locusvu ที่จะทำงานใน Linux ดาวน์โหลดออนไลน์สำหรับ Linux

นี่คือแอป Linux ชื่อ locusvu เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ LocusVu.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ภาพหน้าจอ

locusvu เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์

DESCRIPTION

LocusVu เป็นเครื่องมือซอฟต์แวร์ที่ใช้ Java แบบใหม่ที่ยอมรับรายการของ genomic loci (ตำแหน่งบนโครโมโซม) เป็นอินพุตและดึงข้อมูลที่เกี่ยวข้องโดยอัตโนมัติ (แถบพันธุกรรม ชื่อยีน ข้อมูล OMIM เป็นต้น) จากฐานข้อมูลสาธารณะ เช่น เบราว์เซอร์จีโนม UCSC ฐานข้อมูล จากนั้นจึงเปิดใช้งานเวิร์กโฟลว์หลายรายการในผลลัพธ์ที่ดึงมา เช่น การเปรียบเทียบชุดข้อมูลหลายชุด (จีโนมเปรียบเทียบ) การดูยีนที่อยู่ใกล้เคียงสำหรับตำแหน่งจากภายในเครื่องมือ หรือการแสดงผลลัพธ์เหล่านี้ในแผนภูมิแท่ง/แผนภูมิวงกลม LocusVu มี GUI ที่ใช้งานง่ายบนฟรอนต์เอนด์ ซึ่งช่วยให้ผู้ใช้สามารถโต้ตอบกับตรรกะพื้นฐานได้อย่างง่ายดาย
สามารถขยายเครื่องมือเพื่อเพิ่มการรองรับฐานข้อมูลอื่นๆ (เช่น Ensembl) หรือดึงข้อมูลได้อย่างง่ายดาย
จากตารางอื่นๆ ในฐานข้อมูล ดังนั้น LocusVu จึงมีเฟรมเวิร์กพื้นฐานที่ผู้ใช้และนักพัฒนาสามารถใช้ในการทำให้เวิร์กโฟลว์ที่มีอยู่ง่ายขึ้นและสร้างเวิร์กโฟลว์ใหม่เพื่อรองรับการวิเคราะห์ข้อมูลในจีโนม

คุณสมบัติ

• ดึงข้อมูลจากฐานข้อมูลโดยอัตโนมัติ (ปัจจุบันคือฐานข้อมูลเบราว์เซอร์จีโนม UCSC)
• เปิดใช้งานเวิร์กโฟลว์กับผลลัพธ์ที่ดึงมาเช่น..
• ..เปรียบเทียบชุดข้อมูลหลายชุด (จีโนมเปรียบเทียบ)
• ..ดูยีนข้างเคียงสำหรับโลคัส (จากภายในเครื่องมือเอง)
• ..กราฟิกแสดงผลลัพธ์ (แผนภูมิแท่ง / แผนภูมิวงกลม)
• GUI ที่ใช้งานง่ายในส่วนหน้าสำหรับการใช้งานที่เป็นธรรมชาติ
• การบันทึกด้วย Log4j เพื่อการดีบักที่ง่ายดาย
• ขยายได้อย่างง่ายดาย

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย นักพัฒนา

ส่วนติดต่อผู้ใช้

ชวา สวิง

ภาษาโปรแกรม

ชวา

สภาพแวดล้อมฐานข้อมูล

MySQL

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/locusvu/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา