bowtie2-inspect-l - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

bowtie2-inspect-l - ดึงข้อมูลจากดัชนี bowtie2

เรื่องย่อ

bowtie2-ตรวจสอบ [ตัวเลือก]*

DESCRIPTION

Bowtie 2 เวอร์ชั่น 2.2.6 โดย Ben Langmead ([ป้องกันอีเมล],www.cs.jhu.edu/~langmea)


ชื่อไฟล์ bt2 ลบส่วนท้าย .1.bt2l/.2.bt2l

โดยค่าเริ่มต้น พิมพ์บันทึก FASTA ของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่จัดทำดัชนีไปยังมาตรฐาน
ออก. กับ -n, เพียงพิมพ์ชื่อ กับ -s, เพียงพิมพ์สรุปดัชนี
พารามิเตอร์และลำดับ กับ -e, คงสีไว้ถ้ามี

OPTIONS

-a/--ข้าม
จำนวนอักขระในเอาต์พุต FASTA (ค่าเริ่มต้น: 60)

-n//-ชื่อ
พิมพ์ชื่อลำดับการอ้างอิงเท่านั้น

-s/--สรุป
พิมพ์สรุปรวม ชื่อผู้อ้างอิง ความยาว คุณสมบัติดัชนี

-e//-bt2-ref
สร้างข้อมูลอ้างอิงใหม่จาก .bt2l (ช้า รักษาสี)

-v//-verbose
เอาต์พุตแบบละเอียด (สำหรับการดีบัก)

-h/--ช่วย
พิมพ์คำอธิบายโดยละเอียดของเครื่องมือและตัวเลือกต่างๆ

--ช่วยด้วย พิมพ์ข้อความการใช้งานนี้

ใช้ bowtie2-inspect-l ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net