Это приложение для Linux под названием TVscript, последний выпуск которого можно загрузить как tvscript.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение TVscript с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
телесценарий
ОПИСАНИЕ
TVscript - это инструмент, предназначенный для того, чтобы позволить пользователю исследовать удаление транскриптов, связанных с вариацией количества считываний внутри условия, превышающей установленный пользователем порог. Набор обновленных файлов счетчиков создается из исходных входных данных, в которых такие расшифровки отсутствуют. Эти обновленные файлы подсчета могут быть впоследствии использованы в последующем анализе, например, для идентификации дифференциально экспрессируемых транскриптов. В последнем случае степень вариации внутри состояния влияет на окончательные списки идентифицированных генов неоднозначно и непоследовательно в различных программах, разработанных для этой задачи. Возможность исследовать эффекты удаления таких вариаций при различных порогах увеличивает интуитивное понимание как по сравнению с анализом дифференциального выражения, так и с другими областями исследований, в которых используются такие данные. Полная информация и два тематических исследования с транскриптомными данными, связанными с одомашниванием псовых, доступны в нашей статье: ссылка будет доступна в ближайшее время.
Особенности
- Изучение эффектов вариации внутри состояния в наборах данных RNA-seq
- Полный пример тестовых данных в папке загрузки
- Исполняемый файл jar, работает на любой платформе
- Легко установить, просто разархивируйте папку
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал
Язык программирования
Java
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/tvscript/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
