EnglishFrenchGermanItalianPortugueseRussianSpanish

ไอคอน Fav ของ OnWorks

maskseqe - ออนไลน์ในคลาวด์

เรียกใช้ maskseqe ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks ผ่าน Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

นี่คือคำสั่ง maskseqe ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

โครงการ:

ชื่อ


maskseq - เขียนลำดับด้วยขอบเขตที่ปิดบัง

เรื่องย่อ


maskseq -ลำดับ ลำดับ -ภูมิภาค พิสัย [-tolower ข้อศอก] -maskchar เชือก
-outseq seqout

maskseq -ช่วยด้วย

DESCRIPTION


maskseq เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "แก้ไข"

OPTIONS


อินพุต ส่วน
-ลำดับ ลำดับ

ต้อง ส่วน
-ภูมิภาค พิสัย
ภูมิภาคที่จะปิดบัง ชุดของภูมิภาคถูกกำหนดโดยชุดของตำแหน่งคู่ NS
ตำแหน่งเป็นจำนวนเต็ม คั่นด้วยอักขระที่ไม่ใช่ตัวเลขและไม่ใช่อัลฟา
ตัวอย่างของข้อกำหนดเฉพาะของภูมิภาค ได้แก่ 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99

เพิ่มเติม ส่วน
-tolower ข้อศอก
ภูมิภาคสามารถ 'ปิดบัง' โดยการแปลงอักขระลำดับเป็นตัวพิมพ์เล็กบางส่วน
โปรแกรมที่ไม่ใช่ EMBOSS เช่น fasta สามารถตีความสิ่งนี้ว่าเป็นพื้นที่ปิดบัง ลำดับคือ
ไม่เปลี่ยนแปลงยกเว้นกรณีเปลี่ยน คุณอาจต้องการให้แน่ใจว่าลำดับทั้งหมด
เป็นตัวพิมพ์ใหญ่ก่อนที่จะปิดบังภูมิภาคที่ระบุเป็นตัวพิมพ์เล็กโดยใช้
ธง '-อาหารค่ำ' ค่าเริ่มต้น: N

-maskchar เชือก
ตัวละครที่จะใช้ในการปิดบัง ค่าเริ่มต้นคือ 'X' สำหรับลำดับโปรตีน 'N' สำหรับนิวคลีอิก
ลำดับ หากตั้งค่าอักขระตัวพรางเป็นอักขระ SPACE หรืออักขระ null
จากนั้นลำดับจะถูก 'ปิดบัง' โดยเปลี่ยนเป็นตัวพิมพ์เล็ก เช่นเดียวกับ with
ธง '-ตัวพิมพ์เล็ก' ค่าเริ่มต้น: @($(acdprotein)?X:N)

เอาท์พุต ส่วน
-outseq seqout

ใช้ maskseqe ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net


Ad


Ad

โปรแกรมออนไลน์ Linux และ Windows ล่าสุด