นี่คือคำสั่ง indigo-cano ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
indigo-cano - สร้าง Canonical SMILES หรือโค้ดเลเยอร์สำหรับโมเลกุลในรูปแบบ MOL หรือ SDF
เรื่องย่อ
คราม-คาโน ชื่อไฟล์.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [พารามิเตอร์]
คราม-คาโน - ยิ้ม [พารามิเตอร์]
DESCRIPTION
คราม-คาโน ใช้เพื่อสร้าง Canonical SMILES หรือโค้ดเลเยอร์สำหรับโมเลกุลใน MOL หรือ
รูปแบบ SDF
OPTIONS
คราม-คาโน ต้องการไฟล์หรือรหัส SMILES บนอินพุตมาตรฐาน ซึ่งอาจเป็น
ตามด้วยพารามิเตอร์ต่อไปนี้อย่างน้อยหนึ่งรายการ
-ยิ้ม
เอาต์พุต Canonical SMILES (ค่าเริ่มต้น)
-ชั้น
เอาต์พุตรหัสเลเยอร์ที่เป็นที่ยอมรับ
-NS
ฟิลด์ ID พร้อมชื่อที่ระบุในไฟล์ SDF
-ไม่มีกลิ่น
ไม่ทำให้เกิดอะโรมาติกโมเลกุล
-ไม่มีจัตุรมุข
ละเว้น stereocenters จัตุรมุข
-ไม่มีซิสทรานส์
ละเว้นข้อมูลพันธบัตร cis-trans
ตัวอย่าง
คราม-คาโน infile.sdf
คราม-คาโน infile.sdf.gz -NS โมลเรกโน > result.txt
คราม-คาโน infile.smi -ชั้น -ไม่มีซิสทรานส์
คราม-คาโน - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
ใช้ indigo-cano ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
