Это приложение для Linux под названием Chemical Trajectory Analyzer, последний выпуск которого можно загрузить как ChemTraYzer_2.1.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Chemical Trajectory Analyzer с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Химический анализатор траектории
ОПИСАНИЕ
ChemTraYzer создает модели реакций на основе моделирования молекулярной динамики. Он доступен как открытое программное обеспечение (лицензия MIT). Пожалуйста, найдите полное описание @ https://www.ltt.rwth-aachen.de/cms/LTT/Forschung/Forschung-am-LTT/Model-Based-Fuel-Design/Aktuelle-Projekte/~kqbf/ChemTraYzer/lidx/1
M.Döntgen, M.-D.Przybylski-Freund, LCKröger, WAKopp, AEIsmail, K.Leonhard, "Автоматическое обнаружение путей реакций, констант скорости и переходных состояний с помощью моделирования реактивной молекулярной динамики", J. Chem. Теория вычисл. 11 (2015), 2517-2524
LCKröger, WAKopp, M.Döntgen, K.Leonhard, "Оценка статистических неопределенностей редких событий при моделировании реактивной молекулярной динамики", J. Chem. Теория вычисл. 13 (2017), 3955-3960
М.Дентген, Ф.Шмальц, В.А.Копп, Л.Крёгер, К.Леонхард, "Автоматизированное химико-кинетическое моделирование с помощью гибридной реактивной молекулярной динамики и моделирования квантовой химии", J. Chem. Инф. Модель. 58 (2018), 1343-1355
Проверьте Wiki для отчетов об ошибках и исправлениях.
Особенности
- Обработка траекторных симуляций LAMMPS / ReaxFF
- Автоматическое обнаружение событий реакции
- Оценка констант скорости
- Создание сетей реакции для последующей визуализации
Аудитория
Наука / Исследования, Инженерия
Язык программирования
Питон
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/chemtrayzer/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
