Это приложение для Linux под названием CpDB, последний выпуск которого можно загрузить как CpDB.20150623.static.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CpDB с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
CpDB
Ad
ОПИСАНИЕ
Это программное обеспечение позволяет нам создавать реляционную базу данных в PostgreSQL, хранящую полные бактериальные геномы. Помимо самой базы данных, существует программное обеспечение, например, парсер, для преобразования файлов EMBL или GBK в реляционную схему CpDB. После того, как данные попадают в CpDB, можно извлекать неограниченное количество отчетов по бактериальным геномам с помощью SQL. Это программное обеспечение является частью программы доктора философии по биоинформатике, разработанной Андерсоном Сантосом (https://orcid.org/0000-0003-3418-0823), разработанный в рамках проекта пангенома Corynebacterium pseudotuberculosis (Cp). Пангеном Cp предоставил научному сообществу пятнадцать штаммов бактерий, хранящихся в базе данных GenBank в период с 2009 по 2012 год. Диссертация была написана на бразильском диалекте португальского языка. Однако глава книги на английском языке с описанием работы программы доступна по этому адресу: https://doi.org/10.5772/23724. CpDB является основой программного обеспечения Pannotator: https://pannotator.facom.ufu.br. Оба программного обеспечения все еще живы и здоровы.
Наслаждайся этим.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C, PL / SQL
Среда базы данных
PostgreSQL (pgsql)
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/cpdb/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
