gdcm2vtk - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

gdcm2vtk - I-convert ang isang file na sinusuportahan ng VTK sa DICOM.

SINOPSIS

gdcm2vtk [mga opsyon] file-in file-out

DESCRIPTION

Ang gdcm2vtk tumatagal bilang input ng anumang file na sinusuportahan ng VTK (kabilang ang DICOM file) at kalooban
bumuo bilang output ng isang DICOM file.

MGA PARAMETERS

file-in input filename (suportado ang DICOM o VTK)

file-out output filename (suportado ang DICOM o VTK)

Opsyon

tiyak pagpipilian
--force-rescale force rescale.
--force-spacing force spacing.
--palette-color kapag sinusuportahan ay bumuo ng isang PALETTE COLOR file.
--argb kapag sinusuportahan ay bumuo ng isang ARGB file.
--compress kapag sinusuportahan ay bumuo ng isang naka-compress na file.
--use-vtkdicom Gamitin ang vtkDICOMImageReader (sa halip na GDCM).
--modality set Modality.
--lower-left set lower left.
--shift set shift.
--scale set scale.
--compress set compression (MetaIO).
-T --study-uid Study UID.
-S --serye-uid Serye UID.
--root-uid Root UID.

pagpiga pagpipilian
-J --jpeg I-compress ang imahe sa jpeg.
-K --j2k I-compress ang larawan sa j2k.
-L --jpegls I-compress ang imahe sa jpeg-ls.
-R --rle I-compress ang imahe sa rle (lossless lang).

pangkalahatan pagpipilian
-h --tulong
i-print ang text ng tulong na ito at lumabas

-v --bersyon
impormasyon ng bersyon ng pag-print at paglabas

-V --verbose
verbose mode (babala+error).

-W --babala
mode ng babala, i-print ang impormasyon ng babala

-E --mali
mode ng error, impormasyon ng error sa pag-print

-D --debug
debug mode, i-print ang impormasyon ng debug

kapaligiran nagbabago
GDCM_ROOT_UID Root UID

DESCRIPTION

I-convert ang isang file na sinusuportahan ng VTK sa DICOM.

Ang karaniwang paggamit ay:

$ gdcm2vtk inputfile output.dcm

Ginagamit nito ang panloob na mekanismo ng pabrika ng VTK upang makilala ang isang file (CanRead function). Tingnan mo
VTK supported file dito:

Anong mga format ng file ng imahe ang maaaring basahin at isulat ng VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#Anong_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Kung ang iyong input file ay may 4 na bahagi, ang ika-4 na comp (alpha) ay aalisin sa output
file bilang DICOM ay hindi na sumusuporta sa alpha component (tingnan ang –argb opsyon).

Espesyal na pangangalaga ang ginawa para sa sumusunod na format ng file:

1. DICOM: Ang mga Direction Cosine at vtkMedicalImageInformation ay ipinapasa sa output
2. BMP: Maaaring i-save ang file gamit ang Lookup Table (tingnan ang --palette-color)
3. GE Signa: Ang vtkMedicalImageProperties ay ipinasa sa output
4. MINC: Ang Direction Cosine ay ipinapasa sa output
5. TIFF: vtkTIFFReader ay kasalukuyang nasa masamang kalagayan sa VTK (iba't ibang pag-uugali sa VTK 5.2 at git/master). Gamitin lamang ito, kung alam mo ang iyong ginagawa.

CONVERT MetaImage (mhd, mha)
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

Iko-convert ng command na ito ang input na DICOM file: inputfile sa isang MetaImage .mha file. pareho
napupunta para sa .mhd file.

CONVERT MHA/MHD
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

or

$ gdcm2vtk inputfile output.mhd

Iko-convert ng command na ito ang input na DICOM file: inputfile sa isang MetaImageData .mha/.mhd
file.

CONVERT TIV
$ gdcm2vtk inputfile output.vti

Iko-convert ng command na ito ang input na DICOM file: inputfile sa isang XML VTK ImageData .vti
file.

CONVERT VTK
$ gdcm2vtk inputfile output.vtk

Iko-convert ng command na ito ang input na DICOM file: inputfile sa isang lumang VTK Structured
PointSets .vtk file.

CONVERT DICOM

$ gdcm2vtk input.dcm output.dcm

vtkGDCCMImageReader ay gagamitin upang basahin sa isang DICOM file, hindi ang default
vtkDICOMImageReader. Tingnan ang opsyon –use-vtkdicom para magamit ang vtkDICOMImageReader.

PAPUNTA AT PABALIK DICOM SA MHD SA DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 output.mhd output.dcm

Ipinapakita ng refsection sa itaas kung paano i-convert ang isang DICOM gamit ang Photometric Interpretation ng
YBR_FULL (o kahit YBR_FULL_422 ay lossy) sa isa pang format ng file: MetaImage (mhd). Since
ang format ng file na ito ay hindi humahawak ng espasyo ng kulay, kailangan nating tahasan itong itakda gamit ang
–Pagpipilian sa command line ng imageformat. Ang –modality command line na opsyon ay kinakailangan dito
kaso dahil hindi pinapayagan ng default na Secondary Capture Image Storage Class na pamilya ang YBR
Photometric Interpretasyon.

GDCM2VTK NOTA

MAHALAGANG TANDAAN: Ang panloob na VTK na nakabalangkas ay pupunan mula sa input na DICOM, at pagkatapos
ipasa sa output DICOM writer. Maaaring mawala ang ilang impormasyon sa panahon ng conversion
DICOM sa VTK sa DICOM. Ang pagpipiliang ito ay kadalasang ginagamit upang subukan ang
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter kumbinasyon.

MAHALAGANG TANDAAN: Kapag nagko-convert mula sa isang lossy na format tulad ng JPEG, ang impormasyon ng
ang pagkawala ay mahalaga. Ang output na DICOM ay naglalaman ng kinakailangang Lossy Image
Compression attribute na nagsasaad na ang imahe ay lossy-compressed sa isang lugar sa kahabaan ng
pipeline. Tingnan din ang gdcmimg (mas mahusay na paghawak ng JPEG sa pangkalahatan).

MAHALAGANG PAALALA: Kapag gumagamit ng –use-vtkdicom ang output DICOM file ay palaging isusulat bilang
MR Image Storage dahil ang impormasyong ito ay hindi makukuha mula sa mismong mambabasa. Ito ay nagpapahintulot
tamang pagtatakda ng Oryentasyon ng Larawan (Pasyente).

Gumamit ng gdcm2vtk online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net