GenOO-HTS ที่จะทำงานใน Linux ดาวน์โหลดออนไลน์สำหรับ Linux

นี่คือแอป Linux ชื่อ GenOO-HTS เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น genoo-code-2013_04_18.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ภาพหน้าจอ

GenOO-HTS เพื่อรันบน Linux ออนไลน์

DESCRIPTION

GenOO-HTS [jee-noo] เป็นโอเพ่นซอร์ส กรอบงาน Perl เชิงวัตถุที่พัฒนาขึ้นโดยเฉพาะสำหรับการออกแบบเครื่องมือวิเคราะห์ลำดับปริมาณงานสูง (HTS) เป้าหมายหลักของ GenOO-HTS คือการทำให้การวิเคราะห์ HTS ง่าย ๆ สามารถวิเคราะห์ได้ง่ายและซับซ้อน GenOO-HTS จำลองเอนทิตีทางชีววิทยาเป็นอ็อบเจ็กต์ Perl และจัดเตรียมแอตทริบิวต์และวิธีการที่เกี่ยวข้อง ซึ่งช่วยให้สามารถจัดการข้อมูลการจัดลำดับปริมาณงานสูงได้ การใช้ GenOO-HTS เป็นโมดูลการพัฒนาหลักช่วยลดค่าใช้จ่ายและความซับซ้อนในการจัดการข้อมูลและเอนทิตีทางชีววิทยาที่อยู่ในมือ GenOO-HTS ได้รับการออกแบบให้มีความยืดหยุ่น ขยายได้ง่ายด้วยโครงสร้างแบบแยกส่วน และข้อกำหนดขั้นต่ำสำหรับเครื่องมือและไลบรารีภายนอก

คุณสมบัติ

• จัดระเบียบเอนทิตีทางชีววิทยาเป็นวัตถุ Perl (บริเวณจีโนม ยีน การถอดเสียง อินตรอน/เอ็กซอน ฯลฯ)
• จัดระเบียบเอนทิตีการจัดลำดับเป็นวัตถุ/แอตทริบิวต์ Perl (การอ่านลำดับ การจัดตำแหน่ง ฯลฯ)
• ทำให้ I/O จากรูปแบบไฟล์ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายเป็นเรื่องง่าย (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
• มีความสม่ำเสมอและขยายได้ง่าย

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย นักพัฒนา

ภาษาโปรแกรม

Perl

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/genoo/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา