Распечатать текст справки или информацию о версии

Поддержанный файл расширения (форматы):
3 дБ (двоичные данные Iris3D)

анализировать
(NIFTI / ANALYZE, диалекты: fsl)

asc (ASCII, диалекты: tcourse)

coi (наборы данных JCAMP-DX)

dat (матрица 2D данных Matlab ascii)

dcm (DICOM, диалекты: siemens)

двойной (двойные исходные данные)

float (необработанные данные с плавающей точкой)

gz (контейнер GNU-Zip для других форматов)

hdr (Interfile, диалекты: нейростат)

hdr (НИФТИ / АНАЛИЗ, диалекты: fsl)

idx (3D-индексы ненулевых в ASCII)

ima (DICOM, диалекты: siemens)

межфайловый
(Интерфайл, диалекты: нейростат)

jdx (формат изображения JCAMP-DX)

mag (DICOM, диалекты: siemens)

mhd (метаизображение)

nii (NIFTI / ANALYZE, диалекты: fsl)

ph (DICOM, диалекты: siemens)

png (переносимая сетевая графика)

pos (xy позиции ненулевых в ASCII)

pro (протоколы измерений ODIN)

регистр (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (16-битные необработанные данные со знаком)

s32bit (32-битные необработанные данные со знаком)

s8bit (8-битные необработанные данные со знаком)

smp (наборы данных JCAMP-DX)

u16bit (16-битные необработанные данные без знака)

u32bit (32-битные необработанные данные без знака)

u8bit (8-битные необработанные данные без знака)

Используйте micalc онлайн с помощью сервисов onworks.net


Ad


Ad