Ito ang command na bowtie2-inspect na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
bowtie2-inspect - wrapper para sa bowtie2-inspect-* index
SINOPSIS
bowtie2-inspeksyon [pagpipilian]*
DESCRIPTION
Bowtie 2 bersyon 2.2.6 ni Ben Langmead ([protektado ng email], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 filename minus trailing .1.bt2/.2.bt2
Bilang default, nagpi-print ng mga tala ng FASTA ng mga naka-index na pagkakasunud-sunod ng nucleotide sa pamantayan
palabas. Sa -n, nagpi-print lang ng mga pangalan. Sa -s, nagpi-print lang ng buod ng index
mga parameter at pagkakasunud-sunod. Sa -e, pinapanatili ang mga kulay kung naaangkop.
Opsyon
--malaking-index
puwersahang inspeksyon ng 'malaking' index, kahit na mayroong 'maliit'.
-a/--sa kabila
Bilang ng mga character sa output ng FASTA (default: 60)
-n/--mga pangalan
I-print lamang ang mga pangalan ng sequence ng reference
-s/--buod
I-print ang buod kasama. mga pangalan ng ref, haba, katangian ng index
-e/--bt2-ref
Buuin muli ang reference mula sa .bt2 (mabagal, pinapanatili ang mga kulay)
-v//--verbose
Verbose na output (para sa pag-debug)
-h/--tulong
i-print ang detalyadong paglalarawan ng tool at mga pagpipilian nito
- Tumulong i-print ang mensahe ng paggamit na ito
Gumamit ng bowtie2-inspect online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
