Ito ang command na altree-convertp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
altree-convert - Pamagat...
SINOPSIS
altree-convert [mga opsyon]
Pagpipilian:
--bersyon na bersyon ng programa
--short-help|h maikling mensahe ng tulong
--help help message na may mga paglalarawan ng mga opsyon
--man buong dokumentasyon
--first-input-file|i input file 1
--second-input-file|j input file 2 (hindi sapilitan)
--output-file|o output file
--case-control-output|c output na naglalaman ng nb cases/controls
--data-type|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--reconstruct-prog|r PHASE|FAMHAP
--data-quali|q Uri ng data: qualitative o quantitative
--nbind-threshold|s Minimum na bilang ng mga indibidwal na nakuha upang mapanatili ang isang haplotype
Opsyon
--bersyon
I-print ang bersyon ng programa at paglabas.
--maikling-tulong
Mag-print ng maikling mensahe ng tulong at paglabas.
- Tumulong Mag-print ng mensahe ng tulong na may mga paglalarawan at paglabas ng mga opsyon.
--lalaki Ini-print ang manu-manong pahina at lalabas.
--first-input-file|i
Input file 1 (output ng haplotype reconstruction program)
--second-input-file|j
Input file 2 (pangalawang output ng famhap o file na naglalaman ng katayuan ng sakit)
--output-file|o
Output file
--case-control-output|c
Output file na naglalaman ng bilang ng mga kaso at mga kontrol na nagdadala ng bawat haplotype
--type-data|t "DNA"|"SNP"
Uri ng data: DNA (ATGCU) o SNP (0-1)
--phylo-prog|p "phylip"|"paup"
Programa sa muling pagtatayo ng phylogeny
reconstruct-prog|r "famhap|phase"
Programa sa muling pagtatayo ng Haplotype
data-quali|q "kuwalitatibo|quantitative"
Uri ng data na nasuri
nbind-threshold|s
Ang pinakamababang bilang ng mga indibidwal na may dalang haplotype ay kinakailangan upang mapanatili ito
karagdagang pagsusuri. Kung nais mong panatilihin ang lahat ng mga haplotype, dapat mong maapektuhan ang 0 dito
nagbabago
DESCRIPTION
ito programa ay babasahin ang ibinigay na input file (mga) at bubuo ng input file para sa
phylogenetic reconstruction software paup o phylip/paml
Gumamit ng altree-convertp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
