Это приложение для Windows под названием Microarray associated motif Analyzer для запуска в Windows в режиме онлайн поверх Linux в режиме онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как MAMA_latest.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Microarray associated motif Analyzer, чтобы бесплатно запускать его в Windows онлайн через Linux онлайн с помощью OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
Анализатор мотивов, связанный с микрочипом, для работы в Windows онлайн через Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
Мы разработали новый метод без кластеризации, анализатор мотивов, связанных с микрочипами (MAMA), для прогнозирования новых цис-действующих элементов на основе сходства взвешенных последовательностей и профилей экспрессии генов в анализе микрочипов. Моделирование экспрессии генов выполняли с использованием машины опорных векторов и на основе наличия предсказанных мотивов и пар мотивов. Точность смоделированной экспрессии генов использовалась для оценки качества предсказания и оптимизации параметров, используемых в этом методе. После оптимизации MAMA точно смоделировал более 87% экспрессии генов.См. Kakei Y, Ogo Y, Itai RN, et al. (2013)Разработка нового метода прогнозирования цис-элементов для выдвижения гипотезы о совместных функциях пар цис-элементов при дефиците железа. Рис 6(1): 22.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Питон, Перл, С
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/microarray-motif-analyzer/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
