Это приложение для Linux под названием lr2rmats для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием lr2rmats, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
lr2rmats для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
lr2rmats - это облегченный конвейер на основе Snakemake, который предназначен для использования данных РНК-seq третьего поколения для длительного чтения и короткого чтения второго поколения для создания файла расширенной аннотации генов. Вновь созданный файл аннотации может быть предоставлен в rMATS для дифференциального анализа альтернативного сращивания.Более подробную информацию можно найти по адресу: https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Особенности
- Долго читал
- РНК-сл
- Альтернативный сплайсинг
- Тихоокеанская бионаука
- Оксфорд Нанопор Технологии
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Оболочка Unix, Python, C
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
