āļāļĩāđāļāļ·āļāđāļāļ Linux āļāļ·āđāļ SecStAnT āđāļāļ·āđāļāļāļģāļāļēāļāđāļ Linux āļāļāļāđāļĨāļāđ āļāļķāđāļāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāļĢāļļāđāļāļĨāđāļēāļŠāļļāļāđāļāđāļ SecStAnT.jar āļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāļāļāļāđāļĨāļāđāđāļ OnWorks āļāļđāđāđāļŦāđāļāļĢāļīāļāļēāļĢāđāļŪāļŠāļāđāļāļĢāļĩāļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāđāļ§āļīāļĢāđāļāļŠāđāļāļāļąāļ
āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļĨāļ°āđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļāļāļĩāđāļāļēāļāļāļāļāđāļĨāļāđāļāļĩāđāļāļ·āđāļāļ§āđāļē SecStAnT āđāļāļ·āđāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļ Linux āļāļāļāđāļĨāļāđāļāđāļ§āļĒ OnWorks āļāļĢāļĩ
āļāļģāļāļēāļĄāļāļģāđāļāļ°āļāļģāđāļŦāļĨāđāļēāļāļĩāđāđāļāļ·āđāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļāļāļĩāđ:
- 1. āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāđāļāļāļĩāđāđāļāļāļĩāļāļĩāļāļāļāļāļļāļ
- 2. āđāļāđāļēāđāļāļāļĩāđ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āļāđāļ§āļĒāļāļ·āđāļāļāļđāđāđāļāđāļāļĩāđāļāļļāļāļāđāļāļāļāļēāļĢ
- 3. āļāļąāļāđāļŦāļĨāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāļāļāļĩāđāđāļāļāļąāļ§āļāļąāļāļāļēāļĢāđāļāļĨāđāļāļąāļāļāļĨāđāļēāļ§
- 4. āđāļĢāļīāđāļĄāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄāļāļģāļĨāļāļāļāļāļāđāļĨāļāđāļāļāļ OnWorks Linux āļŦāļĢāļ·āļ Windows āļāļāļāđāļĨāļāđ āļŦāļĢāļ·āļāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄāļāļģāļĨāļāļāļāļāļāđāļĨāļāđ MACOS āļāļēāļāđāļ§āđāļāđāļāļāđāļāļĩāđ
- 5. āļāļēāļ OnWorks Linux OS āļāļļāļāđāļāļīāđāļāđāļĢāļīāđāļĄāļāđāļ āđāļāļāļĩāđāļāļąāļ§āļāļąāļāļāļēāļĢāđāļāļĨāđāļāļāļāđāļĢāļē https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āļāļĢāđāļāļĄāļāļ·āđāļāļāļđāđāđāļāđāļāļĩāđāļāļļāļāļāđāļāļāļāļēāļĢ
- 6. āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāđāļ āļāļīāļāļāļąāđāļ āđāļĨāļ°āđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđ
āļ āļēāļāļŦāļāđāļēāļāļ
Ad
SecStAnT āđāļāļ·āđāļāļāļģāļāļēāļāđāļ Linux āļāļāļāđāļĨāļāđ
DESCRIPTION
SecStAnT āđāļāđāļāđāļāļĢāļ·āđāļāļāļĄāļ·āļāļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāļāļēāļĢāļŠāļĢāđāļēāļāļāļļāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļāļāđāļāļĢāļāļŠāļĢāđāļēāļāđāļāļĒāļāļąāļāđāļāļĄāļąāļāļīāļāļēāļ Protein Data Bank (PDB) āļāļĢāđāļāļĄāļāļāļāđāļāļĢāļ°āļāļāļāđāļāļĢāļāļŠāļĢāđāļēāļāļāļĩāđāļāļđāđāđāļāđāļāļģāļŦāļāļ āđāļĨāļ°āļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāļāļēāļĢāļāļģāļāļ§āļāļāļēāļĢāđāļāļāđāļāļāļāļąāļ§āđāļāļĢāļ āļēāļĒāđāļSecStAnT āļŠāļēāļĄāļēāļĢāļ
1. āđāļĨāļ·āļāļāļāļēāļāļāļļāļāļāđāļāļĄāļđāļĨ PDB āļāļāļāđāļāļĢāļāļŠāļĢāđāļēāļāļāļēāļĄāđāļāļĢāļāļŠāļĢāđāļēāļāļĢāļāļāļāļĩāđāļāļđāđāđāļāđāļĢāļ°āļāļļ (āļāļģāļŦāļāļāļāļēāļĄāļāļēāļĢāļāļģāđāļāļāļāļĢāļ°āđāļ āļ PDB āļ āļēāļĒāđāļāļŦāļĢāļ·āļāļāļēāļĄ DSSP) āđāļĨāļ°/āļŦāļĢāļ·āļāļĨāļģāļāļąāļāđāļĢāļāļāļđāļāđāļ
2. āļŠāļĢāđāļēāļāļāļļāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļĩāđāļĢāļ°āļāļąāļāļāļ§āļēāļĄāļĨāļ°āđāļāļĩāļĒāļāļāđāļēāļāļāļąāļ (āļāļ°āļāļāļĄāļāļąāđāļāļŦāļĄāļ āđāļāļāļŦāļĨāļąāļāđāļāđāļēāļāļąāđāļ āđāļāļāļēāļ° CÎą, ...)
3. āļāļĢāļ°āđāļĄāļīāļāļāļēāļĢāđāļāļāđāļāļāļāļēāļāļŠāļāļīāļāļīāļāļāļāļāļąāļ§āđāļāļĢāļ āļēāļĒāđāļ:
āļ. āļāļēāļĢāđāļāļāđāļāļāļāļąāļ§āđāļāļĢāđāļāļĩāđāļĒāļ§ (āļĢāļ§āļĄāļāļķāļāļāļ§āļēāļĄāđāļāļĩāđāļĒāļ§āļāđāļāļāļĄāļēāļāļāļĩāđāļŠāļļāļāđāļāļāļēāļĢāđāļāļāļāđāļēāļāļ°āļāļāļĄāļĄāļīāļ āđāļāđāļ PHI āđāļĨāļ° PSI āđāļĨāļ°āļāļģāļāļ§āļāļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāļāļēāļĢāđāļāļāļāđāļē CÎą)
āļ. āļŠāļāļāļāļąāļ§āđāļāļĢāļŠāļŦāļŠāļąāļĄāļāļąāļāļāđ (āļĢāļ§āļĄāļāļķāļāđāļāļāļāļĩāđ PHI-PSI Ramachandran āđāļĨāļ°āđāļāļĩāļĒāļāđāļāđāļēāđāļāļāļēāļĢāđāļāļāļāđāļē CÎą)
āļ. āļŠāļēāļĄāļāļąāļ§āđāļāļĢāļŠāļŦāļŠāļąāļĄāļāļąāļāļāđ
āļŠāđāļ§āļāļāļīāļāļāđāļāļāļđāđāđāļāđ
āļāļ§āļē āļŠāļ§āļīāļ
āļ āļēāļĐāļēāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄ
āļāļ§āļē
āļāļĩāđāļāļ·āļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāļāļāļĩāđāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļķāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļēāļ https://sourceforge.net/projects/secstant/ āļĄāļĩāļāļēāļĢāđāļŪāļŠāļāđāđāļ OnWorks āđāļāļ·āđāļāđāļŦāđāļāļģāļāļēāļāļāļāļāđāļĨāļāđāđāļāļ§āļīāļāļĩāļāļĩāđāļāđāļēāļĒāļāļĩāđāļŠāļļāļāļāļēāļāļŦāļāļķāđāļāđāļāļĢāļ°āļāļāļāļāļīāļāļąāļāļīāļāļēāļĢāļāļĢāļĩāļāļāļāđāļĢāļē