Ito ang command na hmm2fetch na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
hmm2fetch - kumuha ng HMM mula sa isang HMM database
SINOPSIS
hmm2fetch [mga pagpipilian] database pangalan
DESCRIPTION
hmm2fetch ay isang maliit na utility na kumukuha ng tinatawag na HMM pangalan mula sa isang database ng modelo ng HMMER
tinatawag database. sa isang bagong format, at ipi-print ang modelong iyon sa karaniwang output. Halimbawa,
hmm2fetch Pfam Rmm kinukuha ang modelo ng RRM (RNA recognition motif) mula sa Pfam, kung ang
Ang environment variable na HMMERDB ay nakatakda sa lokasyon ng database ng Pfam. Ang nakuha
Ang HMM file ay nakasulat sa HMMER 2 ASCII na format.
Ang database ay dapat may kaugnay na GSI index file. Upang mag-index ng database ng HMM, gamitin ang
programa hmm2index.
Opsyon
-h Mag-print ng maikling tulong; kasama ang numero ng bersyon at buod ng lahat ng mga opsyon, kabilang ang
mga opsyon ng eksperto.
-n tagapagsalin pangalan bilang isang HMM na numero sa halip na isang pangalan. Nagsisimula ang pagnunumero sa 0. Para sa
halimbawa, upang kunin ang unang HMM mula sa isang HMM database na tinatawag foo, gagawin mo
hmm2fetch -n 0 foo.
Gamitin ang hmm2fetch online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
