นี่คือคำสั่งตรวจสอบ bowtie2 ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
bowtie2-inspect - กระดาษห่อสำหรับ bowtie2-inspect-* index
เรื่องย่อ
bowtie2-ตรวจสอบ [ตัวเลือก]*
DESCRIPTION
Bowtie 2 เวอร์ชั่น 2.2.6 โดย Ben Langmead ([ป้องกันอีเมล],www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 ชื่อไฟล์ลบต่อท้าย .1.bt2/.2.bt2
โดยค่าเริ่มต้น พิมพ์บันทึก FASTA ของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่จัดทำดัชนีไปยังมาตรฐาน
ออก. กับ -n, เพียงพิมพ์ชื่อ กับ -s, เพียงพิมพ์สรุปดัชนี
พารามิเตอร์และลำดับ กับ -e, คงสีไว้ถ้ามี
OPTIONS
--ดัชนีขนาดใหญ่
บังคับตรวจสอบดัชนี 'ใหญ่' แม้ว่าจะมีดัชนี 'เล็ก' อยู่ก็ตาม
-a/--ข้าม
จำนวนอักขระในเอาต์พุต FASTA (ค่าเริ่มต้น: 60)
-n//-ชื่อ
พิมพ์ชื่อลำดับการอ้างอิงเท่านั้น
-s/--สรุป
พิมพ์สรุปรวม ชื่อผู้อ้างอิง ความยาว คุณสมบัติดัชนี
-e//-bt2-ref
สร้างข้อมูลอ้างอิงใหม่จาก .bt2 (ช้า รักษาสี)
-v//-verbose
เอาต์พุตแบบละเอียด (สำหรับการดีบัก)
-h/--ช่วย
พิมพ์คำอธิบายโดยละเอียดของเครื่องมือและตัวเลือกต่างๆ
--ช่วยด้วย พิมพ์ข้อความการใช้งานนี้
ใช้ bowtie2 ตรวจสอบออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
