นี่คือคำสั่ง fastaq-add_indels ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
fastaq_add_indels - ลบหรือแทรกฐานที่ตำแหน่งที่กำหนด
DESCRIPTION
การใช้งาน: fastaq_add_indels [ตัวเลือก]
ลบหรือแทรกฐานที่ตำแหน่งที่กำหนด
ตำแหน่ง ข้อโต้แย้ง:
infile ชื่อไฟล์อินพุต
ออกจากไฟล์
ชื่อของไฟล์เอาต์พุต
ไม่จำเป็น ข้อโต้แย้ง:
-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก
-d ชื่อ:เริ่มต้น:ฐาน, --ลบ ชื่อ:เริ่มต้น:ฐาน
ลบฐานที่กำหนดออกจากลำดับที่กำหนด รูปแบบเหมือนกับมุมมอง samtools:
ชื่อ:เริ่มต้น-สิ้นสุด. ตัวเลือกนี้สามารถใช้ได้หลายครั้ง (หนึ่งครั้งสำหรับแต่ละภูมิภาคถึง
ลบ). พิกัดที่ทับซ้อนกันจะถูกรวมเข้าด้วยกันก่อนที่จะลบ
--delete_range พี สตาร์ท สเต็ป
ลบฐานเริ่มต้นที่ตำแหน่ง P ในแต่ละลำดับของไฟล์อินพุต ลบ
start + (n-1)*step base จากลำดับที่ n
-i ชื่อ:เริ่มต้น:ฐาน, --แทรก ชื่อ:เริ่มต้น:ฐาน
แทรกสตริงฐานแบบสุ่มในตำแหน่งที่กำหนด รูปแบบคือ
ชื่อ:ตำแหน่ง:หมายเลข_to_add. ฐานจะถูกเพิ่มหลังจากตำแหน่ง ตัวเลือกนี้สามารถ
ใช้หลายครั้ง
--insert_range พี สตาร์ท สเต็ป
แทรกฐานสุ่มโดยเริ่มจากตำแหน่ง P ในแต่ละลำดับของไฟล์อินพุต
แทรก start + (n-1)*step base ลงในลำดับ n
ใช้ fastaq-add_indels ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
