นี่คือแอป Linux ชื่อ miRDP2 เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น miRDP2-v1.1.4.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ miRDP2 เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
miRDP2 เพื่อรันบน Linux ออนไลน์
Ad
DESCRIPTION
miRDeep-P2 (miRDP2) ได้รับการพัฒนาเพื่อวิเคราะห์การถอดรหัส microRNAs (miRNAs) ในพืชได้อย่างแม่นยำและรวดเร็ว มันถูกนำมาใช้จาก miRDeep-P (miRDP) ด้วยกลยุทธ์ใหม่และอัลกอริธึมที่ยกเครื่องใหม่ เราได้ทดสอบ miRDP2 เพื่อวิเคราะห์การถอดรหัส miRNA ในพืชดังกล่าวโดยค่อยๆ เพิ่มขนาดจีโนม เช่น Arabidopsis ข้าว มะเขือเทศ ข้าวโพด และข้าวสาลี เมื่อเทียบกับ miRDeep-P และเครื่องมือคำนวณอื่นๆ หลายตัว miRDP2 ประมวลผลข้อมูล NGS ด้วยความเร็วที่เหนือกว่า ด้วยการรวมเกณฑ์คำอธิบายประกอบของ miRNA ของพืชที่อัปเดตใหม่ ความแม่นยำของ miRDP2 ก็ดีขึ้นอย่างเห็นได้ชัดเช่นกัน ผลลัพธ์ของเราแสดงให้เห็นว่า miRDP2 เป็นเครื่องมือที่รวดเร็วและแม่นยำในการวิเคราะห์การถอดรหัส miRNA ในพืชอ้างอิง: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
คุณสมบัติ
- RNA ขนาดเล็ก
- ไมโครอาร์เอ็นเอ (ไมอาร์เอ็นเอ)
- ลำดับรุ่นต่อไป (NGS)
- Perl
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
Perl
สภาพแวดล้อมฐานข้อมูล
เพิร์ล DBI/DBD
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/mirdp2/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา