Это приложение для Windows под названием PBSuite, последнюю версию которого можно загрузить как PBSuite_15.8.24.tgz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием PBSuite с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
ПБСюит
ОПИСАНИЕ
В настоящее время здесь размещены два проекта, созданные и поддерживаемые Адамом Инглишем.
PBJelly - инструмент для обновления генома.
PBHoney - инструмент для обнаружения структурных вариаций
Оба они содержатся в коде PBSuite, который можно найти в загружаемых файлах.
----- ПБДжелли -----
Читать газету
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly - это высокоавтоматизированный конвейер, который согласовывает длинные чтения последовательности (такие как чтения PacBio RS или длинные чтения 454 в формате fasta) с черновыми сборками с высокой степенью достоверности. PBJelly заполняет или сокращает максимально возможное количество захваченных пробелов для получения обновленных черновых геномов.
----- ПБМед -----
Читать газету
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney - это реализация двух подходов к идентификации вариантов, предназначенных для использования высокой отображаемости длинных чтений (т. Е. Более 10,000 XNUMX бит / с). PBHoney учитывает как несогласованность внутри чтения, так и мягко обрезанные хвосты длинных чтений для выявления структурных вариантов.
Особенности
- Сборка генома
- Обновление генома
- Структурная вариация
- Оценка сборки
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Питон
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
