Это приложение для Windows с именем dataMAPPs, последний выпуск которого можно загрузить как dataMAPPs_3.4.1.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием dataMAPPs с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
данныеMAPPs
ОПИСАНИЕ
dataMAPPs позволяет рутинную и эффективную обработку данных исследований иммуногенности с применением технологии пептидомики MAPPs для обнаружения потенциальных эпитопов MHCI- или MHC-II, представленных дендритными клетками (DC).
Он обеспечивает контроль качества исходных данных, нормализацию выборки / доноров и визуализацию результатов в стиле тепловой карты (heatMAPP). Ядро dataMAPPs - это общая библиотека R, которую можно адаптировать к конкретным проектам с помощью специальных сценариев управления, которые также позволяют воспроизводить пересчет результатов.
Обратитесь к файлу README за инструкциями по установке и использованию. Дополнительная документация предоставляется в формате PDF.
dataMAPPs публикуется под лицензией GPL группой ученых, работающих в Hoffmann-La Roche AG в Базеле, Швейцария. Программное обеспечение предоставляется как есть, чтобы надеяться на пользу другим исследователям.
Связанная публикация в Journal of Proteome Research:
DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00309
Особенности
- импорт данных по пептидомикам (вывод PEAKS, но может быть расширен)
- обширный контроль качества данных и исключение выборки с помощью определяемых пользователем пороговых значений
- специальная двухэтапная процедура нормализации для данных MAPP
- сопоставление пептидов с целевыми антителами / белками
- кластеризация положений картирования пептидов в области эпитопа горячих точек
- визуализация результатов картирования в виде тепловых карт
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал
Язык программирования
B / R
Среда базы данных
Плоский файл
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/datamapps/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
