นี่คือคำสั่ง masai_output_pe ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
masai_output_pe - เอาต์พุต Masai - โหมดสิ้นสุดที่จับคู่
เรื่องย่อ
masai_output_pe [ตัวเลือก]
DESCRIPTION
Masai เป็นเครื่องอ่านแผนที่ที่รวดเร็วและแม่นยำโดยอิงจากเมล็ดพืชโดยประมาณและหลายรายการ
ย้อนรอย
ดู http://www.seqan.de/projects/masai สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม
(c) ลิขสิทธิ์ 2011-2012 โดย Enrico Siragusa
-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้
--รุ่น
แสดงข้อมูลเกี่ยวกับรุ่น
ตัวเลือกการจับคู่:
-ง, --ไม่มีช่องว่าง
อย่าจัดแนวการอ่านที่มีช่องว่าง
-NS, --library-ความยาว NUM
ความยาวของห้องสมุด ค่าเริ่มต้น: 220
-NS, --library-ข้อผิดพลาด NUM
ความทนทานต่อความยาวของไลบรารี ค่าเริ่มต้น: 50
ตัวเลือกเอาต์พุต:
-t, --tmp-โฟลเดอร์ STR
ระบุโฟลเดอร์ชั่วคราวขนาดใหญ่ ค่าเริ่มต้น: ใช้โฟลเดอร์จีโนม
-o, --output-ไฟล์ ไฟล์
ระบุไฟล์เอาต์พุต ค่าเริ่มต้น: ใช้คำนำหน้าชื่อไฟล์ที่อ่าน ประเภทไฟล์ที่ถูกต้อง
คือ: ดิบและแซม
-nc, --ไม่มีซิการ์
ห้ามส่งออกสตริง CIGAR สิ่งนี้มีผลกับเอาต์พุต SAM เท่านั้น
ตัวเลือกการดีบัก:
-NS, --ไม่มีการถ่ายโอนข้อมูล
อย่าทิ้งผลลัพธ์
VERSION
เวอร์ชัน masai_output_pe: 0.7.1 [14053] อัปเดตล่าสุด 2013-05-16
ใช้ masai_output_pe ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
