EnglishFrenchGermanItalianPortugueseRussianSpanish

ไอคอน Fav ของ OnWorks

mipe2dbSTS - ออนไลน์ใน Cloud

เรียกใช้ mipe2dbSTS ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks ผ่าน Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

นี่คือคำสั่ง mipe2dbSTS ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

โครงการ:

ชื่อ


mipe2dbSTS.pl - สร้างไฟล์อินพุตเพื่อส่งไปยัง dbSTS
รวมอยู่ในผลลัพธ์: ส่วน STS ของการส่ง dbSTS
ตาม MIPE เวอร์ชัน v1.1
อาร์กิวเมนต์: * mipe_file
* ไฟล์ปรับแต่ง
* (ไม่บังคับ) รายการ PCR IDs

ไฟล์ปรับแต่งประกอบด้วยบรรทัดที่มีคีย์และค่า โดยคั่นด้วยเครื่องหมายเท่ากับ ('=')
คีย์ประกอบด้วยชื่อตัวพิมพ์เล็กของไฟล์ส่ง NCBI (ดูเว็บไซต์ dbSTS) ตามด้วย
ขีดล่างและชื่อตัวพิมพ์เล็กของฟิลด์ในไฟล์นั้น
ควรกำหนดฟิลด์ต่อไปนี้ในไฟล์ปรับแต่ง:
pub_title=
pub_authors=
source_name=
source_organism=
cont_name=
cont_fax=
cont_tel=
cont_email=
cont_lab=
cont_inst=
cont_addr=
protocol_name=
protocol_protocol=
buffer_name=
buffer_buffer=
sts_pcr_profile=
สำหรับ protocol_protocol, buffer_buffer และ sts_pcr_profile จำเป็นต้องมีบรรทัดเพิ่มเติม (ดูตัวอย่าง)

ตัวอย่างของไฟล์ปรับแต่งมีลักษณะดังนี้:
pub_title=การทำแผนที่ทางพันธุกรรมของไก่ SNPs
pub_authors=Aerts,JA; วีเนนดาล, ต.; ครอยจ์มันส์,RPMA; โกรเนน,MAM
source_name=DNA จีโนมไก่
source_organism=กางเกงชั้นใน
cont_name=Jan Aerts
cont_fax=+31 317 483929
cont_tel=+31 317 483397
cont_email=jan.aerts@wur.nl
cont_lab=กลุ่มเพาะพันธุ์สัตว์และจีโนม
cont_inst=มหาวิทยาลัยวาเกนนิงเงน
cont_addr=PO Box 338, 6700 AH Wageningen, เนเธอร์แลนด์
protocol_name=Protocol_Aerts
protocol_protocol=แม่แบบ: 30-60 ng
protocol_protocol=ไพรเมอร์: แต่ละ 4 uM
protocol_protocol=dNTPs: แต่ละ 200 uM
protocol_protocol=Taq: 0.3 หน่วย
protocol_protocol=ปริมาตร: 12 ul
buffer_name=บัฟเฟอร์_Aerts
buffer_buffer=MgCl2: 1.5 mM
buffer_buffer=(NH4)2SO4: 20 mM
buffer_buffer=ทริส-HCl: 75 mM
buffer_buffer=ทวี 20: 0.01% (w/v)
buffer_buffer=pH: 8.8

ใช้ mipe2dbSTS ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net


Ad


Ad

โปรแกรมออนไลน์ Linux และ Windows ล่าสุด