Это приложение для Linux под названием Kinannote для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как Kinannote_1.0.tar. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Kinannote, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Kinannote для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Kinannote идентифицирует и классифицирует протеинкиназы в предоставленном пользователем файле fasta, используя HMM, полученный из сериновых / треониновых протеинкиназ, матрицу оценки, зависящую от положения, полученную из HMM, и сравнение с локальной версией курируемой базы данных киназ из kinase.com. Если пользователь вводит полный протеом, дополнительные модули оценивают полноту кинома и помещают его в контекст с эталонными киномами. Kinannote работает в командной строке unix и зависит от локальной установки hmmer 2 и Blast 2.24.Ссылаясь на Kinannote:
Kinannote, компьютерная программа для идентификации и классификации членов надсемейства эукариотических протеинкиназ
Джонатан М. Голдберг; Эллисон Григгс; Джанет Л. Смит; Брайан Хаас; Дженнифер Вортман; Цяньдун Цзэн
Биоинформатика 2013; DOI: 10.1093 / биоинформатика / btt419
HTTP: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
PDF: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Perl
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/kinannote/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
