นี่คือคำสั่ง gmx-eneconv ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gmx-eneconv - แปลงไฟล์พลังงาน
เรื่องย่อ
gmx อีเนคอนวี [-f [<.edr> -] [-o [<.edr>]] [-b ] [-e ]
[-dt ] [- ชดเชย ] [-[ไม่มี]ตั้งเวลา] [-[ไม่] sort]
[-[ไม่]rmdh] [-สเกลแฟก ] [-[ไม่มี]ข้อผิดพลาด]
DESCRIPTION
กับ หลาย ไฟล์ ที่กำหนดไว้สำหรับ -f ตัวเลือก:
เชื่อมไฟล์พลังงานหลายๆ ไฟล์ตามลำดับการจัดเรียง ในกรณีของกรอบเวลาสองเท่า
ใช้หนึ่งในไฟล์ในภายหลัง โดยระบุ -ตั้งเวลา คุณจะถูกถามถึงเวลาเริ่มต้น
ของแต่ละไฟล์ ไฟล์อินพุตถูกนำมาจากบรรทัดคำสั่ง เช่น คำสั่ง GMX
อีเนคอน -f *.เอ็ด -o คงที่.edr ควรทำเคล็ดลับ
กับ หนึ่ง ไฟล์ ระบุไว้สำหรับ -f:
อ่านไฟล์พลังงานหนึ่งไฟล์และเขียนอีกไฟล์หนึ่งโดยใช้ -dt, - ชดเชย, -t0 และ -ตั้งเวลา
ตัวเลือกและแปลงเป็นรูปแบบอื่นหากจำเป็น (ระบุโดยนามสกุลไฟล์)
-ตั้งเวลา ถูกนำไปใช้ก่อนจากนั้น -dt/- ชดเชย ตามมาด้วย -b และ -e เพื่อเลือกเฟรม
เขียน.
OPTIONS
ตัวเลือกในการระบุไฟล์อินพุต:
-f [<.edr> - (ener.edr)
ไฟล์พลังงาน
ตัวเลือกเพื่อระบุไฟล์เอาต์พุต:
-o [<.edr>] (fixed.edr)
ไฟล์พลังงาน
ตัวเลือกอื่น:
-b (-1)
ครั้งแรกที่ใช้
-e (-1)
ครั้งสุดท้ายที่ใช้
-dt (0)
เขียนเฉพาะเฟรมเมื่อ t MOD dt = offset
- ชดเชย (0)
ชดเชยเวลาสำหรับ -dt ตัวเลือก
-[ไม่มี]ตั้งเวลา (ไม่มี)
เปลี่ยนเวลาเริ่มต้นแบบโต้ตอบ
-[ไม่] sort (ใช่)
จัดเรียงไฟล์พลังงาน (ไม่ใช่เฟรม)
-[ไม่]rmdh (ไม่มี)
ลบข้อมูลบล็อกพลังงานฟรี
-สเกลแฟก (1)
คูณส่วนประกอบพลังงานด้วยปัจจัยนี้
-[ไม่มี]ข้อผิดพลาด (ใช่)
หยุดข้อผิดพลาดในไฟล์
ที่รู้จักกัน ประเด็น
· เมื่อรวมวิถี sigma และ E^2 (ที่จำเป็นสำหรับสถิติ) จะไม่อัปเดต
อย่างถูกต้อง พลังงานที่แท้จริงเท่านั้นที่ถูกต้อง หนึ่งจึงต้องคำนวณสถิติใน
วิธีอื่น
ใช้ gmx-eneconv ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
