Это приложение для Linux под названием GenOO-HTS для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием GenOO-HTS, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
GenOO-HTS для работы в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
GenOO-HTS [jee-noo] - проект с открытым исходным кодом; объектно-ориентированная среда Perl, специально разработанная для разработки инструментов анализа High Throughput Sequencing (HTS). Основная цель GenOO-HTS - сделать простые анализы HTS легкими и сделать возможными сложные анализы. GenOO-HTS моделирует биологические сущности в объекты Perl и предоставляет соответствующие атрибуты и методы, которые позволяют манипулировать данными высокопроизводительного секвенирования. Использование GenOO-HTS в качестве основного модуля разработки снижает накладные расходы и сложность управления данными и имеющимися биологическими объектами. GenOO-HTS был разработан так, чтобы быть гибким, легко расширяемым, с модульной структурой и минимальными требованиями к внешним инструментам и библиотекам.Особенности
- Организуйте биологические сущности как объекты perl (области генома, гены, транскрипты, интроны / экзоны и т. Д.)
- Организуйте объекты последовательности как объекты / атрибуты Perl (чтение последовательности, выравнивание и т. Д.)
- Упростите ввод-вывод из широко используемых форматов файлов (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Будьте последовательны и легко расширяемы
Аудитория
Наука / Исследования, Разработчики
Язык программирования
Perl
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/genoo/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
