นี่คือคำสั่ง asn2ff ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
asn2ff - แปลงข้อมูลทางชีววิทยา ASN.1 เป็นรูปแบบแบน (เวอร์ชันเก่า)
เรื่องย่อ
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a ชื่อไฟล์] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l ชื่อไฟล์] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o ชื่อไฟล์] [-p F] [-q] [-r ชื่อไฟล์] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
DESCRIPTION
asn2ff แปลงคำอธิบายของลำดับทางชีวภาพจากรูปแบบ ASN.1 ของ NCBI เป็นหนึ่งของ
ไฟล์แบนหลายรูปแบบ โปรแกรมนี้สร้างขึ้นโดยใช้อินเทอร์เฟซที่เลิกใช้แล้ว โปรด
ใช้ asn2gb(1) แทน.
OPTIONS
สรุปตัวเลือกอยู่ด้านล่าง
- พิมพ์ข้อความการใช้งาน
-A X แสดงภูมิภาคเริ่มต้นที่ X (ค่าเริ่มต้นคือ 0)
-B X แสดงภูมิภาคสิ้นสุดที่ X (ค่าเริ่มต้นคือตำแหน่งสุดท้าย)
-C แสดงความเห็น Bankit
-G เอาต์พุตเป็น bioseq อันดับหนึ่งในมุมมองจีโนมเท่านั้น
-L F ใช้รูปแบบบรรทัด LOCUS แบบเก่า (pre-Genbank 127.0)
-M เอาต์พุตเป็นแผนที่ bioseq เท่านั้น
-R สำหรับการเปิดตัว GenBank
-V F อย่าใช้เวอร์ชัน
-a ชื่อไฟล์
ชื่อไฟล์สำหรับอินพุต ASN.1 (ค่าเริ่มต้นคือ stdin)
-b ป้อน asnfile ในโหมดไบนารี
-d ใช้การจัดทำดัชนี SeqMgr
-e อินพุตเป็นรายการลำดับ
-f b/p/e/s/x/z
รูปแบบผลลัพธ์:
b GenBank (ค่าเริ่มต้น)
พล.อ
อี EMBL
s หลอกEMBL
x GenBankเลือก
z ตราสัญลักษณ์
-g แสดงตัวเลข gi
-h F ซ่อนลำดับ
-k F อย่าใช้เซตที่ซับซ้อน (phy-set, mut-set, pop-set)
-l ชื่อไฟล์
บันทึกข้อผิดพลาดไปที่ ชื่อไฟล์
-m r/d/s/c/k/l/e/p
โหมดเอา:
r ปล่อย (ค่าเริ่มต้น)
d การถ่ายโอนข้อมูล
s เลื่อม
ค โครโมสโคป
k dir-sub-ดีบัก
ฉัน dir-sub
e แก้ไข
p รายงานบางส่วน
-n F การผูกมัดยีนที่เข้มงวด
-o ชื่อไฟล์
ชื่อไฟล์เอาต์พุต (ค่าเริ่มต้นคือ stdout)
-p F ละเว้นคุณสมบัติยีนใหม่
-q เอาต์พุตเป็น bioseq ตัวเดียวบนสุดเท่านั้น
-r ชื่อไฟล์
ไฟล์บันทึกข้อผิดพลาดของเอาต์พุต (ค่าเริ่มต้นคือ stderr)
-s อินพุตเป็น Seq-submit
-t แสดงข้อความแบบละเอียด
-v F ระงับข้อความแสดงข้อผิดพลาด
-w ใช้รูปแบบเอาต์พุต HTML
-y พิมพ์รูปแบบความช่วยเหลือเท่านั้น
-z อัลกอริทึมใหม่สำหรับชื่อองค์กร
ใช้ asn2ff ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net