นี่คือแอป Linux ชื่อ locusvu เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ LocusVu.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า locusvu เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
locusvu เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์
DESCRIPTION
LocusVu เป็นเครื่องมือซอฟต์แวร์ที่ใช้ Java แบบใหม่ที่ยอมรับรายการของ genomic loci (ตำแหน่งบนโครโมโซม) เป็นอินพุตและดึงข้อมูลที่เกี่ยวข้องโดยอัตโนมัติ (แถบพันธุกรรม ชื่อยีน ข้อมูล OMIM เป็นต้น) จากฐานข้อมูลสาธารณะ เช่น เบราว์เซอร์จีโนม UCSC ฐานข้อมูล จากนั้นจึงเปิดใช้งานเวิร์กโฟลว์หลายรายการในผลลัพธ์ที่ดึงมา เช่น การเปรียบเทียบชุดข้อมูลหลายชุด (จีโนมเปรียบเทียบ) การดูยีนที่อยู่ใกล้เคียงสำหรับตำแหน่งจากภายในเครื่องมือ หรือการแสดงผลลัพธ์เหล่านี้ในแผนภูมิแท่ง/แผนภูมิวงกลม LocusVu มี GUI ที่ใช้งานง่ายบนฟรอนต์เอนด์ ซึ่งช่วยให้ผู้ใช้สามารถโต้ตอบกับตรรกะพื้นฐานได้อย่างง่ายดายสามารถขยายเครื่องมือเพื่อเพิ่มการรองรับฐานข้อมูลอื่นๆ (เช่น Ensembl) หรือดึงข้อมูลได้อย่างง่ายดาย
จากตารางอื่นๆ ในฐานข้อมูล ดังนั้น LocusVu จึงมีเฟรมเวิร์กพื้นฐานที่ผู้ใช้และนักพัฒนาสามารถใช้ในการทำให้เวิร์กโฟลว์ที่มีอยู่ง่ายขึ้นและสร้างเวิร์กโฟลว์ใหม่เพื่อรองรับการวิเคราะห์ข้อมูลในจีโนม
คุณสมบัติ
- ดึงข้อมูลจากฐานข้อมูลโดยอัตโนมัติ (ปัจจุบันคือฐานข้อมูลเบราว์เซอร์จีโนม UCSC)
- เปิดใช้งานเวิร์กโฟลว์กับผลลัพธ์ที่ดึงมาเช่น..
- ..เปรียบเทียบชุดข้อมูลหลายชุด (จีโนมเปรียบเทียบ)
- ..ดูยีนข้างเคียงสำหรับโลคัส (จากภายในเครื่องมือเอง)
- ..กราฟิกแสดงผลลัพธ์ (แผนภูมิแท่ง / แผนภูมิวงกลม)
- GUI ที่ใช้งานง่ายในส่วนหน้าสำหรับการใช้งานที่เป็นธรรมชาติ
- การบันทึกด้วย Log4j เพื่อการดีบักที่ง่ายดาย
- ขยายได้อย่างง่ายดาย
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย นักพัฒนา
ส่วนติดต่อผู้ใช้
ชวา สวิง
ภาษาโปรแกรม
ชวา
สภาพแวดล้อมฐานข้อมูล
MySQL
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/locusvu/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา