Это приложение для Linux под названием COV2HTML для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как map2cov_4.4_SRC.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием COV2HTML, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
COV2HTML для работы в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
COV2HTML предоставляет простой и домашний веб-интерфейс для биологов, который позволяет визуализировать покрытие для выравнивания NGS, необходимого для анализа. Он сочетает в себе два важных процесса: (i) MAP2COV, инструмент, который преобразует огромные файлы картографирования или покрытия NGS в файлы покрытия для конкретных источников света, которые содержат информацию о генетических элементах. (ii) COV2HTML, интерфейс визуализации, позволяющий анализировать данные в реальном времени с выбранными критериями. Таким образом, этот интерфейс предлагает визуализацию данных покрытия картирования NGS (DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq и TSS), выполненных в различных прокариотических организмах (бактериях, вирусах ...) или различных экспериментальных условиях (мутантные штаммы по сравнению с штаммами дикого типа или различные состояния роста…), облегчающие учебу.Особенности
- Визуализация покрытия цепи RNA-Seq: черный (цепь +), фиолетовый (цепь -)
- анализ особенностей нкРНК
- Поддерживаются масштабирование по осям X и Y
- Повышенная безопасность: HTTPS по умолчанию
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Project - это система пользовательского интерфейса (UI), Tk
Язык программирования
Питон, PHP
Среда базы данных
MySQL
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/cov2html/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
