นี่คือแอป Windows ชื่อ kSNP ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น kSNP4.1-source-code.zip สามารถทำงานออนไลน์ได้ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ kSNP พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
เคเอสเอ็นพี
Ad
DESCRIPTION
kSNP4 ระบุ SNP ของแพนจีโนมในชุดของลำดับจีโนม และประมาณค่าต้นไม้สายวิวัฒนาการตาม SNP เหล่านั้น การค้นพบ SNP ขึ้นอยู่กับการวิเคราะห์ k-mer และไม่จำเป็นต้องจัดลำดับหลายลำดับหรือเลือกจีโนมอ้างอิง ดังนั้น kSNP4 จึงสามารถรับจีโนมของจุลินทรีย์ 100 รายการเป็นอินพุตได้ ตำแหน่ง SNP ถูกกำหนดโดยโอลิโกที่มีความยาว k ล้อมรอบอัลลีล SNP ส่วนกลาง kSNP4 สามารถวิเคราะห์ทั้งจีโนมที่สมบูรณ์ (เสร็จแล้ว) และจีโนมที่ยังไม่เสร็จใน contig ที่ประกอบขึ้นหรือการอ่านแบบดิบที่ยังไม่ได้ประกอบ สามารถวิเคราะห์จีโนมที่เสร็จแล้วและยังไม่เสร็จร่วมกันได้ และ kSNP สามารถดาวน์โหลดไฟล์ Genbank ของจีโนมที่เสร็จแล้วได้โดยอัตโนมัติ และรวมข้อมูลในไฟล์เหล่านั้นไว้ในคำอธิบายประกอบ SNP
ไม่จำเป็นต้องมีทักษะการเขียนโปรแกรมเพื่อใช้ kSNP4
การ์ดเนอร์ SN และฮอลล์ บีจี 2013 . โปรดหนึ่ง 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
การ์ดเนอร์, SN, T. Slezak และบีจี ฮอลล์ 2015 ชีวสารสนเทศศาสตร์ 31: 2877-2878 ดอย: 10.1093/ชีวสารสนเทศศาสตร์/btv271
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/ksnp/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
